[发明专利]样品中不溶的分析物的测量无效

专利信息
申请号: 200880018023.8 申请日: 2008-03-31
公开(公告)号: CN101809165A 公开(公告)日: 2010-08-18
发明(设计)人: B·塞利格曼;R·马特尔;M·朗斯维尔;I·布特罗斯 申请(专利权)人: 高通量基因组学公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 永新专利商标代理有限公司 72002 代理人: 康健;林晓红
地址: 美国亚*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 样品 中不溶 分析 测量
【权利要求书】:

1.一种检测生物学样品中至少一种不溶靶的方法,包括

(i)将所述样品与特异性结合所述靶的至少一种核酸酶保护分子(NPM)接触,

(ii)将所述样品在有效消除任何未结合的NPM的条件下暴露于一或多种试剂,

(iii)任选地从所述靶分离结合的NPM,以及

(iv)检测所述NPM的存在。

2.权利要求1的方法,包括检测结合形式或游离形式的所述NPM。

3.权利要求1的方法,其中所述不溶靶被固定和/或交联。

4.权利要求1的方法,其中所述不溶靶是肽、蛋白质或核酸。

5.权利要求4的方法,其中所述核酸分子包含核糖核酸(RNA)分子或者脱氧核糖核酸(DNA)分子,或者反义核苷酸,其可包含非天然碱基。

6.权利要求5的方法,其中所述RNA是信使RNA(mRNA)、核糖体RNA(rRNA)、转移RNA(tRNA)、微小RNA(miRNA)、siRNA,以及反义RNA或者病毒RNA(vRNA)。

7.权利要求5的方法,其中所述DNA是基因组DNA(gDNA)、线粒体DNA(mtDNA)、叶绿体DNA(cpDNA),或者病毒DNA(vDNA),或者转染的DNA。

8.权利要求1的方法,其中所述NPM包含特异性结合所述靶的核酸,或者适体。

9.权利要求8的方法,其中所述靶是蛋白质、肽、多核苷酸或者能与所述核酸或适体NPM杂交的蛋白质。

10.权利要求9的方法,其中所述靶是核酸。

11.权利要求8的方法,其中所述NPM包含DNA分子。

12.权利要求11的方法,其中所述NPM是单链DNA(ssDNA)或者支链DNA(bDNA)分子,或者含有LNA或PNA或者其它非天然碱基。

13.权利要求1的方法,其中所述NPM是特异性结合所述靶的核酸,且步骤(ii)包括用核酸酶处理以有效消除任何未结合的NPM。

14.权利要求13的方法,其中所述靶是核酸。

15.权利要求13的方法,其中所述靶是RNA分子(应理解微小RNA是RNA分子?)、siRNA或者反义RNA,其可包含非天然碱基。

16.权利要求15的方法,其中所述靶RNA分子与完整NPM分子或者其一部分杂交。

17.权利要求13的方法,其中所述NPM是单链(ssDNA)或者支链(bDNA)DNA。

18.权利要求13的方法,其中所述核酸酶是DNAase、RNAase或者其组合。

19.权利要求13的方法,其中所述NPM是DNA分子,所述核酸酶是DNAase。

20.权利要求13的方法,其中所述核酸酶是S1核酸酶。

21.权利要求1的方法,其中所述生物学样品是固定的。

22.权利要求1的方法,其中所述生物学样品包含导致靶分子交联的物质。

23.权利要求21的方法,其中所述固定包括用乙醇、福尔马林、二硫-二(琥珀酰亚胺丙酸酯)(DSP)处理所述样品。

24.权利要求1的方法,其中所述靶是交联的。

25.权利要求24的方法,其中所述靶与如下物质交联:二[硫代琥珀酰亚胺]辛二酸酯(BS3)、二琥珀酰亚胺辛二酸酯(DSS)、二琥珀酰亚胺戊二酸酯(DSG)、二琥珀酰亚胺酒石酸酯(DST)、戊二醛或者其衍生物。

26.权利要求1的检测固定的生物学样品中至少一种不溶核酸靶的方法,包括

(i)将所述样品与至少一种核酸酶保护分子(NPM)在足以促进所述靶与所述NPM结合的条件下接触,所述NPM分子是特异性杂交所述核酸靶的核酸分子,

(ii)将所述样品在有效消除任何未结合的NPM的条件下暴露于一或多种核酸酶,

(iii)任选从所述靶分离结合的NPM,但是使NPM不与组织结合,

(iv)检测所述NPM的存在。

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