[发明专利]一种猪氟烷基因基因型的检测方法无效
申请号: | 200810200152.0 | 申请日: | 2008-09-19 |
公开(公告)号: | CN101358245A | 公开(公告)日: | 2009-02-04 |
发明(设计)人: | 李建颖;刘炜;吴昊旻;马芳芳;黄国庆 | 申请(专利权)人: | 上海市动物疫病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 上海申汇专利代理有限公司 | 代理人: | 林炜 |
地址: | 201103上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种猪 烷基 基因型 检测 方法 | ||
1.一种猪氟烷基因基因型的检测方法,其特征在于包括如下步骤:
a)对猪氟烷基因进行PCR扩增,然后对扩增出的碱基片段进行碱基测序,确定猪氟烷基因的突变位点,根据突变位点两端的碱基序列设计两组引物,其中一组引物的上游引物3’端和野生型的基因位点匹配,另一组引物的上游引物3’端和突变型的基因位点匹配,两组的下游引物相同;
b)将待检测猪的样品DNA分别与野生型引物、突变型引物在两个反应体系中同时进行PCR扩增,扩增后每个样品与每组引物产生一个荧光信号,即每个样品产生两个荧光信号,随着PCR反应的进行,PCR反应产物不断累计,荧光信号强度也等比例增加,每经过一个循环,收集一次荧光信号,通过荧光信号的强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光信号强度曲线图,根据两个荧光信号的增强先后次序即可得出猪氟烷基因的基因型。
2.如权利要求1所述的一种猪氟烷基因基因型的检测方法,其特征在于:所述的野生型的基因位点的上游引物为5’CAA TGG TGT GGC CGT GT 3’,野生型基因位点的下游引物为5’GCC CAG ACC TGG TGA CAT A 3’,突变型基因位点的上游引物为5’CAA TGG TGT GGC CGT GC 3’,突变型基因位点的下游引物为5’GCC CAG ACC TGG TGA CAT A 3’。
3.如权利要求1所述的一种猪氟烷基因基因型的检测方法,其特征在于:在b步骤中,扩增体系为热启动Taq DNA聚合酶0.1U/ul、三磷酸脱氧核糖核苷酸0.2mM、上下游引物各0.2uM、样品DNA 50ng/ul以及SYBRGreen I染料、缓冲液,加ddH2O至20ul;扩增反应条件为首先95℃变性15min,然后94℃变性15sec、50℃退火20sec、72℃复性20sec,共40个循环。
4.如权利要求1所述的一种猪氟烷基因基因型的检测方法,其特征在于:当野生型引物的荧光信号首先增强时,即可得出样品DNA为野生型。
5.如权利要求1所述的一种猪氟烷基因基因型的检测方法,其特征在于:当突变型引物的荧光信号首先增强时,即可得出样品DNA为突变型。
6.如权利要求1所述的一种猪氟烷基因基因型的检测方法,其特征在于:当野生型引物和突变型引物的荧光信号同时增强时,即可得出样品DNA为杂合型。
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