[发明专利]盐屋霉素的生物合成基因簇无效
申请号: | 200810202417.0 | 申请日: | 2008-11-07 |
公开(公告)号: | CN101423837A | 公开(公告)日: | 2009-05-06 |
发明(设计)人: | 刘文;段炼;虞沂;廖日晶;雷春;丁莹 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海有机化学研究所 |
主分类号: | C12N15/54 | 分类号: | C12N15/54;C12N15/55;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/31;C07K14/195 |
代理公司: | 上海新天专利代理有限公司 | 代理人: | 邬震中 |
地址: | 200032*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 霉素 生物 合成 基因 | ||
1.一种抗革兰氏阳性菌活性的抗生素—盐屋霉素的生物合成基因簇,其特征在于编码盐屋霉素生物合成所涉及的21个基因,具体为:
1)1个氨基转移酶基因,即sioA:
sioA位于基因簇核苷酸序列第11552-10491个碱基处,长度为1062个碱基对,氨基转移酶,353个氨基酸;
2)脂肪酶基因,即sioB:
sioB位于基因簇核苷酸序列第12421-11597个碱基处,长度为825个碱基对,编码脂肪酶,274个氨基酸;
3)天门冬酰胺合成酶基因,即:sioC
sioC位于基因簇核苷酸序列第14359-12500个碱基处,长度为1860个碱基对,编码天门冬酰胺合成酶,619个氨基酸;
4)酯环化酶基因,即基因sioD:
sioD位于基因簇核苷酸序列第个14789-14382碱基处,长度为408个碱基对,编码酯环化酶,135个氨基酸;
5)酰基-CoA脱氢酶基因,即sioE:
sioE位于基因簇核苷酸序列第16066-14834个碱基处,长度为1233个碱基对,编码酰基-CoA脱氢酶,410个氨基酸;
6)甲基转移酶基因,即sioF:
sioF位于基因簇核苷酸序列第16974-16090个碱基处,长度为885个碱基对,编码甲基基转移酶,294个氨基酸;
7)具体功能未知的基因,即:sioG:
sioG位于基因簇核苷酸序列第17554-17000个碱基处,长度为555个碱基对,编码一个未知功能蛋白,184个氨基酸;
8)前体肽基因,即sioH:
sioH位于基因簇核苷酸序列第17889-18074个碱基处,长度为186个碱基对,编码Siomycin前体肽,61个氨基酸;
9)水解酶基因,即sioI:
sioI位于基因簇核苷酸序列第18770-19555个碱基处,长度为786个碱基对,编码水解酶,261个氨基酸;
10)脱水酶基因,即sioJ:
sioJ位于基因簇核苷酸序列第19548-22196个碱基处,长度为2649个碱基对,编码脱水酶,882个氨基酸;
11)脱水酶基因,即sioK:
sioK位于基因簇核苷酸序列第22193-23197个碱基处,长度为1005个碱基对,编码脱水酶,334个氨基酸;
12)催化D-A反应酶基因,即sioL:
sioL位于基因簇核苷酸序列第23194-24306个碱基处,长度为1113个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,370个氨基酸;
13)NADH依赖的氧化酶基因,即sioM:
sioM位于基因簇核苷酸序列第24303-25967个碱基处,长度为1665个碱基对,编码NADH依赖的氧化酶,554个氨基酸;
14)与Siomycin大环合成相关具体功能未知基因,即sioN:
sioN位于基因簇核苷酸序列第25964-27676个碱基处,长度为1713个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,570个氨基酸;
15)环化酶基因,即sioO:
sioO位于基因簇核苷酸序列第27673-29616个碱基处,长度为1944个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,647个氨基酸;
16)细胞色素P450氧化酶基因,即sioP:
sioN位于基因簇核苷酸序列第29594-30943个碱基处,长度为1350个碱基对,编码细胞色素P450氧化酶,449个氨基酸;
17)酰基-CoA合成酶,即sioQ:
sioQ位于基因簇核苷酸序列第30919-32220个碱基处,长度为1302个碱基对,编码酰基-CoA合成酶,433个氨基酸;
18)细胞色素P450氧化酶基因,即sioR:
sioR位于基因簇核苷酸序列第32192-33424个碱基处,长度为1233个碱基对,编码细胞色素氧化酶,410个氨基酸;
19)脱水酶基因,即sioS:
sioS位于基因簇核苷酸序列第33412-36018个碱基处,长度为2607个碱基对,编码脱水酶,868个氨基酸;
20)硫腺苷甲硫氨酸转移酶基因,即sioT:
sioT位于基因簇核苷酸序列第36030-37805个碱基处,长度为1776个碱基对,编码一个硫腺苷甲硫氨酸转移酶,591个氨基酸;
21)短链脱氢酶基因,即sioU:
sioU位于基因簇核苷酸序列第37802-38569个碱基处,长度为768个碱基对,编码一个脱氢酶,255个氨基酸。
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