[发明专利]用于扩增核酸的方法和组合物无效
申请号: | 200880103496.8 | 申请日: | 2008-06-18 |
公开(公告)号: | CN101861396A | 公开(公告)日: | 2010-10-13 |
发明(设计)人: | J·J·穆勒罗;L·K·亨尼西 | 申请(专利权)人: | 应用生物系统有限责任公司 |
主分类号: | C12P19/34 | 分类号: | C12P19/34 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 梁谋;付磊 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 扩增 核酸 方法 组合 | ||
1.一种扩增样品中的核酸序列的方法,所述方法包括:
提供一种包含靶核酸序列和PCR抑制因子的样品;
将至少一种高稳定性引物和靶核酸序列混合,其中所述高稳定性引物包含至少一种高稳定性核酸类似物;和
对所述样品实施扩增反应,由此通过所述高稳定性引物扩增所述靶核酸序列。
2.权利要求1的方法,其中所述靶核酸序列包括DNA。
3.权利要求1的方法,其中通过PCR实现扩增。
4.权利要求1的方法,其中所述高稳定性核酸类似物选自:PNA、LNA、2′-O-甲基核酸、2′-O-烷基核酸、2′-氟代核酸、包含硫代磷酸酯键的核酸及其任意组合。
5.权利要求4的方法,其中所述高稳定性核酸类似物包括LNA。
6.权利要求1的方法,其中所述高稳定性引物包括至少2种高稳定性核酸类似物。
7.权利要求1的方法,其中所述方法包括提供至少2种高稳定性引物。
8.权利要求1的方法,其中所述方法包括提供至少5种高稳定性引物。
9.权利要求1的方法,其中所述高稳定性引物具有比第二种引物高的熔点温度,所述第二种引物除了以下两点之外与所述高稳定性引物相同:a)所述第二种引物由天然核酸组成,和b)包括代替高稳定性核酸类似物的对等天然核酸。
10.权利要求1的方法,其中所述PCR抑制因子选自:腐殖酸、胆盐、复合多糖、胶原、亚铁血红素、黑色素、真黑素、肌红蛋白、多糖、蛋白酶、钙离子、尿素、血色素、乳铁蛋白、免疫球蛋白G和靛青染料。
11.权利要求1的方法,其中用高稳定性引物的所述扩增扩增至少一个基因座的核酸序列,所述基因座选自:CSF1PO、FGA、TH01、TPOX、vWA、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D19S433和D2S1338。
12.权利要求1的方法,其中用高稳定性引物的所述扩增扩增至少一个基因座的核酸序列,所述基因座选自:CSF1PO、FGA、TH01、TPOX、vWA、D3S1358、D5S818和D7S820。
13.一种鉴定个体的靶核酸序列的方法,所述方法包括:
提供一种样品,其中所述样品处于据信被可抑制核酸扩增的组分污染的位置,其中所述样品包含来自个体的靶核酸序列;
使用至少一种高稳定性引物扩增所述个体的靶核酸序列,其中所述高稳定性引物包含至少一种高稳定性核酸类似物,其中所述引物可以扩增至少一个基因座的序列,所述基因座选自:CSF1PO、FGA、TH01、TPOX、vWA、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D19S433、D2S1338或其组合,其中所述引物进一步包含迁移率调节物;和
表征扩增的靶核酸序列,由此鉴定扩增的靶核酸序列。
14.权利要求14的方法,其中所述高稳定性核酸类似物包含LNA。
15.一种用于人类鉴定的引物,所述引物具有与至少一个基因座的序列互补的序列,所述基因座选自:CSF1PO、FGA、TH01、TPOX、vWA、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D19S433和D2S1338,其中所述引物中的至少一种核酸为高稳定性核酸类似物。
16.权利要求15的引物,其中所述引物进一步包含迁移率调节物。
17.权利要求16的引物,其中所述迁移率调节物选自:聚环氧乙烷、聚乙醇酸、聚乳酸、多肽、寡糖、聚氨酯、聚酰胺、聚磺酰胺、聚亚砜、聚膦酸酯及其嵌段共聚物。
18.一种用于PCR反应的试剂盒,所述试剂盒包括:
三磷酸脱氧核苷酸;
荧光标记的引物;
包含至少一种高稳定性核酸类似物的高稳定性引物;和
DNA聚合酶。
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