[发明专利]用于对多发性硬化症患者的样品进行分类的工具和方法

权利要求书

1.用于对来自人个体的细胞进行分类的方法，所述方法包括：

提供包含来自所述个体的细胞的样品，所述细胞通常对暴露于I型干扰素作出响应；

测定由1型干扰素调节的途径的活性水平；和

基于所测定的活性水平来对所述细胞进行分类。

2.根据权利要求1的方法，其进一步包括在测定所述途径的活性水平之前，在I型干扰素存在下培养所述细胞。

3.根据权利要求1或2的方法，其中所述个体患有自身免疫疾病或者处于患自身免疫疾病的危险中。

4.根据权利要求3的方法，其中所述自身免疫疾病是多发性硬化症。

5.根据前述权利要求中任一项的方法，其中所述分类包括将所述细胞分类为来自具有减少的对由1型干扰素介导的疗法作出应答的能力的个体。

6.根据前述权利要求中任一项的方法，其中所述I型干扰素是干扰素-β或其等价物。

7.根据权利要求1-6中任一项的方法，其中通过测定所述细胞中表2的至少一种基因，LGALS3BP或Siglec-1的表达水平，来测定由1型干扰素调节的途径的所述活性水平。

8.根据权利要求7的方法，其中通过测定所述细胞中的RNA水平来测定所述表达水平。

9.根据权利要求7或8的方法，其中所述至少一种基因在所述表中包含至少-0.65的R值。

10.根据权利要求8或9的方法，其包括测定所述细胞中表2的至少5种，和优选地至少10种，更优选地至少15种基因的RNA水平。

11.根据权利要求10的方法，其中所述至少5、10或15种基因中的每一种在所述表中包含至少-0.65的R值。

12.根据权利要求7-11中任一项的方法，其中所述至少一种基因包括RSAD2。

13.根据权利要求10的方法，其中所述至少5种基因至少包括RSAD2、IFIT1、MX1、G1P2和Image：1926927。

14.根据权利要求8-13中任一项的方法，其中借助于阵列来测量所述RNA水平。

15.根据权利要求7的方法，其中通过测定蛋白质表达水平来测定所述表达水平。

16.根据权利要求15的方法，其中通过流式细胞术和/或ELISA来测定所述表达水平。

17.根据权利要求1-16中任一项的方法，其中所述样品包含外周血单核细胞或其细胞级分，其通常对暴露于I型干扰素作出响应。

18.根据权利要求1-17中任一项的方法，其中所述分类进一步包括将所测定的活性水平与参照相比较。

19.根据权利要求1-18中任一项的方法，所述样品源自在用I型干扰素进行治疗之前的个体。

20.根据权利要求18或19的方法，其进一步包括将所述活性水平与在来自同时接受用I型干扰素进行的治疗的所述个体的细胞样品中所述途径的活性水平相比较。

21.根据权利要求1-20中任一项的方法，其中将样品中的细胞分成两个级分，其中对于所述两个级分的细胞测定所述途径的活性水平，并且其中所述级分中的第一个级分包含未处理的细胞(静息细胞)，和其中所述级分中的第二个级分包含在测定所述途径的活性水平之前在I型干扰素存在下进行了培养的细胞，所述方法进一步包括基于所述两个级分中的活性水平的比较来对所述细胞进行分类。

22.分部试剂盒，其包含对于表2的至少5种，和优选地至少10种，更优选地至少15种基因的RNA特异的探针或引物组。

23.根据权利要求22的试剂盒，其中所述至少5、10或15种基因中的每一种在所述表中包含至少-0.65的R值。

24.根据权利要求22或23的试剂盒用于对患有多发性硬化症或者处于患多发性硬化症的危险中的个体的样品进行分类的用途。