[发明专利]按毕赤酵母偏爱密码子设计人乙醛脱氢酶2序列有效

专利信息
申请号: 200910062717.8 申请日: 2009-06-16
公开(公告)号: CN101649323A 公开(公告)日: 2010-02-17
发明(设计)人: 赵玉凤;吴元欣;雷明科;邓凡;池汝安;黄锟;赵锦 申请(专利权)人: 武汉工程大学
主分类号: C12N15/53 分类号: C12N15/53;C12R1/84
代理公司: 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 代理人: 唐万荣
地址: 430074湖北*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 按毕赤 酵母 偏爱 密码子 设计人 乙醛 脱氢酶 序列
【权利要求书】:

1.按毕赤酵母偏爱密码子设计人乙醛脱氢酶2序列的方法,其特征在于:按照毕赤酵母偏好性设计的DNA分子,该分子编码具有与人乙醛脱氢酶2基因gene ID 217编码的蛋白在氨基酸水平相同的核苷酸序列,所述的gene ID 217来自GenBank数据库;

所述的按毕赤酵母偏爱密码子设计的人乙醛脱氢酶2基因序列是指在人ALDH2基因gene ID 217基础上,删除UTR和信号肽并加上内切酶EcoR I和内切酶Not I酶切位点,再根据毕赤酵母密码子用法将编码Ala的密码子GCG替换为GCU,将编码Arg的密码子CGC和CGG替换为AGA、AGG、CGU和CGA;共修改了28个碱基得到目的序列ALDH2;具体序列如下:

CGGAATTCTCAGCCGCCGCCACCCAGGCCGTGCCTGCCCCCAACCAGCAGCCCGAGGTCT  60

TCTGCAACCAGATTTTCATAAACAATGAATGGCACGATGCCGTCAGCAGAAAAACATTCC  120

CCACCGTCAATCCGTCCACTGGAGAGGTCATCTGTCAGGTAGCTGAAGGGGACAAGGAAG  180

ATGTGGACAAGGCAGTGAAGGCCGCCAGAGCCGCCTTCCAGCTGGGCTCACCTTGGAGAC  240

GTATGGACGCATCACACAGAGGCCGACTGCTGAACAGACTGGCCGATCTGATCGAGAGGG  300

ACAGAACCTACCTGGCTGCCTTGGAGACCCTGGACAATGGCAAGCCCTATGTCATCTCCT  360

ACCTGGTGGATTTGGACATGGTCCTCAAATGTCTCAGATATTATGCCGGCTGGGCTGATA  420

AGTACCACGGGAAAACCATCCCCATTGACGGAGACTTCTTCAGCTACACAAGGCATGAAC  480

CTGTGGGGGTGTGCGGGCAGATCATTCCGTGGAATTTCCCGCTCCTGATGCAAGCATGGA  540

AGCTGGGCCCAGCCTTGGCAACTGGAAACGTGGTTGTGATGAAGGTAGCTGAGCAGACAC  600

CCCTCACCGCCCTCTATGTGGCCAACCTGATCAAGGAGGCTGGCTTTCCCCCTGGTGTGG  660

TCAACATTGTGCCTGGATTTGGCCCCACGGCTGGGGCCGCCATTGCCTCCCATGAGGATG  720

TGGACAAAGTGGCATTCACAGGCTCCACTGAGATTGGCCGTGTAATCCAGGTTGCTGCTG  780

GGAGCAGCAACCTCAAGAGAGTGACCTTGGAGCTGGGGGGGAAGAGCCCCAACATCATCA  840

TGTCAGATGCCGATATGGATTGGGCCGTGGAACAGGCCCACTTCGCCCTGTTCTTCAACC  900

AGGGCCAGTGCTGCTGTGCCGGCTCCAGAACCTTCGTGCAGGAGGACATCTATGATGAGT  960

TTGTGGAGCGAAGCGTTGCCAGAGCCAAGTCTCGTGTGGTCGGGAACCCCTTTGATAGCA  1020

AGACCGAGCAGGGGCCGCAGGTGGATGAAACTCAGTTTAAGAAGATCCTCGGCTACATCA  1080

ACACGGGGAAGCAAGAGGGGGCTAAGCTGCTGTGTGGTGGGGGCATTGCTGCTGACCGTG  1140

GTTACTTCATCCAGCCCACTGTGTTTGGAGATGTGCAGGATGGCATGACCATCGCCAAGG  1200

AGGAGATCTTCGGGCCAGTGATGCAGATCCTGAAGTTCAAGACCATAGAGGAGGTTGTTG  1260

GGAGAGCCAACAATTCCACGTACGGGCTGGCCGCAGCTGTCTTCACAAAGGATTTGGACA  1320

AGGCCAATTACCTGTCCCAGGCCCTCCAGGCTGGCACTGTGTGGGTCAACTGCTATGATG  1380

TGTTTGGAGCCCAGTCACCCTTTGGTGGCTACAAGATGTCGGGGAGTGGCAGGGAGTTGG  1440

GCGAGTACGGGCTGCAGGCATACACTGAAGTGAAAACTGTCACAGTCAAAGTGCCTCAGA  1500

AGAACTCAGCGGCCGA                                           1516。

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