[发明专利]狗鱼幼鱼弹状病毒实时荧光RT-PCR检测法和试剂盒无效
申请号: | 200910189339.X | 申请日: | 2009-12-24 |
公开(公告)号: | CN102108414A | 公开(公告)日: | 2011-06-29 |
发明(设计)人: | 卢体康;刘荭;郑晓聪;何俊强;陈红莲 | 申请(专利权)人: | 深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/93 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 罗瑶 |
地址: | 518001 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 狗鱼 幼鱼 弹状病毒 实时 荧光 rt pcr 检测 试剂盒 | ||
1.狗鱼幼鱼弹状病毒(Pike fry rhabdovirus,PFRV)的实时荧光RT-PCR检测方法,所述方法包括利用特异性探针和引物对,以病毒基因组RNA为模板进行实时荧光RT-PCR反应,其特征在于:所述引物对为能扩增出狗鱼幼鱼弹状病毒G基因的基因片段的引物对,并且分别含有Seq ID No.1和Seq ID No.2所示的序列;
Seq ID No.1:5’-AGGCAATCATTCAATTTGGCTAAC-3’
Seq ID No.2:5’-CATTTCCATACATGGTCCCTGTTG-3’
所述探针为能与狗鱼幼鱼弹状病毒G基因位于所述引物对之间的序列相同或互补、且长度为20~40bp的寡核苷酸序列,并且所述探针的5’端和3’端分别标记有荧光报告基团和荧光淬灭基团。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于:所述探针含有SeqID No.3所示的序列,
Seq ID No.3:5’-CCTAAAAGAGGAATGCGACCAACACATCG-3’。
3.根据权利要求1或2所述的检测方法,其特征在于:所述探针5’端标记的荧光报告基团为HEX,3’端标记的荧光淬灭基团为TAMRA。
4.根据权利要求1~3任意一项所述的检测方法,其特征在于:所述RT-PCR反应的引物终浓度为0.9~1.1μmol/L,探针终浓度为0.4~0.6μmol/L。
5.根据权利要求1~4任意一项所述的检测方法,其特征在于:所述RT-PCR的反应的退火温度为55℃~60℃。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于:所述RT-PCR的反应条件包括:50℃反转录30min,94℃预变性4min,40个循环:94℃变性15s,60℃退火及收集荧光信号1min。
7.狗鱼幼鱼弹状病毒(Pike fry rhabdovirus,PFRV)的检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有能扩增出狗鱼幼鱼弹状病毒G基因的基因片段的引物对,所述引物对分别含有Seq ID No.1和Seq ID No.2所示的序列,
Seq ID No.1:5’-AGGCAATCATTCAATTTGGCTAAC-3’
Seq ID No.2:5’-CATTTCCATACATGGTCCCTGTTG-3’。
8.根据权利要求7所述的检测试剂盒,其特征在于:所述检测试剂盒用于实时荧光RT-PCR检测,并且所述试剂盒还含有能与狗鱼幼鱼弹状病毒G基因位于所述引物对之间的序列相同或互补、且长度为20~40bp的寡核苷酸探针,并且所述探针的5’端和3’端分别标记有荧光报告基团和荧光淬灭基团。
9.根据权利要求8所述的检测试剂盒,其特征在于:所述探针含有Seq ID No.3所示的序列,
Seq ID No.3:5’-CCTAAAAGAGGAATGCGACCAACACATCG-3’。
10.根据权利要求9所述的检测试剂盒,其特征在于:所述探针5’端标记的荧光报告基团为HEX,3’端标记的荧光淬灭基团为TAMRA。
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