[发明专利]德国镜鲤杂交优势种群的筛选方法无效
申请号: | 200810209540.5 | 申请日: | 2008-11-27 |
公开(公告)号: | CN101403006A | 公开(公告)日: | 2009-04-08 |
发明(设计)人: | 李池陶;石连玉;胡雪松;赵海燕;贾智英 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 哈尔滨市松花江专利商标事务所 | 代理人: | 单 军 |
地址: | 150070黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 德国 杂交 优势 种群 筛选 方法 | ||
1、德国镜鲤杂交优势种群的筛选方法,其特征在于德国镜鲤杂交优势种群按以下步骤进行筛选:a、形态标记:对各种群随机选出的德国镜鲤的可量性状和可数形状进行标记;b、再进行微卫星分子标记:(1)DNA的提取与纯化;(2)RCR扩增;(3)产物检测;(4)数据处理;c、数据分析,选择种群差异性大的作为德国镜鲤杂交优势种群。
2、根据权利要求1所述的德国镜鲤杂交优势种群的筛选方法,其特征在于步骤a中可量性状包括体重、全长、体长、体高、头长、头高、尾柄长、尾柄高、吻长、眼径和眼间距。
3、根据权利要求1所述的德国镜鲤杂交优势种群的筛选方法,其特征在于步骤a中可数形状包括左侧线上鳞、左侧线侧鳞、左侧线下鳞、右侧线上鳞、右侧线侧鳞和右侧线下鳞。
4、根据权利要求1所述的德国镜鲤杂交优势种群的筛选方法,其特征在于步骤b(1)中采用酚/氯仿法提取鳍条基因组DNA,纯化后定量至DNA浓度为50ng/μL。
5、根据权利要求1或4所述的德国镜鲤杂交优势种群的筛选方法,其特征在于步骤b(2)中RCR扩增反应体系为25μL:水14μL、10×PCR buffer 2.5μL、10mmol/L 4×dNTPs 2μL、2.0mmol/L MgCl2 1.5μL、10pmol/μL上下游引物各1μL、Taq DNA聚合酶1U和50ng/μL DNA模板1μL;RCR扩增引物为MFW1、MFW2、MFW3、MFW4、MFW5、MFW9、MFW7、MFW11、MFW14、MFW16、MFW19、MFW20MFW24、MFW29和MFW30;
引物MFW1中上游引物MFW1F的序列为:GTCCAGACTGTCATCAGGAG,下游引物MFW1R的序列为:GAGGTGTACACTGAGTCACGC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、63.7退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW2中上游引物MFW2F的序列为:CACACCGGGCTACTGCAGAG,下游引物MFW2R的序列为:GTGCAGTGCAGGCAGTTTGC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、60℃退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW3中上游引物MFW3F的序列为:GATCAGAAGGTACAGAGAAG,下游引物MFW3R的序列为:CCTTACAGAAAACCTGTTTGC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、53℃退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW4中上游引物MFW4F的序列为:TCCAAGTCAGTTTAATCACCG,下游引物MFW4R的序列为:GGGAAGCGTTGACAACAAGC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、60.5℃退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW5中上游引物MFW5F的序列为:GAGATGCCTGGGGAAGTCAC,下游引物MFW5R的序列为:AAAGAGAGCGGGGTAAAGGAG,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、62.9退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW7中上游引物MFW7F的序列为:TACTTTGCTCAGGACGGATGC,下游引物MFW7R的序列为:ATCACCTGCACATGGCCACTC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、61.5退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW9中上游引物MFW9F的序列为:GATCTGCAAGCATATCTGTCG,下游引物MFW9R的序列为:ATCTGAACCTGCAGCTCCTC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW11中上游引物MFW11F的序列为:GCATTTGCCTTGATGGTTGTG,下游引物MFW11R的序列为:TCGTCTGGTTTAGAGTGCTGC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、58.7退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW14中上游引物MFW14F的序列为:CAGAAGCTTCTGGAAATCTGAG,下游引物MFW14R的序列为:GCGAGAAGATTGATGGACAAC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、60.1退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW16中上游引物MFW16F的序列为:GTCCATTGTGTCAAGATAGAG,下游引物MFW16R的序列为:TCTTCATTTCAGGCTGCAAAG,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、60.1退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW19中上游引物MFW19F的序列为:CAATCCTCCATCATGCAAAC,下游引物MFW19R的序列为:GCACAAACTCCACATTGTGCC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、58.4℃退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW20中上游引物MFW20F的序列为:CAGTGAGACGATTACCTTGG,下游引物MFW20R的序列为:GTGAGCAGCCCACATTGAAC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、56℃退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW24中上游引物MFW24F的序列为:GCTCCAGATTGCACATTATAG,下游引物MFW24R的序列为:CTACACACACGCAGAGCCTTTC,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、60.1退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW29中上游引物MFW29F的序列为:CTACACACACGCAGAGCCTTTC,下游引物MFW29R的序列为:GAAGCTTTGCTCTAATCCACG,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、61.6退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min;
引物MFW30中上游引物MFW30F的序列为:GGTCAACAAGTAGTTGTGCAG,下游引物MFW30R的序列为:CCATCTCTGTCATTGCAACAG,PCR反应条件为95℃预变性5min,94℃变性30s、58.7退火30s、72℃延伸50s、30个循环,72℃延伸5min。
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