[发明专利]肺炎克雷伯菌对β-内酰胺酶耐药基因检测方法无效
申请号: | 200810121125.4 | 申请日: | 2008-09-28 |
公开(公告)号: | CN101519688A | 公开(公告)日: | 2009-09-02 |
发明(设计)人: | 钟建平;金法祥;李水法;王华均;孙小军;黄明清 | 申请(专利权)人: | 钟建平 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/02 |
代理公司: | 绍兴市越兴专利事务所 | 代理人: | 方剑宏 |
地址: | 312000浙江省绍*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺炎 克雷伯菌 内酰胺 耐药 基因 检测 方法 | ||
1、一种肺炎克雷伯菌对β-内酰胺酶耐药基因检测方法,包括以下步骤:
(1)、选择住院病人肺炎克雷伯菌菌株,全部菌株经细菌鉴定仪鉴定菌种后采样备用,
(2)、采用微量稀释法测定抗菌药物的敏感性,进行抗生素敏感性判断,
(3)、采用PCR法检测β-内酰胺酶耐药基因,并选取DNA阳性株进行测序分析,所述β-内酰胺酶耐药基因及相应引物序列为:
基因名称 引物序列
blaTEM P1:AGGAAGAGTATGATTCAACA
P2:CTCGTCGTTTGGTATGGC
blaSHV P1:TGCGCAAGCTGCTGACCAGC
P2:TTAGCG(T/C)TGCCAGTGCTCGA
blaLEN P1:ATGCGTT(A/T)T(A/G)TTCGCCTGTG
P2:GGCGCTCAGATGCTGCGC
blaOKP P1:A(A/G)GCGCTTCCCGGCGACGTG
P2:TTAGCG(T/C)TGCCAGTGCTCGA
blaCTX-M-1群 P1:ATGGTTAAAAAATCACTGCGC
P2:TCCCGACGGCTTTCCGCCTT
blaCTX-M-2群 P1:ATGATGACTCAGAGCATTCG
P2:TCCCGACGGCTTTCCGCCTT
blaCTX-M-9群 P1:CGGCCTGTATTTCGCTGTTG
P2:TCCCGACGGCTTTCCGCCTT
blaOXA-1群 P1:CTGTTGTTTGGGTTTCGCAAG
P2:CTTGGCTTTTATGCTTGATG
blaOXA-2群 P1:CAGGCGC(T/C)GTTCG(T/C)GATGAGTT
P2:GCC(T/C)TCTATCCAGTAATCGCC
blaOXA-10群 P1:GTCTTTC(A/G)AGTACGGCATTA
P2:GATTTTCTTAGCGGCAACTTA
blaPER P1:AGTCAGCGGCTTAGATA
P2:CGTATGAAAAGGACAATC
blaGES P1:ATGCGCTTCATTCACGCAC
P2:CTATTTGTCCGTGCTCAGG
blaVEB P1:GCGGTAATTTAACCAGA
P2:GCCTATGAGCCAGTGTT
blaDHA P1:AACTTTCACAGGTGTGCTGGGT
P2:CCGTACGCATACTGGCTTTGC
blaACT-1 P1:TCGGTAAAGCCGATGTTGCGG
P2:CTTCCACTGCGGCTGCCAGTT。
2、如权利要求1所述的一种肺炎克雷伯菌对β-内酰胺酶耐药基因检测方法,其特征在于:所述的基因的检测中,各靶基因PCR扩增体系均为:每反应体系P1、P2引物各0.5μM,dNTPs200各mM,KCl 10mM,(NH4)2SO4 8mM,MgCl2 2mM,Tris-HCl pH9.0 10mM,NP40 0.5%,BSA 0.02% wt/vol,Taq DNA pol 1U,总反应体积20μl,PCR扩增产物>500bp热循环参数均为:93℃预变性2min,然后93℃60s→55℃60s→72℃60s,循环35周期,最后一个72℃延长至5min,PCR扩增产物<500bp热循环参数均为:93℃预变性2min,然后93℃30s→55℃30s→72℃60s,循环35周期,最后一个72℃延长至5min,产物经1%琼脂糖凝胶电泳,出现与阳性对照分子相当的目的条带判为阳性。
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