[发明专利]一种使用荧光RT-PCR技术定量检测ARHGDIB基因mRNA的方法无效

专利信息
申请号: 200810201648.X 申请日: 2008-10-23
公开(公告)号: CN101760524A 公开(公告)日: 2010-06-30
发明(设计)人: 何剑军;夏懿 申请(专利权)人: 上海复星医药(集团)股份有限公司;上海复星医学科技发展有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N21/64
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 200010*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 使用 荧光 rt pcr 技术 定量 检测 arhgdib 基因 mrna 方法
【权利要求书】:

1.一种使用荧光RT-PCR技术定量检测ARHGDIB基因mRNA的方法,其特征在于包含一对特异性引物和一条特异性探针,扩增目标片段长度为139bp,引物和探针序列为:

引物1:5`-ACCACAGAAGTCCCTGAAAGAGCT-3`(Seq No.1)

引物2:5`-GGTGAGCCGGGTGACAACGAC-3`(Seq No.2)

探针1:5`-TCGGATCTGTCACCACAGGACCA-3`(Seq No.3)

或探针2:5`-TGGTCCTGTGGTGACAGATCCGA-3`(Seq No.4)

或探针3:5`-TGTGGTGACAGATCCGAA-3`(Seq No.5)

或探针4:5`-TTCGGATCTGTCACCACA-3`(Seq No.6)

或者上述引物序列的互补序列,或者上述序列同源性大于75%的序列。

2.根据权利要求1所述的使用荧光RT-PCR技术定量检测ARHGDIB基因mRNA的方法,其特征在于标记探针5`端的荧光发光基团为可以FAM、TET、JOE、Cy3、Cy5、Cy5.5、Fluorescein、Rhodamine、Rhodamine Red、Rhodamine Green、Rhodamine 6G、Oregon Green488、Oregon Green 500、Oregon Green 514、Texas Red、TAMRA、Inosine、HEX、FITC、Acridine orange或ROX中任意一种;3`端荧光淬灭基团为DABCYL、DABSYL、Eclipse、TAMRA、BHQ-1、BHQ-2、BHQ-3或MGB基团中的任意一种。

3.根据权利要求1所述的使用荧光RT-PCR技术定量检测ARHGDIB基因mRNA的方法,其特征在于使用一步法RT-PCR荧光检测技术,对标本中的ARHGDIB基因mRNA进行定性或定量分析。

4.根据权利要求1所述的使用荧光RT-PCR技术定量检测ARHGDIB基因mRNA的方法,其特征在于,使用人工合成的RNA序列作为RNA阳性对照品,序列如下:

ACCACAGAAGUCCCUGAAAGAGCUGCAGGAAAUGGACAAAGAUGAUGAGAGUCUAAUUAAGUACAAGAAAACGCUGCUGGGAGAUGGUCCUGUGGUGACAGAUCCGAAAGCCCCCAAUGUCGUUGUCACCCGGCUCACC(139bp)(Seq No.7)。

5.根据权利要求1所述的使用荧光RT-PCR技术定量检测ARHGDIB基因mRNA的方法,其特征在于,可形成定量检测试剂盒,试剂盒组成包括:

组成成分(20人份/盒)          体积

One step RT-PCR反应缓冲液    380μl

混合酶                       60μl

RNA标准品                    120μl

RNA标准品                    220μl

RNA标准品                    320μl

RNA标准品                    420μl

DEPC水                       1ml

其中,One step PCR反应组分(终浓度)包括:50mM Tris-HCl(Ph 8.3)、50mM KCl、300uM dNTP、3mM MgCl2、200nM引物1、200nM引物2和200nM探针1。混合酶的组成成份(终浓度)包括:0.5U AMV酶、0.5U RNase Inhibitor、0.1mg/ml BSA、5mM DTT、1.5U Taq酶、0.05U UNG酶。另外,探针1的5`端标记的发光基团为FAM,在3`端标记的淬灭基团为Eclipse。

6.根据权利要求5所述的使用荧光RT-PCR技术定量检测ARHGDIB基因mRNA的方法,其特征在于,操作步骤如下:

PCR反应液的配制:按每人份One step RT-PCR反应缓冲液19ul、混合酶3ul的配方配制PCR反应液,并按22ul/管分装到0.2ml PCR管中,然后加入适量提取好的总RNA并补充DEPC水(RNA阳性对照品直接取8ul),使反应总体积为30ul,按如下程序进行一步法RT-PCR检测:反应管先在50℃反应5分钟,然后95℃保温5分钟,再按94℃20秒→60℃35秒循环40次(60℃退火条件下采集FAM通道荧光)。

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