[发明专利]预示区分家养和野生双峰驼DNA微卫星的标记方法无效

专利信息
申请号: 200810201918.7 申请日: 2008-10-30
公开(公告)号: CN101445830A 公开(公告)日: 2009-06-03
发明(设计)人: 孟和;高宏巍 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海交达专利事务所 代理人: 王锡麟;王桂忠
地址: 200240*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 预示 区分 家养 野生 双峰驼 dna 卫星 标记 方法
【权利要求书】:

1.一种预示区分家养和蒙古野生双峰驼DNA微卫星的标记方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)采集双峰驼耳部组织样品,根据常规酚/氯仿法提取基因组DNA;

(2)根据已有双峰驼微卫星标记设计16对PCR引物,具体如下:

CMS 9:F:TGCTTTAGACGACTTTTACTTTAC;

R:ATTTCACTTTCTTCATACTTGTGAT;

CMS 13:F:TAGCCTGACTCTATCCATTTCTC;

R:ATTATTTGGAATTCAACTGTAAGG;

CMS 16:F:ATTTTGCAATTTGTTCGTTCTTTC;

R:GGAGTTTATTTGCTTCCAACACTT;

CMS 18:F:GAACGACCCTTGAAGACGAA;

R:AGCAGCTGGTTTTAGGTCCA;

CMS 36:F:AAATTACTGAATTCCCCCCCTA;

R:GTTACAACGCTCTCATTCATC;

CMS 121:F:CAAGAGAACTGGTGAGGATTTTC;

R:AGTTGATAAAAATACAGCTGGAAAG;

vOLP 08:F:CCATTCACCCCATCTCTC;

R:TCGCCAGTGACCTTATTTAGA;

VOLP 10:F:CTTTCTCCTTTCCTCCCTACT;

R:CGTCCACTTCCTTCATTTC;

VOLP-67:F:TTAGAGGGTCTATCCAGTTTC;

R:TGGACCTAAAAGAGTGGAG;

LCA 65:F:TTTTTCCCCTGTGGTTGAAT;

R:AACTCAGCTGTTGTCAGGGG;

YWLL08:F:ATCAAGTTTGAGGTGCTTTCC;

R:CCATGGCATTGTGTTGAAGAC;

YWLL 36:F:AGTCTTGGTGTGGTGGTAGAA;

R:TGCCAGGTAACTGACAGTGAT;

YWLL 38:F:GGCCTAAATCCTACTAGAC;

R:CCTCTCACTCTTGTTCTCCTC;

YWLL 59:F:TGTGCAGGAGTTAGGTGTA;

R:CCATGTCTCTGAAGCTCTGGA;

CMS 17:F:TATAAAGGATCACTGCCTTC;

R:AAAATGAACCTCCATAAAGTTAG;

CMS 50:F:TTTATAGTCAGAGAGAGTGCTG;

R:TGTAGGGTTCATTGTAACA;

(3)利用设计的16对引物对双峰驼基因组DNA进行PCR扩增;

(4)使用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,根据PCR扩增产物的长度进行基因型分类;

(5)比较不同微卫星标记基因型在家养双峰驼和蒙古野生双峰驼的分布,定特异基因型;

(6)对特异等位基因扩增产物进行克隆和测序;

通过测序比较特异基因型和非特异基因型间DNA序列,在微卫星位点VOLP 10上家养双峰驼比蒙古野生双峰驼少13个CA重复序列;

通过测序比较特异基因型和非特异基因型间DNA序列,在微卫星位点YWLL36上家养双峰驼比蒙古野生双峰驼少2个GT重复序列;

通过测序比较特异基因型和非特异基因型间DNA序列,在微卫星位点YWLL38上家养双峰驼比蒙古野生双峰驼多5个GA和1个GT重复序列。

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