[发明专利]中国人群连锁分析SNP标记集合及其使用方法与应用无效
申请号: | 200910087466.9 | 申请日: | 2009-06-25 |
公开(公告)号: | CN102121046A | 公开(公告)日: | 2011-07-13 |
发明(设计)人: | 不公告发明人 | 申请(专利权)人: | 中国科学院北京基因组研究所;首都医科大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
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地址: | 100029 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 中国 人群 连锁 分析 snp 标记 集合 及其 使用方法 应用 | ||
1.一种用于连锁分析的SNP集合,包括至少100个SNP位点,其特征在于:所述的至少100个SNP位点选自人类基因组。
2.根据权利要求1所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的至少100个SNP位点位于人类基因组中的非基因区。
3.根据权利要求2所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的人类基因组为中国人基因组。
4.根据权利要求3所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的中国人基因组为汉族人基因组。
5.根据权利要求4所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的至少100个SNP位点集合为选自说明书附表所示的SNP位点组成的组。
6.根据权利要求4所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的至少100个SNP位点的个数为6001,为说明书附表中的所有SNP位点。
7.根据权利要求4所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的至少100个SNP位点的个数为3000。
8.根据权利要求7所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的用于连锁分析的SNP集合在人类基因组上的平均覆盖密度为1SNP/1Mb。
9.根据权利要求7所述的用于连锁分析的SNP集合,其特征在于:所述的3000个SNP位点集合是指说明书附表中索引是偶数的所有位点。
10.一种用于检测权利要求1-9所述的SNP集合的芯片,其特征在于:所述的芯片可以用于相应SNP位点的基因分型。
11.一种用于检测权利要求1-9所述的SNP集合的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒可以用于所述的SNP位点的基因分型。
12.根据权利要求1-9所述的SNP集合的应用。
13.根据权利要求12所述的应用,其特征在于:所述的应用包含针对所述的SNP集合进行基因分型实验的步骤。
14.根据权利要求13所述的应用,其特征在于:所述的基因分型实验的步骤包括:a)制作基因分型用核苷酸探针和试剂;b)在基因分型系统上把探针和样本杂交并扫描,获得所分析样本在所述SNP位点处的基因型。
15.根据权利要求12-14所述的应用,其特征在于:被检测的样品为中国汉族人样本。
16.根据权利要求1-9所述的SNP集合在人类疾病基因定位中的用途。
17.根据权利要求16所述的用途,其特征在于:所述的用途是用于人类遗传疾病研究中的致病基因定位的连锁分析过程。
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