[发明专利]与高尿酸血症密切相关的新的人URAT1基因SNP位点无效

专利信息
申请号: 200810170488.7 申请日: 2008-11-05
公开(公告)号: CN101418296A 公开(公告)日: 2009-04-29
发明(设计)人: 李长贵;苗志敏;闫胜利;韩琳;王云龙;孟冬梅 申请(专利权)人: 李长贵;苗志敏;闫胜利
主分类号: C12N15/12 分类号: C12N15/12;C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266003山东省青*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 尿酸 密切 相关 urat1 基因 snp
【说明书】:

技术领域:

发明为与血液中尿酸水平密切相关的hURAT1基因第三内含子SNP位点+11 G>A,涉 及生物医学高技术中新基因的开发与应用领域。

发明背景:

尿酸是人体嘌呤代谢的终末产物,肾脏是尿酸排泄的主要途径。肾脏对尿酸的排泄主要 取决于肾小管腔和基底膜侧尿酸重吸收、分泌转运体的数目和活性。有关资料显示,肾小管 对尿酸的重吸收增加是人类高尿酸血症的主要原因,而hURAT1作为最重要的尿酸盐重吸收 转运体,被认为是调节血尿酸水平的关键蛋白。

hURAT1基因属于有机离子转运家族SLC22,该基因位于11q13,含有10个外显子和9 个内含子。hURAT1为阴离子交换通道,通过与乳酸等有机阴离子及氯等无机阴离子交换, 将肾小管管腔内的尿酸转运到肾小管上皮细胞内。

临床资料显示,hURAT1基因多态性与原发性高尿酸血症密切相关。Graessler J等研究发 现,hURAT1基因第二外显子C426T多态性与德国人群肾尿酸排泄减少和高尿酸血症显著相 关,相对于CC基因型,CT和TT基因型个体肾脏尿酸排泄分数(FEUA)明显降低,血尿 酸水平明显升高;Yukio Shima等研究发现,日本男性受试者中hURAT1第四内含子G/T多 态不同基因型者(GG,GT和TT)血尿酸水平明显不同,GG基因型者血尿酸水平最高,GT 基因型者次之,TT基因型者最低,提出在日本人群中,该SNP位点可作为独立的高尿酸血 症预测标记。Vázquez-Mellado等对69名墨西哥原发性痛风患者及其29名一级家属和120名 健康个体的hURAT1基因进行序列分析,结果显示69名痛风患者中16名患者存在hURAT1 基因突变,占患者的23%,其中5种突变位于第5外显子,1种突变位于第4外显子,16名 突变患者中有11名为第5外显子的C850G错义突变,提出上述突变可能与原发性痛风有关。

单核苷酸多态性是人类遗传变异的主要来源,众多研究证明单核苷酸多态性影响多基因 遗传病个体的易感性。高尿酸血症是一种多基因遗传病,hURAT1作为高尿酸血症的候选基 因,其单核苷酸多态性在导致高尿酸血症中发挥重要的作用。单核苷酸多态性在不同人群中 分布不同,在中国人群中没有高尿酸血症和hURAT1基因单核苷酸多态性的相关性报道。本 研究中,我们选择568名中国北方汉族人群hURAT1基因10个外显子和9个内含子进行测 序,以期发现中国北方汉族人群中与高尿酸血症相关的hURAT1基因单核苷酸多态性。

发明目的:

选择原发性高尿酸血症病人227例,对照组341例。取所有研究对象外周抗凝血,提取 基因组DNA。设计特异性引物,采用PCR方法分别扩增hURAT1基因启动子、10个外显子 及外显子和内含子交界处,进行正向和反向测序,应用Genestar软件寻找SNP及突变位点;应 用haploview软件检验研究对象SNP Hardy-Weinberg平衡,确认研究对象选取的随机性及两 两SNP位点之间的连锁关系;应用X2检验比较不同组别基因型及等位基因频率,确定与原 发性高尿酸血症相关的SNP及突变位点;应用Phase软件进行与原发性高尿酸血症相关的SNP 位点所组成的单倍型分析,确定原发性高尿酸血症易感单倍型;应用Logistic回归分析和不 同组别间生化指标的比较,确认原发性高尿酸血症的致病位点,从而为高尿酸血症的基因治疗 以及新药筛选等提供可能的理论指导和依据。

内容与要求:

研究对象中高尿酸血症组患者的收入标准:普通饮食并排除心、肝、肾以及全身性疾病 的基础上,连续三次测定男性及绝经后女性血清中尿酸含量超过416umol/L,绝经前女性超过 357umol/L。正常对照组收入标准:血脂、肾功能、肝功能、尿酸值(各项生化指标)均在 正常范围内的无高尿酸血症家族史正常人。利用常规方法提取患者外周血的基因组DNA,结 合PCR方法获得目的片段,纯化后测序,与正常人相比较,寻找SNP位点。

该基因/蛋白达到的技术指标为:

1、hURAT1基因中我们共发现了13个SNP位点,其中12个与已知报道相符,但我们发现的 第3内含子+11 G>A位点在国内、国际上均未见有相关报道,因此,该位点是hURAT1基 因的一个新的SNP位点(测序图见图1)。

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