[发明专利]按毕赤酵母偏爱密码子设计人乙醛脱氢酶2序列有效
申请号: | 200910062717.8 | 申请日: | 2009-06-16 |
公开(公告)号: | CN101649323A | 公开(公告)日: | 2010-02-17 |
发明(设计)人: | 赵玉凤;吴元欣;雷明科;邓凡;池汝安;黄锟;赵锦 | 申请(专利权)人: | 武汉工程大学 |
主分类号: | C12N15/53 | 分类号: | C12N15/53;C12R1/84 |
代理公司: | 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 | 代理人: | 唐万荣 |
地址: | 430074湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 按毕赤 酵母 偏爱 密码子 设计人 乙醛 脱氢酶 序列 | ||
1.按毕赤酵母偏爱密码子设计人乙醛脱氢酶2序列的方法,其特征在于:按照毕赤酵母偏好性设计的DNA分子,该分子编码具有与人乙醛脱氢酶2基因gene ID 217编码的蛋白在氨基酸水平相同的核苷酸序列,所述的gene ID 217来自GenBank数据库;
所述的按毕赤酵母偏爱密码子设计的人乙醛脱氢酶2基因序列是指在人ALDH2基因gene ID 217基础上,删除UTR和信号肽并加上内切酶EcoR I和内切酶Not I酶切位点,再根据毕赤酵母密码子用法将编码Ala的密码子GCG替换为GCU,将编码Arg的密码子CGC和CGG替换为AGA、AGG、CGU和CGA;共修改了28个碱基得到目的序列ALDH2;具体序列如下:
CGGAATTCTCAGCCGCCGCCACCCAGGCCGTGCCTGCCCCCAACCAGCAGCCCGAGGTCT 60
TCTGCAACCAGATTTTCATAAACAATGAATGGCACGATGCCGTCAGCAGAAAAACATTCC 120
CCACCGTCAATCCGTCCACTGGAGAGGTCATCTGTCAGGTAGCTGAAGGGGACAAGGAAG 180
ATGTGGACAAGGCAGTGAAGGCCGCCAGAGCCGCCTTCCAGCTGGGCTCACCTTGGAGAC 240
GTATGGACGCATCACACAGAGGCCGACTGCTGAACAGACTGGCCGATCTGATCGAGAGGG 300
ACAGAACCTACCTGGCTGCCTTGGAGACCCTGGACAATGGCAAGCCCTATGTCATCTCCT 360
ACCTGGTGGATTTGGACATGGTCCTCAAATGTCTCAGATATTATGCCGGCTGGGCTGATA 420
AGTACCACGGGAAAACCATCCCCATTGACGGAGACTTCTTCAGCTACACAAGGCATGAAC 480
CTGTGGGGGTGTGCGGGCAGATCATTCCGTGGAATTTCCCGCTCCTGATGCAAGCATGGA 540
AGCTGGGCCCAGCCTTGGCAACTGGAAACGTGGTTGTGATGAAGGTAGCTGAGCAGACAC 600
CCCTCACCGCCCTCTATGTGGCCAACCTGATCAAGGAGGCTGGCTTTCCCCCTGGTGTGG 660
TCAACATTGTGCCTGGATTTGGCCCCACGGCTGGGGCCGCCATTGCCTCCCATGAGGATG 720
TGGACAAAGTGGCATTCACAGGCTCCACTGAGATTGGCCGTGTAATCCAGGTTGCTGCTG 780
GGAGCAGCAACCTCAAGAGAGTGACCTTGGAGCTGGGGGGGAAGAGCCCCAACATCATCA 840
TGTCAGATGCCGATATGGATTGGGCCGTGGAACAGGCCCACTTCGCCCTGTTCTTCAACC 900
AGGGCCAGTGCTGCTGTGCCGGCTCCAGAACCTTCGTGCAGGAGGACATCTATGATGAGT 960
TTGTGGAGCGAAGCGTTGCCAGAGCCAAGTCTCGTGTGGTCGGGAACCCCTTTGATAGCA 1020
AGACCGAGCAGGGGCCGCAGGTGGATGAAACTCAGTTTAAGAAGATCCTCGGCTACATCA 1080
ACACGGGGAAGCAAGAGGGGGCTAAGCTGCTGTGTGGTGGGGGCATTGCTGCTGACCGTG 1140
GTTACTTCATCCAGCCCACTGTGTTTGGAGATGTGCAGGATGGCATGACCATCGCCAAGG 1200
AGGAGATCTTCGGGCCAGTGATGCAGATCCTGAAGTTCAAGACCATAGAGGAGGTTGTTG 1260
GGAGAGCCAACAATTCCACGTACGGGCTGGCCGCAGCTGTCTTCACAAAGGATTTGGACA 1320
AGGCCAATTACCTGTCCCAGGCCCTCCAGGCTGGCACTGTGTGGGTCAACTGCTATGATG 1380
TGTTTGGAGCCCAGTCACCCTTTGGTGGCTACAAGATGTCGGGGAGTGGCAGGGAGTTGG 1440
GCGAGTACGGGCTGCAGGCATACACTGAAGTGAAAACTGTCACAGTCAAAGTGCCTCAGA 1500
AGAACTCAGCGGCCGA 1516。
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