[发明专利]基因检测方法、基因检测程序和基因检测装置无效
申请号: | 200910150081.2 | 申请日: | 2009-07-09 |
公开(公告)号: | CN101624628A | 公开(公告)日: | 2010-01-13 |
发明(设计)人: | 佐塚直也;浅川刚;白石哲也 | 申请(专利权)人: | 索尼株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G06F19/00;C12M1/34 |
代理公司: | 北京信慧永光知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 陈桂香;武玉琴 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因 检测 方法 程序 装置 | ||
1.一种基因检测方法,其包括以下步骤:
在各测量时间获取多个靶基因的表示表达水平且要进行比较的两个 以上数据;
基于所述两个以上数据中的一个数据的表达水平,把由所获取的两 个以上数据表示的表达水平转换成与所述各测量时间中的一个测量时间 的表达水平的比值;
选取各个所述靶基因的最小比值和最大比值;以及
利用具有所述最小比值的频数分布中的峰值的第一比值和具有所述 最大比值的倒数的频数分布中的峰值的第二比值作为分类边界,对所述 多个靶基因进行分类,其中:
满足所述最大比值小于所述第二比值并且所述最小比值大于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平缺乏变化的基因组;
满足所述最大比值小于所述第二比值并且所述最小比值小于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平显著减少的基因组;
满足所述最大比值大于所述第二比值并且所述最小比值大于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平显著增加的基因组;
满足所述最大比值大于所述第二比值并且所述最小比值小于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平有显著增减或实验不 良的基因组。
2.如权利要求1所述的基因检测方法,其中,所述数据是这样得到 的,即利用传感器来测量由多个核酸探针和靶核酸形成的互补链的量, 根据所述多个核酸探针的各对照物之间的物理量差值来修正所测得的物 理量,然后将修正后的物理量转换成比值。
3.如权利要求2所述的基因检测方法,其中,所述多个核酸探针与 靶细胞中能够表达的全部基因对应。
4.一种基因检测装置,其包括:
获取部,其在各测量时间获取多个靶基因的表示表达水平且要进行 比较的两个以上数据;
转换部,其基于所述两个以上数据中的一个数据的表达水平,把由 所获取的两个以上数据表示的表达水平转换成与所述各测量时间中的一 个测量时间的表达水平的比值;
选取部,其选取各个所述靶基因的最小比值和最大比值;以及
分类部,其利用具有所述最小比值的频数分布中的峰值的第一比值 和具有所述最大比值的倒数的频数分布中的峰值的第二比值作为分类边 界,对所述多个靶基因进行分类,其中:
满足所述最大比值小于所述第二比值并且所述最小比值大于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平缺乏变化的基因组;
满足所述最大比值小于所述第二比值并且所述最小比值小于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平显著减少的基因组;
满足所述最大比值大于所述第二比值并且所述最小比值大于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平显著增加的基因组;
满足所述最大比值大于所述第二比值并且所述最小比值小于所述第 一比值的条件的各个所述靶基因被分配给表达水平有显著增减或实验不 良的基因组。
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