[发明专利]靶向药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片和检测方法

权利要求书

1.一种受体酪氨酸激酶抑制剂类靶向药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，其特征是，主要包括有：

(1)与胺基修饰的支持探针偶联的微球，每条支持探针主要包括5’端的间隔臂序列和3’端的与支持延伸探针互补配对的特异性序列P1，所述支持探针选自SEQ.NO.1-SEQ.NO.10，每个目标基因选用一种微球，每种微球具有不同的荧光编码；

(2)连接支持探针与目标基因mRNA的支持延伸探针，每条支持延伸探针主要包括5’端能与对应的目标基因mRNA结合的特异性序列P2、间隔臂序列、3’端能与对应的支持探针的特异性序列P1互补配对的P3序列，所述支持延伸探针的特异性序列P2包括有：针对EGFR基因的选自SEQ.NO.11-SEQ.NO.16中的2条或2条以上、针对KIT基因的选自SEQ.NO.17-SEQ.NO.22中的2条或2条以上、针对IGF-1R基因的选自SEQ.NO.23-SEQ.NO.28中的2条或2条以上、针对VEGFR1基因的选自SEQ.NO.29-SEQ.NO.33中的2条或2条以上、针对VEGFR2基因的选自SEQ.NO.34-SEQ.NO.38中的2条或2条以上、针对PDGFRB基因的选自SEQ.NO.39-SEQ.NO.43中的2条或2条以上、和/或针对HER-2基因的选自SEQ.NO.44-SEQ.NO.48中的2条或2条以上；以及所述支持延伸探针的特异性序列P2还包括有：针对B2M基因的选自SEQ.NO.49-SEQ.NO.53中的2条或2条以上、针对TFRC基因的选自SEQ.NO.54-SEQ.NO.58中的2条或2条以上、和针对TBP基因的选自SEQ.NO.59-SEQ.NO.63中的2条或2条以上；

(3)扩增延伸探针，每条扩增延伸探针包括有5’端能与目标基因mRNA结合的特异性序列P4、间隔臂序列、3’端序列P5，3’端还修饰有生物素；所述扩增延伸探针的特异性序列P4包括有：针对EGFR基因的选自SEQ.NO.64-SEQ.NO.76中的5条或5条以上、针对KIT基因的选自SEQ.NO.77-SEQ.NO.86中的5条或5条以上、针对IGF-1R基因的选自SEQ.NO.87-SEQ.NO.97中的5条或5条以上、针对VEGFR1基因的选自SEQ.NO.98-SEQ.NO.107中的5条或5条以上、针对VEGFR2基因的选自SEQ.NO.108-SEQ.NO.117中的5条或5条以上、针对PDGFRB基因的选自SEQ.NO.118-SEQ.NO.127中的5条或5条以上、针对HER-2基因的选自SEQ.NO.128-SEQ.NO.137中的5条或5条以上；以及所述扩增延伸探针的特异性序列P4还包括有：针对B2M基因的选自SEQ.NO.138-SEQ.NO.147中的5条或5条以上、针对TFRC基因的选自SEQ.NO.148-SEQ.NO.157中的5条或5条以上、和针对TBP基因的选自SEQ.NO.158-SEQ.NO.167中的5条或5条以上；所述P5为不存在发夹结构、探针内部和探针间不形成二聚体、不存在错配、与P1、P2、P3、P4和总mRNA之间均不存在非特异性结合的序列。

2.根据权利要求1所述的受体酪氨酸激酶抑制剂类靶向药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，其特征是，还包括有填充序列，包括：针对EGFR基因的SEQ.NO.168、针对KIT基因的SEQ.NO.169、针对IGF-1R基因的选自SEQ.NO.170-SEQ.NO.175中的1条或1条以上、针对VEGFR2基因的选自SEQ.NO.176-SEQ.NO.181中的1条或1条以上、针对PDGFRB基因的选自SEQ.NO.182-SEQ.NO.187中的1条或1条以上、针对HER-2基因的选自SEQ.NO.188-SEQ.NO.191中的1条或1条以上；针对B2M基因的选自SEQ.NO.192-SEQ.NO.199中的1条或多条、和/或针对TFRC基因的选自SEQ.NO.200-SEQ.NO.203中的1条或多条。

3.根据权利要求1或2所述的受体酪氨酸激酶抑制剂类靶向药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂序列为5-10个T。

4.根据权利要求1所述的受体酪氨酸激酶抑制剂类靶向药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，其特征是，所述P5的组成为CCTATGCCTCCCGTGTCTA。