[发明专利]乙型肝炎病毒YMDD基序突变检测特异性引物、液相芯片及方法有效
申请号: | 200910041795.X | 申请日: | 2009-08-11 |
公开(公告)号: | CN101633963A | 公开(公告)日: | 2010-01-27 |
发明(设计)人: | 许嘉森;杨惠夷;何嘉英 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙型肝炎 病毒 ymdd 突变 检测 特异性 引物 芯片 方法 | ||
1.一种乙型肝炎病毒YMDD基序突变检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
(1).ASPE引物:每种ASPE引物由3’端的针对目的基序突变的特异性引物序列和5’端的tag 序列组成,所述针对目的基序突变的特异性引物序列包括有:分别针对rtL80I/V的SEQ ID NO.1-4;分别针对rtV173L的SEQ ID NO.5-7;分别针对rtL180M的SEQ ID NO.8-10; 分别针对rtA181V/T的SEQ ID NO.11-19;分别针对rtM204V/I/S的SEQ ID NO.20-29;和/ 或分别针对rtN236T的SEQ ID NO.30-33;所述对应的tag序列选自SEQ ID NO.34-66;
(2).分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列与(1)中所选的tag序列互补 配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.67-99,上述每种微球具有不同颜色编码;
(3).用于扩增具有突变位点rtL80I/V、rtV173L、rtL180M、rtA181V/T、rtM204V/I/S、 和/或rtN236T的目标序列的引物,所述用于扩增目标序列的引物包括为:SEQ ID NO.100~ SEQ ID NO.101;和/或SEQ ID NO.102~SEQ ID NO.103。
2.根据权利要求1所述的乙型肝炎病毒YMDD基序突变检测液相芯片,其特征是,主要包括 有:
(1).ASPE引物,包括有:针对rtL80I/V的由SEQ ID NO.1和34组成的序列、由SEQ ID NO.2 和35组成的序列、由SEQ ID NO.3和36组成的序列、和由SEQ ID NO.4和37组成的序列; 分别针对rtV173L的由SEQ ID NO.5和38组成的序列、由SEQ ID NO.6和39组成的序列和 由SEQ ID NO.7和40组成的序列;分别针对rtL180M的由SEQ ID NO.8和41组成的序列、 由SEQ ID NO.9和42组成的序列和由SEQ ID NO.10和43组成的序列;分别针对rtA181V/T 的由SEQ ID NO.11和44组成的序列、由SEQ ID NO.12和45组成的序列、由SEQ ID NO.13 和46组成的序列、由SEQ ID NO.14和47组成的序列、由SEQ ID NO.15和48组成的序列、 由SEQ ID NO.16和49组成的序列、由SEQ ID NO.17和50组成的序列、由SEQ ID NO.18 和51组成的序列和由SEQ IDNO.19和52组成的序列;分别针对rtM204V/I/S的由SEQ ID NO.20和53组成的序列、由SEQ ID NO.21和54组成的序列、由SEQ ID NO.22和55组成的 序列、由SEQ ID NO.23和56组成的序列、由SEQ ID NO.24和57组成的序列、由SEQ ID NO.25和58组成的序列、由SEQ ID NO.26和59组成的序列、由SEQ ID NO.27和60组成的 序列、由SEQ ID NO.28和61组成的序列和由SEQ ID NO.29和62组成的序列;和/或分别针 对rtN236T的由SEQ ID NO.30和63组成的序列、由SEQ ID NO.31和64组成的序列、由SEQ ID NO.32和65组成的序列和由SEQ ID NO.33和66组成的序列;
(2).分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列与(1)中所选的tag序列互补 配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.67-99,上述每种微球具有不同颜色编码;
(3).用于扩增具有突变位点rtL80I/V、rtV173L、rtL180M、rtA181V/T、rtM204V/I/S、和/ 或rtN236T的目标序列的引物,所述引物为:SEQ ID NO.100~SEQ ID NO.101;和/ 或SEQ ID NO.102~SEQ ID NO.103。
3.根据权利要求1-2任一项所述的乙型肝炎病毒YMDD基序突变检测液相芯片,其特征是, 所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列。
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