[发明专利]一种CYP3A4基因SNP检测特异性引物、液相芯片及方法无效
申请号: | 200910214369.1 | 申请日: | 2009-12-29 |
公开(公告)号: | CN101812511A | 公开(公告)日: | 2010-08-25 |
发明(设计)人: | 许嘉森;何嘉英;曾涛 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 cyp3a4 基因 snp 检测 特异性 引物 芯片 方法 | ||
1.一种CYP3A4基因SNP检测液相芯片,其特征在于:主要包括有:
(1) 针对每种型别的SNP位点分别设计的野生型和突变型ASPE引物对,每种ASPE引物对由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列分别选自:针对CYP3A4*1B SNP位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、针对CYP3A4*2 SNP位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、针对CYP3A4*3SNP位点的SEQID NO.25及SEQ ID NO.26、针对CYP3A4*4SNP位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、针对CYP3A4*5SNP位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、针对CYP3A4*6SNP位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32、针对CYP3A4*15SNP位点的SEQ ID NO.33及SEQ IDNO.34、针对CYP3A4*17SNP位点的SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36、针对CYP3A4*18SNP位点的SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38、和针对CYP3A4*19SNP位点的SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40中的一对或多对;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.20中的序列;
(2)分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列能相应地与(1)中所选tag序列互补配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.41~SEQ ID NO.60中的序列;
(3)用于扩增具有CYP3A4*1B、CYP3A4*2、CYP3A4*3、CYP3A4*4、CYP3A4*5、CYP3A4*6、CYP3A4*15、CYP3A4*17、CYP3A4*18和CYP3A4*19中的一个或多个SNP位点的CYP3A4基因目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的CYP3A4基因SNP检测液相芯片,其特征在于:所述野生型及突变型ASPE引物对选自:针对CYP3A4*1B SNP位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.21组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.22组成的序列、针对CYP3A4*2 SNP位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.23组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.24组成的序列、针对CYP3A4*3SNP位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.25组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.26组成的序列、针对CYP3A4*4 SNP位点的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.27组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.28组成的序列、针对CYP3A4*5 SNP位点的由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.29组成的序列及由SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.30组成的序列、针对CYP3A4*6 SNP位点的由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.31组成的序列及由SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.32组成的序列、针对CYP3A4*15 SNP位点的由SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.33组成的序列及由SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.34组成的序列、针对CYP3A4*17 SNP位点的由SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.35组成的序列及由SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.36组成的序列、针对CYP3A4*18 SNP位点的由SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.37组成的序列及由SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.38组成的序列、和针对CYP3A4*19 SNP位点的由SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.39组成的序列及由SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.40组成的序列中的一对或多对。
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