[发明专利]核酸恒温同步放大检测方法及其应用有效
申请号: | 200810111479.0 | 申请日: | 2008-06-26 |
公开(公告)号: | CN101333565A | 公开(公告)日: | 2008-12-31 |
发明(设计)人: | 张常娥 | 申请(专利权)人: | 上海仁度生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 | 代理人: | 邸万杰 |
地址: | 201201上海市张江高科技*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核酸 恒温 同步 放大 检测 方法 及其 应用 | ||
1.核酸的恒温同步放大检测方法,包括以下步骤:
1)将含有下列组分的反应物混合:
a.待测核酸样品;
b.引物1:该引物的3’端可与待测核酸样品的3’端或靠近3’端处杂交,5’端为启动子序列;
c.引物2:该引物可与待测核酸样品负链的5’端杂交;
d.选自分子信标、荧光共振、蝎子探针和分子火炬中的一种或多种荧光探针;
e.RNA依赖的DNA聚合酶;
f.至少一种可以识别所述启动子序列的RNA聚合酶;
2)将反应物混合后,在密闭容器中进行恒温放大反应,并用检测仪同步检测反应体系中荧光信号的变化,根据荧光信号产生的时间和强度对样品进行定量或定性检测。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤1)中的待测核酸样品为RNA或DNA。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤1)中的启动子序列为T7启动子序列、T3启动子序列、M13启动子序列或SP6启动子序列。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤1)中的所述RNA依赖的DNA聚合酶为MMLV逆转录酶或AMV逆转录酶。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤1)中的RNA聚合酶为T7、T3、M13或SP6 RNA聚合酶。
6.根据权利要求4或5所述的方法,其特征在于:所述步骤1)中的荧光探针为分子信标,所述RNA依赖的DNA聚合酶为MMLV逆转录酶,所述RNA聚合酶为T7 RNA聚合酶。
7.根据权利要求1-6任一项所述的方法,其特征在于:所述步骤1)中的反应物分为第一阶段反应物和第二阶段酶反应物,所述第一阶段反应物中还包含有Tris、KCl、MgCl2、NTPS、dNTPs、甘油和DMSO,所述第一阶段反应物的组分具体为:10-50mM Tris,20-90mM KCl,10-50mM MgCl2,0.1-10mM NTPS,0.1-10mMdNTPs,5-40%甘油,0-25%DMSO,0.1-2μM引物1,0.1-2μM引物2,0.1-2μM荧光探针;所述第二阶段酶反应物中还包含有Tris、Triton X-100、KCl、EDTA、DTT和甘油,所述第二阶段酶反应物的组分具体为:100-9000U RNA依赖的DNA聚合酶,100-5000U RNA聚合酶,20-100mM Tris,0.1-1% Triton X-100,30-300mM KCl,0.01-0.5mM EDTA,0.1-2mM DTT,20-50%甘油。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)中的恒温放大反应条件为:先将第一阶段反应物充分混合,在55-90℃下温育2-30分钟后,再在42-55℃下温育2-30分钟,在此过程中加入第二阶段酶反应物,由此开始在42-55℃下继续温育30-120分钟,用检测仪同步记录荧光信号的变化,根据荧光信号产生的时间和强度对待测样品进行定量或定性检测;所述第一阶段反应物与第二阶段酶反应物的体积比为1-50∶1。
9.根据权利要求1-6任一项所述的方法,其特征在于:所述检测仪为AB17000、7300、7500、7700、7900系列,Stratagen MPX3000系列或Barad iQ系列。
10.一种核酸恒温同步放大检测试剂盒,包括以下作为反应物的组分:
a.待测核酸样品;
b.引物1:该引物的3’端可与待测核酸样品的3’端或靠近3’端处杂交,5’端为启动子序列;
c.引物2:该引物可与待测核酸样品负(-)链的3’端杂交;
d.选自分子信标、荧光共振、蝎子探针和分子火炬中的一种或多种荧光探针;
e.MMLV逆转录酶和AMV逆转录酶中至少一种RNA依赖的DNA聚合酶;
f.至少一种可以识别T7、T3、M13或SP6中所述启动子序列的RNA聚合酶。
11.根据权利要求10所述的试剂盒,其特征在于:所述反应物组分分为第一阶段反应物和第二阶段酶反应物,所述第一阶段反应物中还包含有Tris、KCl、MgCl2、NTPS、dNTPs、甘油和DMSO,所述第一阶段反应物的组分具体为:10-50mMTris,20-90mM KCl,10-50mM MgCl2,0.1-10mM NTPS,0.1-10mM dNTPs,5-40%甘油,0-25%DMSO,0.1-2μM权利要求1所述引物1,0.1-2μM权利要求1所述引物2,0.1-2μM分子信标;所述第二阶段酶反应物中还包含有Tris、Triton X-100、KCl、EDTA、DTT和甘油,所述第二阶段酶反应物的组分具体为:100-9000UMMLV逆转录酶,100-5000U T7 RNA聚合酶,20-100mM Tris,0.1-1%Triton X-100,30-300mM KCl,0.01-0.5mM EDTA,0.1-2mM DTT,20-50%甘油。
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