[发明专利]与衰老相关退行性疾病的线粒体ND3基因SNP G10320A分子标记、检测方法及试剂盒

说明书

技术领域

本发明涉及一种检测线粒体ND3基因单核苷酸多态性(SNP)的方法，具体地说是一种检测线粒体ND3基因mtDNA 10320位点的SNP的方法以及检测该位点SNP的试剂盒和该试剂盒的应用。

背景技术

健康长寿一直是各国研究的热点，这是由于长寿老人在衰老的过程中并不患衰老相关的退行性疾病如中风，心血管疾病，2型糖尿病，帕金森病，老年性痴呆，癌症等，而健康的生活。这些衰老相关的退行性疾病不仅给患者带来沉重的经济负担、影响生活质量，同时由于我国自1998年进入老龄化社会以来，老龄人口占全人口构成比(10％)在逐年增高，预计到2020年，我国大于60岁的人口将占全人口的27％，所以也会给社会造成巨大的压力，将会成为影响我国社会福利和卫生经济的重大医学问题。长寿的机制研究可以为衰老相关疾病的病理机制提供线索并可以预测衰老相关疾病的发病风险。

与患衰老相关的退行性疾病是受多个遗传和环境因素影响的一种复杂遗传性状，包括基因之间及基因和环境之间的相互作用。基因和(或)环境通过减少衰老相关的退行性疾病或减缓衰老来促进长寿。但是影响长寿的确切因素迄今为止尚未阐明。双生子研究表明长寿表型25％是由遗传因素决定的(Christensen K，Johnson TE，Vaupel JW.The quest for genetic determinants of human longevity：challengesand insights.Nature，2006；7：436-448)。同时，家系分析中也表明百岁老人的兄弟姐妹的寿命要比一般人群高约4倍(Christensen K，Johnson TE，Vaupel JW.Thequest for genetic determinants of human longevity：challenges andinsights.Nature，2006；7：436-448)。这些研究证明了遗传因素在长寿的机制中起到重要作用。并且，在病例对照的关联研究中发现了与长寿相关的一些遗传标记，如4号染色体和一些基因如，APOE，HLA，mtDNA等。

由于线粒体在细胞中的重要作用及线粒体的突变可以引起衰老相关的疾病(Audesh Bhat，Anil Koul，Swarkar Sharma，et al.The possible role of 10398Aand 16189C mtDNA variants in providing susceptibility to T2DM in two NorthIndian populations：a replicative study.Hum Genet，2007，120：821-826.)，因此线粒体DNA可能在长寿的机制中起到重要的作用。更重要的是衰老相关的疾病多表现为母系遗传，这与线粒体DNA的遗传方式非常相似。这样，我们推测长寿人群是遗传了母亲的线粒体DNA，而这些线粒体DNA的表达在功能上可以保护长寿人群不得衰老相关疾病，从而延长了其寿命。这样，线粒体DNA变异与衰老相关的退行性疾病关系正在越来越受到研究者的关注。线粒体是细胞浆中的小细胞器，含有自己的双链环状DNA编码氧化磷酸化过程所需的蛋白及合成这些蛋白所需的tRNA和rRNA。每一细胞含有数千个线粒体，每个线粒体中含有2-10个DNA，因此，每个细胞中含有数万个DNA拷贝。目前进行的与衰老相关的退行性疾病因研究多采用关联分析方法，已证明，以SNPs作为基因组标志是有效的。如在日本长寿群体中发现线粒体DNA编码区的SNP5178A与长寿相关(Tanaka，M.，Gong，J.S.，Zhang，J.，Yoneda，M.，andYagi，K.Mitochondrial genotype associated with longevity.Lancet，1998；351，185-186)。此后国内外的许多研究进一步证实了5178A这一突变位点与长寿相关。随后也发现了另一些与长寿相关的SNPs如9055A(Ross OA，McCormack R，Curran MDet al：Mitochondrial DNA polymorphism：its role in longevity of the Irishpopulation.Exp Gerontol 2001；36：1161-1178.)。