[发明专利]建立油菜细胞质类型特异PCR标记以及快速鉴定油菜细胞质类型的方法无效

专利信息
申请号: 200910022297.0 申请日: 2009-04-30
公开(公告)号: CN101608198A 公开(公告)日: 2009-12-23
发明(设计)人: 胡胜武;赵惠贤;李占杰 申请(专利权)人: 西北农林科技大学
主分类号: C12P19/34 分类号: C12P19/34;C12Q1/68
代理公司: 西安恒泰知识产权代理事务所 代理人: 李郑建
地址: 712100陕西*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 建立 油菜 细胞质 类型 特异 pcr 标记 以及 快速 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.一种建立油菜细胞质类型目标基因特异PCR标记的方法,其特征在 于,该方法包括下列步骤:

1)以已知细胞质类型的甘蓝型油菜:包括Nap、Pol、Ogu、Cam和改 良Ogu细胞质类型的甘蓝型油菜的gDNA为模板,用以下对扩增引物对 目标基因Orf138、orf222/nad5c、orf224进行一步多重PCR扩增,其中:

第一对引物的序列为:

GAAACGGGAAGTGACAAT

GCATTATTTTCTCGGTCCAT;

第二对引物的序列为:

AGCTGTCTGGAGGGAATC  

GCGGTCTCACGCACTAATC;

第三对引物的序列为:

AGCTGTCTGGAGGGAATC

ACGACATCAAGGAGGAAC;

第一对引物扩增目标基因是Orf138;第二对引物扩增目标基因是 orf222/nad5c;第三对引物的扩增目标基因是orf224;

2)一步多重PCR扩增采用20μl的PCR反应体系,进行35个PCR循环 反应,得到片段大小分别为465bp、500bp、747bp、800bp、1102bp的特异 PCR标记,其中,465bp和500bp的标记标示ogu细胞质类型,1102bp和800bp 的标记标示nap细胞质类型,747bp和500bp的标记标示pol细胞质类型, 800bp和500bp的标记标示Cam细胞质类型,1102bp和465bp的标记标示 改良ogu细胞质类型。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述20μl PCR反应体系和 PCR循环反应如下:

20μlPCR反应体系包括10mM Tris-HCl、50mM KCl、1.5mM MgCl2、 250μM四种dNTP、0.5μM各条引物、0.5U Taq DNA酶和50ng基因组 DNA;

PCR循环反应程序为:

变性:94℃,2min;循环反应:94℃,30s,54℃,50s,72℃,70s,  共35个循环;最后延伸:72℃,7min。

3.权利要求1所述的建立油菜细胞质类型目标基因特异PCR标记的方 法在鉴定油菜细胞质类型中的应用,其特征在于,按以下步骤进行:

(a)以待测油菜基因组DNA为模板,重复权利要求1中所述的一步 多重PCR扩增;

(b)检测PCR扩增产物,取步骤(a)中的5μlPCR产物用2%的琼脂 糖电泳,100V电压下电泳35min左右,电泳缓冲液为TAE;溴化乙锭染色; 用凝胶成像系统观察照相;

(c)将步骤(b)中得到的电泳结果与权利要求1建立的特异PCR标 记进行比对,从而得出待测油菜的细胞质类型。

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