[发明专利]盐屋霉素的生物合成基因簇无效

专利信息
申请号: 200810202417.0 申请日: 2008-11-07
公开(公告)号: CN101423837A 公开(公告)日: 2009-05-06
发明(设计)人: 刘文;段炼;虞沂;廖日晶;雷春;丁莹 申请(专利权)人: 中国科学院上海有机化学研究所
主分类号: C12N15/54 分类号: C12N15/54;C12N15/55;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/31;C07K14/195
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摘要:
搜索关键词: 霉素 生物 合成 基因
【权利要求书】:

1.一种抗革兰氏阳性菌活性的抗生素—盐屋霉素的生物合成基因簇,其特征在于编码盐屋霉素生物合成所涉及的21个基因,具体为:

1)1个氨基转移酶基因,即sioA:

sioA位于基因簇核苷酸序列第11552-10491个碱基处,长度为1062个碱基对,氨基转移酶,353个氨基酸;

2)脂肪酶基因,即sioB:

sioB位于基因簇核苷酸序列第12421-11597个碱基处,长度为825个碱基对,编码脂肪酶,274个氨基酸;

3)天门冬酰胺合成酶基因,即:sioC

sioC位于基因簇核苷酸序列第14359-12500个碱基处,长度为1860个碱基对,编码天门冬酰胺合成酶,619个氨基酸;

4)酯环化酶基因,即基因sioD:

sioD位于基因簇核苷酸序列第个14789-14382碱基处,长度为408个碱基对,编码酯环化酶,135个氨基酸;

5)酰基-CoA脱氢酶基因,即sioE:

sioE位于基因簇核苷酸序列第16066-14834个碱基处,长度为1233个碱基对,编码酰基-CoA脱氢酶,410个氨基酸;

6)甲基转移酶基因,即sioF:

sioF位于基因簇核苷酸序列第16974-16090个碱基处,长度为885个碱基对,编码甲基基转移酶,294个氨基酸;

7)具体功能未知的基因,即:sioG:

sioG位于基因簇核苷酸序列第17554-17000个碱基处,长度为555个碱基对,编码一个未知功能蛋白,184个氨基酸;

8)前体肽基因,即sioH:

sioH位于基因簇核苷酸序列第17889-18074个碱基处,长度为186个碱基对,编码Siomycin前体肽,61个氨基酸;

9)水解酶基因,即sioI:

sioI位于基因簇核苷酸序列第18770-19555个碱基处,长度为786个碱基对,编码水解酶,261个氨基酸;

10)脱水酶基因,即sioJ:

sioJ位于基因簇核苷酸序列第19548-22196个碱基处,长度为2649个碱基对,编码脱水酶,882个氨基酸;

11)脱水酶基因,即sioK:

sioK位于基因簇核苷酸序列第22193-23197个碱基处,长度为1005个碱基对,编码脱水酶,334个氨基酸;

12)催化D-A反应酶基因,即sioL:

sioL位于基因簇核苷酸序列第23194-24306个碱基处,长度为1113个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,370个氨基酸;

13)NADH依赖的氧化酶基因,即sioM:

sioM位于基因簇核苷酸序列第24303-25967个碱基处,长度为1665个碱基对,编码NADH依赖的氧化酶,554个氨基酸;

14)与Siomycin大环合成相关具体功能未知基因,即sioN:

sioN位于基因簇核苷酸序列第25964-27676个碱基处,长度为1713个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,570个氨基酸;

15)环化酶基因,即sioO:

sioO位于基因簇核苷酸序列第27673-29616个碱基处,长度为1944个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,647个氨基酸;

16)细胞色素P450氧化酶基因,即sioP:

sioN位于基因簇核苷酸序列第29594-30943个碱基处,长度为1350个碱基对,编码细胞色素P450氧化酶,449个氨基酸;

17)酰基-CoA合成酶,即sioQ:

sioQ位于基因簇核苷酸序列第30919-32220个碱基处,长度为1302个碱基对,编码酰基-CoA合成酶,433个氨基酸;

18)细胞色素P450氧化酶基因,即sioR:

sioR位于基因簇核苷酸序列第32192-33424个碱基处,长度为1233个碱基对,编码细胞色素氧化酶,410个氨基酸;

19)脱水酶基因,即sioS:

sioS位于基因簇核苷酸序列第33412-36018个碱基处,长度为2607个碱基对,编码脱水酶,868个氨基酸;

20)硫腺苷甲硫氨酸转移酶基因,即sioT:

sioT位于基因簇核苷酸序列第36030-37805个碱基处,长度为1776个碱基对,编码一个硫腺苷甲硫氨酸转移酶,591个氨基酸;

21)短链脱氢酶基因,即sioU:

sioU位于基因簇核苷酸序列第37802-38569个碱基处,长度为768个碱基对,编码一个脱氢酶,255个氨基酸。

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