[发明专利]按毕赤酵母偏爱密码子设计人乙醛脱氢酶2序列有效

专利信息
申请号: 200910062717.8 申请日: 2009-06-16
公开(公告)号: CN101649323A 公开(公告)日: 2010-02-17
发明(设计)人: 赵玉凤;吴元欣;雷明科;邓凡;池汝安;黄锟;赵锦 申请(专利权)人: 武汉工程大学
主分类号: C12N15/53 分类号: C12N15/53;C12R1/84
代理公司: 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 代理人: 唐万荣
地址: 430074湖北*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 按毕赤 酵母 偏爱 密码子 设计人 乙醛 脱氢酶 序列
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种设计基因序列的方法。

背景技术

随着经济的高速发展,人民生活水平的不断提高,高品质的生活越来越受到人们的关注,这其中最重要的一条就是健康。但是经济的发展又伴随着人们饮食结构的改变,工作、生活压力的增大,运动的减少和居住生活环境的恶化等等对健康不利的因素,各种疾病特别是恶性疾病的发病率有逐年增高的趋势,其中肝癌是我国常见恶性肿瘤之一,死亡率高,在恶性肿瘤死亡顺位中仅次于胃、食道而居第三位,在部份地区的农村中则占第二位,仅次于胃癌,在我国每年死于肝癌约11万人,占全世界肝癌死亡人数的45%。为了预防和治疗这些恶性疾病,全国每年花费大量的人力和物力,但收效甚微。

据统计,全球现在有1500万-2000万人酗酒,其中10%-20%的人有不同程度的酒精性肝病。在我国,也有不少人嗜好饮酒。据报道,适量饮酒对大多数人的健康并没有损害,少量饮用酒精性饮料,如葡萄酒,对身体还有一定的好处。但是,若长期过量饮酒,特别是饮用高度酒,会使肝细胞反复发生脂肪变性、坏死和再生,最终导致肝硬化、肝癌。

另外,根据报道乙醛脱氢酶的补充可以减少心肌缺血/再灌注损伤,减少心肌细胞由于缺氧而引起的凋亡等。许多文献已经表明乙醛脱氢酶的存在对心肌细胞都有良好的保护作用。

基于以上原因,社会迫切的需要一种行之有效的解酒、保肝的保健品出现。今年来出现一些含乙醛脱氢酶的解酒药的报道,但是乙醛脱氢酶至今获得途径的狭窄,成为该类保健品的瓶颈。

发明内容

本发明的目的在于提供一种按毕赤酵母偏爱密码子设计人乙醛脱氢酶2序列的方法,该基因序列在毕赤酵母中可表达。

为实现上述目的,本发明的技术方案是:按毕赤酵母偏爱密码子设计人乙醛脱氢酶2序列的方法,其特征在于:按照毕赤酵母偏好性设计的DNA分子,该分子编码具有与人乙醛脱氢酶2基因gene ID 217编码的蛋白在氨基酸水平相同的核苷酸序列,所述的gene ID 217来自GenBank数据库。

本发明按照毕赤酵母偏好性,通过重叠延伸法合成了ALDH2序列;该序列编码的蛋白具有与野生型人ALDH2在氨基酸水平上具有相同功能。

所述的野生型人ALDH2为gene ID 217编码的氨基酸序列的多肽。

所述的按毕赤酵母偏爱密码子设计的人乙醛脱氢酶2基因序列是指在人ALDH2基因(gene ID 217)基础上[由GenBank上人ALDH2DNA(gene ID217)序列],删除UTR和信号肽并加上内切酶EcoR I和内切酶Not I酶切位点,再根据毕赤酵母密码子用法将编码Ala的密码子GCG替换为GCU,将编码Arg的密码子CGC和CGG替换为AGA、AGG、CGU和CGA;共修改了28个碱基得到目的序列ALDH2;具体序列如下:

CGGAATTCTCAGCCGCCGCCACCCAGGCCGTGCCTGCCCCCAACCAGCAGCCCGAGGTCT  60

TCTGCAACCAGATTTTCATAAACAATGAATGGCACGATGCCGTCAGCAGAAAAACATTCC  120

CCACCGTCAATCCGTCCACTGGAGAGGTCATCTGTCAGGTAGCTGAAGGGGACAAGGAAG  180

ATGTGGACAAGGCAGTGAAGGCCGCCAGAGCCGCCTTCCAGCTGGGCTCACCTTGGAGAC  240

GTATGGACGCATCACACAGAGGCCGACTGCTGAACAGACTGGCCGATCTGATCGAGAGGG  300

ACAGAACCTACCTGGCTGCCTTGGAGACCCTGGACAATGGCAAGCCCTATGTCATCTCCT  360

ACCTGGTGGATTTGGACATGGTCCTCAAATGTCTCAGATATTATGCCGGCTGGGCTGATA  420

AGTACCACGGGAAAACCATCCCCATTGACGGAGACTTCTTCAGCTACACAAGGCATGAAC  480

CTGTGGGGGTGTGCGGGCAGATCATTCCGTGGAATTTCCCGCTCCTGATGCAAGCATGGA  540

AGCTGGGCCCAGCCTTGGCAACTGGAAACGTGGTTGTGATGAAGGTAGCTGAGCAGACAC  600

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