[发明专利]预示区分家养和野生双峰驼DNA微卫星的标记方法无效
申请号: | 200810201918.7 | 申请日: | 2008-10-30 |
公开(公告)号: | CN101445830A | 公开(公告)日: | 2009-06-03 |
发明(设计)人: | 孟和;高宏巍 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
地址: | 200240*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 预示 区分 家养 野生 双峰驼 dna 卫星 标记 方法 | ||
1.一种预示区分家养和蒙古野生双峰驼DNA微卫星的标记方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)采集双峰驼耳部组织样品,根据常规酚/氯仿法提取基因组DNA;
(2)根据已有双峰驼微卫星标记设计16对PCR引物,具体如下:
CMS 9:F:TGCTTTAGACGACTTTTACTTTAC;
R:ATTTCACTTTCTTCATACTTGTGAT;
CMS 13:F:TAGCCTGACTCTATCCATTTCTC;
R:ATTATTTGGAATTCAACTGTAAGG;
CMS 16:F:ATTTTGCAATTTGTTCGTTCTTTC;
R:GGAGTTTATTTGCTTCCAACACTT;
CMS 18:F:GAACGACCCTTGAAGACGAA;
R:AGCAGCTGGTTTTAGGTCCA;
CMS 36:F:AAATTACTGAATTCCCCCCCTA;
R:GTTACAACGCTCTCATTCATC;
CMS 121:F:CAAGAGAACTGGTGAGGATTTTC;
R:AGTTGATAAAAATACAGCTGGAAAG;
vOLP 08:F:CCATTCACCCCATCTCTC;
R:TCGCCAGTGACCTTATTTAGA;
VOLP 10:F:CTTTCTCCTTTCCTCCCTACT;
R:CGTCCACTTCCTTCATTTC;
VOLP-67:F:TTAGAGGGTCTATCCAGTTTC;
R:TGGACCTAAAAGAGTGGAG;
LCA 65:F:TTTTTCCCCTGTGGTTGAAT;
R:AACTCAGCTGTTGTCAGGGG;
YWLL08:F:ATCAAGTTTGAGGTGCTTTCC;
R:CCATGGCATTGTGTTGAAGAC;
YWLL 36:F:AGTCTTGGTGTGGTGGTAGAA;
R:TGCCAGGTAACTGACAGTGAT;
YWLL 38:F:GGCCTAAATCCTACTAGAC;
R:CCTCTCACTCTTGTTCTCCTC;
YWLL 59:F:TGTGCAGGAGTTAGGTGTA;
R:CCATGTCTCTGAAGCTCTGGA;
CMS 17:F:TATAAAGGATCACTGCCTTC;
R:AAAATGAACCTCCATAAAGTTAG;
CMS 50:F:TTTATAGTCAGAGAGAGTGCTG;
R:TGTAGGGTTCATTGTAACA;
(3)利用设计的16对引物对双峰驼基因组DNA进行PCR扩增;
(4)使用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,根据PCR扩增产物的长度进行基因型分类;
(5)比较不同微卫星标记基因型在家养双峰驼和蒙古野生双峰驼的分布,定特异基因型;
(6)对特异等位基因扩增产物进行克隆和测序;
通过测序比较特异基因型和非特异基因型间DNA序列,在微卫星位点VOLP 10上家养双峰驼比蒙古野生双峰驼少13个CA重复序列;
通过测序比较特异基因型和非特异基因型间DNA序列,在微卫星位点YWLL36上家养双峰驼比蒙古野生双峰驼少2个GT重复序列;
通过测序比较特异基因型和非特异基因型间DNA序列,在微卫星位点YWLL38上家养双峰驼比蒙古野生双峰驼多5个GA和1个GT重复序列。
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