[发明专利]花生β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ基因及其编码蛋白质无效
申请号: | 200810147436.8 | 申请日: | 2008-08-15 |
公开(公告)号: | CN101386861A | 公开(公告)日: | 2009-03-18 |
发明(设计)人: | 禹山林;陈明娜;杨庆利;潘丽娟;任增凯;曹玉良 | 申请(专利权)人: | 山东省花生研究所 |
主分类号: | C12N15/52 | 分类号: | C12N15/52;C12N15/10;C12N9/00 |
代理公司: | 北京汇泽知识产权代理有限公司 | 代理人: | 赵 军;张 瑾 |
地址: | 266100山东省青岛市*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 花生 酮脂酰 acp 合成 基因 及其 编码 蛋白质 | ||
1.一种花生β-酮脂酰-ACP合成酶II基因,其特征在于,它具有SEQ IDNO:1的序列。
2.一种实现权利要求1的花生β-酮脂酰-ACP合成酶II基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:
A.设计引物:根据NCBI数据库中的序列信息设计目的基因的简并引物Kas-5A(5′-ATGGGTTCTGCTATGCTTGC-3′)和Kas-3A(5′-ACCACCAAACCCGAATGAAT-3′);
B.花生总RNA的获得:以SPI056花生种子作为实验材料,采用Pbiozol植物组织RNA提取试剂盒提取花生种子中的总RNA,RNA含量及质量采用琼脂糖凝胶电泳检测;
C.目的基因cDNA片段的获取:以获得的总RNA为模板,采用SMARTTMRACE Amplification Kit(Clontech),反转录合成5’-和3’-RACE-Ready cDNA,以5’-RACE-Ready cDNA为模板,进行目的基因片段的PCR扩增。反应程序如下:94℃预变性3min,94℃变性45s,53℃复性50s,72℃延伸60s,30个循环后,72℃延伸10min;
D.目的基因片段的克隆及测序:PCR产物回收后与pMD18-T simple vector连接,连接产物转化E.coli Top 10感受态细胞,采用蓝白斑法筛选阳性克隆,筛选的阳性克隆经PCR进一步验证后测序。根据测得的基因基因片段序列设计5’和3’端cDNA片段引物,分别为GSP1(5′-GCAAAACTCCAGCCCCTTCACCCAT-3′)和GSP2(5′-ATGGGTGAAGGGGCTGGAGTTTTGC-3′),利用SMARTTM RACEAmplification Kit(Clontech)扩增目的基因5’和3’端基因片段。获得的PCR产物按前述进行操作并测序;
E.目的基因全序列的获得:将测得目的基因片段序列及5’和3’端序列进行拼接后得到目的全长基因序列,根据拼接得到的全长基因序列设计全长基因的扩增引物Rkas-5(5′-TGGCTTTCTCTTCTGCCTTTGC-3′)和Rkas-3(5′-CAATCTATGGTCTTCTCCTGG-3′);扩增反应如下:94℃预变性3min,94℃变性45s,55℃复性60s,72℃延伸2min,30个循环后,72℃10min,按上述D进行操作并测序,得到目的全长基因及序列。
3.一种编码权利要求1的花生β-酮脂酰-ACP合成酶II,其特征在于,它具有SEQ ID NO:2的序列。
4.一种编码权利要求1的花生β-酮脂酰-ACP合成酶II,其特征在于,它含一个Kas II活性位点,分子量为43181.4,等电点为5.69,为非分泌蛋白,呈紧密的球状结构。
5.如权利要求3所述的β-酮脂酰-ACP合成酶II,其特征在于,其编码序列由DNAssist软件分析所得。
6.如权利要求4所述的β-酮脂酰-ACP合成酶II,其特征在于,其Kas II活性位点为根据PROSITE数据库分析所得,分子量和等电点由Protparam预测所得,非分泌蛋白和呈紧密的球状结构特点分别由软件SignalP 3.0 Server和TMHMM2 program预测而得。
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