[发明专利]提取纯化DNA的试剂有效

专利信息
申请号: 200910090335.6 申请日: 2009-08-05
公开(公告)号: CN101613696A 公开(公告)日: 2009-12-30
发明(设计)人: 赵兴春;叶健;姜伯玮 申请(专利权)人: 公安部物证鉴定中心
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C07H21/04
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 代理人: 关 畅;任凤华
地址: 100038北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 提取 纯化 dna 试剂
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域,特别涉及一种提取纯化DNA的试剂。

背景技术

DNA分离纯化是分子生物学实验中非常重要的操作,核酸的质量直接关系到后续操作能否顺利进行。生物学、法医学和基因组学的发展,强化了对从各种生物检材中获得核酸的复杂方法的需求。例如,脱氧核糖核酸提供了广泛的关于遗传起源和遗传多态性信息。这些信息可用于法医遗传学鉴定实践。

目前所存在的各种核酸纯化方法皆可分成以下两大类:液相纯化和固相纯化。在液相纯化中,核酸维持为液体状态,而杂质通过沉淀、离心被除去或者核酸被沉淀出来,而杂质被保留;在固相纯化中,核酸被结合到固相载体上,而杂质被选择性洗脱。例如,采用液相纯化来分离的DNA保留在液相中,而杂质被通过诸如沉淀和/或离心之类的方法除去。在固相纯化中DNA结合到固相载体上,而杂质如RNA、蛋白质和磷脂等被选择性洗脱。在DNA纯化中,如果起始材料包括细胞,液相方法和固相方法都需要细胞或病毒共破裂,或裂解步骤。破裂或裂解步骤产生与污染物如RNA、脂质、碳水化合物、蛋白质等混合的DNA。这种混合物还含有降解DNA的必须被除去和/或灭活以不感染产生基本上未降解的DNA的DNA酶。两个纯化大类以前都利用常规的方法,需要繁琐的步骤,且通常用到有害的试剂,现在也出现了更快速的提取方法,如Chelex-100法,仅需要较少的步骤,且通常较少的有害试剂。

Chelex-100法一种快速液相DNA纯化方法,Chelex-100是一种化学整合树脂,由苯乙烯、二乙烯苯共聚体组成。含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,整合多价金属离子,尤其是选择性整合二价离子,比普通离子交换剂具有更高的金属离子选择性和较强的结合力.能结合许多可能影响一步分析的其他外源物质。通过离心除去Chelex-100颗粒,使这些与Chelex-100结合的物质与DNA分离,防止结合到Chelex中的抑制剂或杂质带到PCR反应中,影响下一步的DNA分析,并通过结合金属离子,防止DNA降解。利用螯合剂去除生物样品中金属杂质而达到纯化的目的。该法首先用去离子水洗涤生物样品,加入螯合树脂的悬浮液56℃孵育一定时间,100℃孵育8分钟,然后通过离心去除杂质。该方法简单、快速(仅涉及到两种试剂的使用)。但该法提取得到的DNA纯度不够,不能满足微量DNA生物样品DNA提取纯化的要求。

固相提取方法近年来发展迅速,在核酸提取领域占有非常重要的地位。这类方法一般需要四个主要步骤:裂解细胞使细胞膜、核膜DNA破裂以释放DNA;释放的DNA与固相载体结合;杂质的洗涤;洗脱而得到纯化的DNA。对于固相DNA纯化,已使用了多种固相载体,如二氧化硅微球、薄膜过滤器、金属氧化物、胶乳沉淀、硅藻土、玻璃粉等。当核酸存在于在高浓度离液盐以及低的pH溶液中时,能够吸附到硅类介质表面,并在低盐高pH溶液中洗脱下来,从而达到提取纯化目的。Vogelstein直接使用玻璃粉从琼脂糖凝胶中提取到DNA,而Marko使用玻璃粉成功提纯质粒DNA。Boom等对该方法加以改进,用二氧化硅和硅藻土为固相吸附剂,用来提取纯化人血清或尿液中的微量病原体基因组DNA。该方法需要六步离心、五种试剂从全血中纯化DNA。

发明内容

本发明的目的在于提供一种提取纯化DNA的试剂。

本发明提供的提取纯化DNA的试剂,由以下物质组成:

预处理裂解液:pH为7.4-8.5,溶剂是水,溶质是如下终浓度的物质:10-100mM缓冲盐,0.5-5g/100ml的表面活性剂,1-100mM的螯合剂,50-150mM的可溶性盐和0.2-4mg/ml的蛋白酶K;

裂解结合液:pH=6.4-7.4,溶剂是水,溶质是如下终浓度的物质:20-150mM的缓冲盐,3-8M的Chaotropic盐,1-10%(体积百分含量)的表面活性剂,0.5-4g/100ml的兼性离子去污剂,10-100mM的螯合剂以及15-30%(体积百分含量)的醇;

洗涤液I:溶剂是水,溶质是如下终浓度的物质:4-6M的Chaotropic盐,25-50%(体积百分含量)的醇和10-100mM的螯合剂;

洗涤液II:75-80%(体积百分含量)乙醇水溶液;

洗脱液:是TE溶液,所述TE溶液的pH为8.0,溶剂是水,溶质是0-20mM的Tris-HCl,0-2mM的EDTA;

磁珠悬浮液:每ml磁珠悬浮液的成分如下:直径为50-1200nm的纳米级硅包被磁性微球50-100mg,其余为水。

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