[发明专利]找出成对的同位素组

权利要求书

1.一种用于找出生物样品中的成对特征的方法，包括：

在不必标识特征的核酸序列的情况下，从将对照样品和与所述对照样品具有跟踪关系的处理样品放在一起作为制备样品的实验中形成合成图像；以及

从所述合成图像中找出感兴趣的特征对，一感兴趣的特征对中的一个成员根据所述跟踪关系而与所述对中的另一成员相关联，所述跟踪关系描述用于在合成图像上找出所述对中的两个成员的约束。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述跟踪关系通过用非放射性、稳定的同位素的原子质量单位数来对所述处理样品的实例进行同位素标记来创建，而所述对照样品的实例不进行同位素标记。

3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，所述跟踪关系通过反向标记来创建，其中所述对照样品的实例用先前用于对所述处理样品进行同位素标记的相同的原子质量单位数来进行同位素标记，而所述处理样品的实例不进行同位素标记。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述跟踪关系通过跟踪代谢实验中一个或多个分子的添加或丢失来创建。

5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，找出感兴趣的特征对包括找出同位素组，每一同位素组表示对照样品或处理样品，以及建立共同数量的同位素峰以搜索感兴趣的特征对。

6.如权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括计算比率的自然对数，所述比率包括被除数和除数，所述被除数是表示所述处理样品的同位素组的同位素峰的强度的总和，所述除数是表示所述对照样品的另一同位素组的同位素峰的强度的总和。

7.如权利要求6所述的方法，其特征在于，还包括计算比率的自然对数的误差以产生所述比率的p值，所述p值指示所述处理样品的差异表达水平。

8.一种其上存储有计算机可执行指令的可存储的计算机可读介质，所述指令用于实现一种用于找出生物样品中的成对特征的方法，所述方法包括：

在不必标识特征的核酸序列的情况下，从将对照样品和与所述对照样品具有跟踪关系的处理样品放在一起作为制备样品的实验中形成合成图像；以及

从所述合成图像中找出感兴趣的特征对，一感兴趣的特征对中的一个成员根据所述跟踪关系而与所述对中的另一成员相关联，所述跟踪关系描述用于在合成图像上找出所述对中的两个成员的约束。

9.如权利要求8所述的计算机可读介质，其特征在于，所述跟踪关系通过用非放射性、稳定的同位素的原子质量单位数来对所述处理样品的实例进行同位素标记来创建，而所述对照样品的实例不经历同位素标记。

10.如权利要求9所述的计算机可读介质，其特征在于，所述跟踪关系通过反向标记来创建，其中所述对照样品的实例用先前用于对所述处理样品进行同位素标记的相同的原子质量单位数来进行同位素标记，而所述处理样品的实例不进行同位素标记。

11.如权利要求8所述的计算机可读介质，其特征在于，所述跟踪关系通过跟踪代谢实验中一个或多个分子的添加或丢失来创建。

12.如权利要求8所述的计算机可读介质，其特征在于，找出感兴趣的特征对包括找出同位素组，每一同位素组表示对照样品或处理样品，以及建立共同数量的同位素峰以搜索感兴趣的特征对。

13.如权利要求8所述的计算机可读介质，其特征在于，还包括计算比率的自然对数，所述比率包括被除数和除数，所述被除数是表示所述处理样品的同位素组的同位素峰的强度的总和，所述除数是表示所述对照样品的另一同位素组的同位素峰的强度的总和。

14.如权利要求13所述的计算机可读介质，其特征在于，还包括计算比率的自然对数的误差以产生所述比率的p值，所述p值指示所述处理样品的差异表达水平。

15.一种用于找出感兴趣的特征对的系统，包括：

色谱和质谱仪的集合，其用于接收一起提交对照样品和处理样品以供处理的制备样品；

图像处理流水线，其用于在制备样品上提取特征并计算特性创建来自所述制备样品的合成图像并处理所述合成图像；以及

成对特征处理器，其用于处理来自所述合成图像的特征以找出根据关系彼此相关联的感兴趣的特征对，而不必首先标识所述特征的核酸序列。