[发明专利]大豆锈病菌检测引物、试剂盒及实时荧光PCR检测方法无效
申请号: | 200910246405.2 | 申请日: | 2009-11-19 |
公开(公告)号: | CN101875968A | 公开(公告)日: | 2010-11-03 |
发明(设计)人: | 王颖;陈枝楠;程颖慧;章桂明;康林;仲建忠;李芳荣 | 申请(专利权)人: | 深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;G01N21/64;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳新创友知识产权代理有限公司 44223 | 代理人: | 江耀纯;喻尚威 |
地址: | 518001 广东省深圳市罗*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 大豆 锈病 检测 引物 试剂盒 实时 荧光 pcr 方法 | ||
1.一种大豆锈病菌检测引物,其特征在于:包括,
SEQ ID NO:1:序列为5’-CCATTTAATTGGCTCATTGATTGATA-3’的正向引物;
SEQ ID NO:2:序列为5’-TGATTAATAGGTGGGTTGCAGCTT-3’的反向引物。
2.一种大豆锈病菌检测试剂盒,其特征在于:包括引物和探针,
所述引物包括:
SEQ ID NO:1:序列为5’-CCATTTAATTGGCTCATTGATTGATA-3’的正向引物;
SEQ ID NO:2:序列为5’-TGATTAATAGGTGGGTTGCAGCTT-3’的反向引物;
所述探针包括:
SEQ ID NO:3:序列为5’-FAM-ATCTTTGGGCAATGGT-MGB-3’的探针,其中,FAM为荧光分子,MGB为另结合了Minor Groove binder结合物。
3.如权利要求2所述的用于检测大豆锈病菌的试剂盒,其特征在于:
所述引物和探针包含在实时荧光反应混合液TaqMan Universal PCR Master Mix。
4.如权利要求2或3所述的用于检测大豆锈病菌的试剂盒,其特征在于:
所述实时荧光反应混合液TaqMan Universal PCR Master Mix体积为5μL,所述引物浓度为0.9μM/5μL,所述探针浓度为0.2μM/5μL。
5.一种大豆锈病菌实时荧光PCR检测方法,其特征在于:依次有以下步骤:待测物中加入引物和探针,2)扩增反应,3)报告检测结果;
所述步骤1)的引物包括:
SEQ ID NO:1:序列为5’-CCATTTAATTGGCTCATTGATTGATA-3’的正向引物;
SEQ ID NO:2:序列为5’-TGATTAATAGGTGGGTTGCAGCTT-3’的反向引物;
所述步骤1)的探针包括:
SEQ ID NO:3:序列为5’FAM-ATCTTTGGGCAATGGT-MGB-3’,其中,FAM为荧光分子,MGB为另结合了Minor Groove binder结合物。
6.如权利要求5所述的大豆锈病菌实时荧光PCR检测方法,其特征在于:
所述步骤1)加入的引物和探针包含在实时荧光反应混合液TaqMan Universal PCRMaster Mix,所述实时荧光反应混合液TaqMan Universal PCR Master Mix体积为5μL,所述引物浓度为0.9μM/5μL,探针浓度为0.2μM/5μL。
7.如权利要求6所述的大豆锈病菌实时荧光PCR检测方法,其特征在于:
所述步骤2)扩增反应是对大豆锈病菌的荧光PCR扩增体系进行扩增反应,所述扩增体系的总体积为10μL,其中所述实时荧光反应混合液TaqMan Universal PCRMaster Mix体积为5μL,所述引物浓度为0.9μM/5μL,所述探针浓度为0.2μM/5μL,所述待测物为1μL。
8.如权利要求5所述的大豆锈病菌实时荧光PCR检测方法,其特征在于:
所述步骤2)中的扩增反应依次有以下子步骤:
2·1)在50℃下持续2分钟;
2·2)在95℃下持续10分钟;
2·3)在95℃下持续15秒;在63℃下持续1分钟,为一个反应区间,重复进行40次。
9.如权利要求5所述的大豆锈病菌实时荧光PCR检测方法,其特征在于:
所述步骤3)报告检测结果的判定标准为,如果待测物的报告荧光信号有增加,判定待测物是大豆锈病菌;如果待测物的报告荧光信号没有增加,判定待测物是非大豆锈病菌。
10.如权利要求5所述的检测方法,其特征在于,所述步骤1)中还包括配置浓度为10-100ng/μL的大豆锈病菌DNA模板;所述步骤2)中还包括在含大豆锈病菌DNA模板的阳性对照组中加入试剂盒中的试剂,等待扩增步骤,并检测扩增过程中阳性对照组的荧光信号;在不含大豆锈病菌DNA模板的阴性对照组中加入试剂盒中的试剂,等待扩增步骤,并检测扩增过程中阴性对照组的荧光信号;在空白对照组中加入试剂盒中的试剂,等待扩增步骤,并检测扩增过程中空白对照组的荧光信号;所述步骤3)为根据阳性对照组、阴性对照组、空白对照组和待测物的报告荧光信号综合判定报告检测结果。
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