[发明专利]一种改进的线粒体基因组全序列测定方法无效
申请号: | 200910138177.7 | 申请日: | 2009-04-30 |
公开(公告)号: | CN101875966A | 公开(公告)日: | 2010-11-03 |
发明(设计)人: | 尹绍武;齐兴柱;陈国华;张本;骆剑;霍蕊 | 申请(专利权)人: | 海南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 570228 *** | 国省代码: | 海南;66 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 改进 线粒体 基因组 序列 测定 方法 | ||
1.建立在常规PCR技术基础上的一种改进的线粒体基因组全序列测定方法,包括如下步骤:1)模板的筛选;2)引物的设计;3)总DNA提取、PCR扩增及测序;4)测序结果的序列拼接。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:筛选分类学上属于同一个科的物种线粒体基因组全序列作为模板,其与待测序列同源性75%以上即可。
3.根据权利要求1和2所述的方法,其特征在于:利用Primer Premier 5.0软件进行引物设计,软件Primer Premier 5.0在软件网http://www.premierbiosoft.com/下载,引物设计分2批进行,第一批引物数目为总引物数目的一半,相邻两对引物扩增片段之间的间隔距离为1000-1200bp。
4.根据权利要求1和2所述的方法,其特征在于:第一批引物的PCR产物测序结果与引物设计所用模板经blast软件比较后取代模板序列中相应部位的原有序列。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:以得到的镶嵌有新序列的序列为模板进行第二批引物设计,而且,第二批引物中,每一对引物都必须落在新序列中,而且保证第二批引物的每段PCR产物与模板中的新序列都有一段50-100bp重叠。
6.根据权利要求1和3所述的方法,其特征在于:对于PCR扩增效果不好引物,在其外侧再引入一对PCR引物,进行镶嵌PCR扩增。
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