[发明专利]TPMT基因SNP检测的特异性序列、液相芯片及方法有效
申请号: | 200910193154.6 | 申请日: | 2009-10-19 |
公开(公告)号: | CN101671739A | 公开(公告)日: | 2010-03-17 |
发明(设计)人: | 许嘉森;何嘉英;杨惠夷 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | tpmt 基因 snp 检测 特异性 序列 芯片 方法 | ||
1.一种TPMT基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
(1).针对TPMT基因3种型别的SNP位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物, 每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组 成,针对不同野生型和突变型的特异性引物序列分别选自:针对G238C位点的SEQ ID NO.7 及SEQ ID NO.8、针对G460A位点的SEQ ID NO.9及SEQID NO.10、和/或针对A719G位点 的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12;所述tag序列选自SEQID NO.1~SEQ ID NO.6中的序 列;
(2).分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列能相应地与(1)中 所选tag序列互补配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.18中的序列;
(3).用于扩增具有G238C、G460A和/或A719G SNP位点的TPMT基因目标序列的引物对, 所述扩增用的引物对包括有针对G238C SNP位点的SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20,针对 G460A SNP位点的SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22,和/或针对A719G SNP位点的SEQ ID NO.23 和SEQ ID NO.24。
2.根据权利要求1所述的TPMT基因SNP检测液相芯片,其特征是,所述野生型及突变型特 异性ASPE引物选自:针对G238C SNP位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.7组成的序列,及 由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.8组成的序列;针对G460A SNP位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.9组成的序列,及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.10组成的序列;和/或针对A719G SNP 位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.11组成的序列,及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.12 组成的序列。
3.根据权利要求1-2任一项所述的TPMT基因SNP检测液相芯片,其特征是,所述anti-tag 序列与微球连接中间还设有间隔臂序列。
4.根据权利要求3所述的TPMT基因SNP检测液相芯片,其特征是,所述间隔臂序列为5-10 个T。
5.用于TPMT基因SNP检测的ASPE引物中的特异性引物序列,其特征是,所述特异性引物序 列为:针对G238C野生型和突变型的SNP位点的SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8;针对G460A野 生型和突变型的SNP位点的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10;或针对A719G野生型和突变型 的SNP位点的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12。
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