[发明专利]组蛋白去乙酰酶抑制剂异羟肟酸类化合物及其用途无效

专利信息
申请号: 200910034139.7 申请日: 2009-08-20
公开(公告)号: CN101648924A 公开(公告)日: 2010-02-17
发明(设计)人: 吉民;魏红涛;吴晓晴 申请(专利权)人: 苏州东南药物研发有限责任公司
主分类号: C07D271/06 分类号: C07D271/06;C07D413/04;A61K31/4245;A61K31/4439;A61P35/00;A61P35/02
代理公司: 苏州创元专利商标事务所有限公司 代理人: 范 晴
地址: 215123江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 组蛋白 乙酰 抑制剂 异羟肟酸类 化合物 及其 用途
【说明书】:

技术领域

发明属于制药技术领域,具体涉及一类异羟肟酸类组蛋白去乙酰化酶 抑制剂及其用途。

背景技术

包括肿瘤在内许多疾病的形成是一个相当复杂的过程,涉及到各种基因 如何响应内外环境的变化,从而实现在时间和空间上表达的调控。近年来遗 传学中兴起的一个前沿领域——表观遗传学(Epigenetics)为解答这些问题 提供了新思路。表观遗传的分子基础主要涉及到两个方面:一个是针对DNA 的甲基化修饰,另一个是针对染色质组蛋白的乙酰化修饰。除了DNA序列 作为遗传编码外,表观基因机制是基因表达和随后的蛋白质合成的最基本的 调节因素。在真核细胞中,在G0相,DNA被核小体紧密填充,以致于DNA 不能接近转录元件。组蛋白乙酰化反应是一个决定性的表观基因过程,可以 重塑转录元件与DNA的接近能力,从而引发基因表达。现在有大量的证据 表明,包围DNA的染色质蛋白重建是基因调控表观遗传学的根本机制,这 包括组蛋白尾部可逆的转录后修饰,如:赖氨酸残基乙酰化、赖氨酸残基和 精氨酸残基的甲基化、丝氨酸残基的磷酸化、赖氨酸残基的泛素化和类泛素 化。其中,组蛋白的乙酰化修饰最为普遍。组蛋白的乙酰化修饰在基因表达 调控中发挥作用。组蛋白在体内的乙酰化作用发生在蛋白质N端遗传保守的 赖氨酸氨基上,但组蛋白H3和H4的乙酰化修饰比H2A和H2B更具广泛 性。组蛋白H3乙酰化的重要位点是Lys9和Lys14,组蛋白H4的乙酰化位 点是Lys5、Lys8、Lys12和Lys16。

组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylase,HDAC)和组蛋白乙酰基转移酶 (histone aceyl transferase,HAT)决定组蛋白的乙酰化。核心组蛋白的乙 酰化水平是HDACs和HATs共同调控的结果。HDAC是多蛋白质复合物的 催化亚单位,参与组蛋白和非组蛋白的蛋白质去乙酰化。HDAC介导核小体 结构改变和调节基因表达,参与细胞周期进程和分化,并且与多种疾病如癌 症、急性髓性白血病、病毒和感染等的发生与发展有关。一般情况下,组蛋 白乙酰化水平增强与基因转录活性的增强有关,而乙酰化水平过低与基因表 达抑制有关。

通过对组蛋白的化学修饰,能够使核小体的构型改变。对组蛋白的修饰 作用发生在蛋白质N端遗传保守的赖氨酸氨基上。这些赖氨酸残基在生理 pH条件下带正电荷,带正电荷的赖氨酸残基与DNA磷酸根骨架的氧负离子 相互作用,使得DNA被组蛋白包围得更紧密。HAT将乙酰辅酶A(乙酰CoA) 乙酰基部分转移到核心组蛋白氨基末端上特定Lys残基的ε-氨基基团。氨基 上的正电荷被消除,这时DNA分子本身所带有的负电荷有利于DNA构象的 展开,核小体的结构变得松弛。这种松弛的结构促进了转录因子和协同转录 因子与DNA分子的接触,因此组蛋白乙酰化可以激活特定基因的转录过程。 HDAC则移去组蛋白Lys残基上的乙酰基,恢复组蛋白的正电性,带正电荷 的Lys残基与DNA分子的电性相反,增加了DNA与组蛋白之间的吸引力, 使启动子不易接近转录调控元件,从而抑制转录。

HDAC和HAT都不直接与DNA结合。HAT与其他组蛋白乙酰化酶和 转录因子形成复合物,而HDAC是作为与其它转录共抑制物的复合物被募 集的。组蛋白的活性是通过转录后修饰来调控的。HDAC1和HDAC2的磷 酸化反应导致HDAC活性增加。HDAC不但使组蛋白发生去乙酰作用,而 且可以使非组蛋白发生去乙酰作用,如p53和GATA-1。乙酰化的p53显示 其与靶序列有较强的亲和力。

许多研究已证实了组蛋白高/低乙酰化在肿瘤发生中起重要作用。一方 面,人们发现,组蛋白乙酰化和脱乙酰化的变化与肿瘤细胞的形态变化有关; 另一方面,HAT(例如p300/CBP、pCAF、ACTR等)或HDAC可与一些 癌基因和抑癌基因(如参与细胞周期调控的有P53、Rb、p16、p21、p27等 抑癌基因)产物相互作用,从而修饰或介导这些产物对与细胞分化和细胞增 殖有关的基因转录的作用。通过对去乙酰化的抑制作用,可以导致染色质过 乙酰化,促进癌细胞的基因活化,从而导致细胞分化或死亡。

HDAC抑制剂的抗肿瘤机制有赖于基因表达的调控,大量体内和体外实 验证实其抗肿瘤机制有以下几点。

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