[发明专利]一种乙型肝炎病毒cccDNA双色荧光PCR检测方法及其试剂盒的应用无效
申请号: | 200910157352.7 | 申请日: | 2009-07-27 |
公开(公告)号: | CN101967522A | 公开(公告)日: | 2011-02-09 |
发明(设计)人: | 史成军;徐贵峰;任美峰;刘健翊 | 申请(专利权)人: | 北京索奥生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/93 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 乙型肝炎 病毒 cccdna 荧光 pcr 检测 方法 及其 试剂盒 应用 | ||
1.本发明为一种乙型肝炎病毒cccDNA(HBV cccDNA)双色荧光PCR检测方法及其试剂盒的应用,从外周血或者肝组织等样品中提取DNA,通过双色荧光定量PCR的方法对标本中的HBV cccDNA进行扩增,达到实时快速定量检测之目的。
2.根据权利要求1所述的一种HBV cccDNA双色荧光定量PCR检测方法及其试剂盒,特征在于试剂盒中同时引入了人3-磷酸甘油醛脱氢酶(H-GAPDH)基因作为参照基因,用于HBV cccDNA的检测试验过程的监控。该检测试剂盒的双色荧光PCR特异性引物序列和荧光探针标记如下:
(1)HBV cccDNA:
上游引物:5’-CGACCGACCTTGAGGCATAC-3’;
下游引物:5’-AGAGTAACTCCACAGAT/AGCTCC-3’;
荧光探针:FAM-5’CACCTCTGCCTAATCATCTCTTGTTC 3’-TAMRA;
(2)H-GAPDH:
上游引物:5’-AAGCGTTTTCTCCCTAAAGG-3’;
下游引物:5’-ACAAGCTTTGTACATGGTAT-3’;
荧光探针:VIC-5’CTGAGCTAGGCAGCAGCAAGCATTCC3’-TAMRA。
HBV cccDNA和H-GAPDH的荧光探针分别标记为FAM和VIC,所以称为双色荧光PCR检测方法,淬灭基团均为TAMRA。
3.根据权利要求1所述的双色荧光PCR检测方法及其试剂盒,该试剂盒组成成分包括核酸提取液、Taq酶系、HBV cccDNA双色荧光PCR MIX、经绝对定量的阳性质控品(1×107copies/ml)和阴性质控品等。每个检测反应的PCR MIX由6ul 5×FQPCR buffer、各1ul上游引物(10uM)、各1ul下游引物(10uM)、各0.5ul荧光探针(10uM)、1uldNTPs(10mM)、12ulddH2O组成。其中5×FQ PCR buffer由250mMTris-HCl(pH8.0)、25mM MgCl2、250mM KCl以及10%的DMSO等组成。
4.根据权利要求1所述的一种试剂盒其适用仪器和扩增条件为:ABI PRISM 7700、ABI PRISM5700、ABI GeneAmp 7000、ABI PRISM 7300/7500、MJ Opticon等荧光定量PCR仪扩增条件为93℃→2分钟,然后93℃30秒→55℃45秒(采集荧光信号),40个循环;LightCycler等使用毛细管的仪器扩增条件为93℃→2分钟,然后93℃5秒→58℃45秒(检测荧光信号),共40个循环。
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