[发明专利]来自酸热脂环酸杆菌的嗜热的与嗜热嗜酸的糖基化基因和酶以及相关生物、方法

说明书

优先权要求

本申请要求于2008年2月27日提交的名为“来自酸热脂环酸杆菌的嗜热的与嗜热嗜酸的糖基化基因和酶以及相关生物、方法”的美国临时专利申请系列号61/031,984的提交日期的权益。

政府权利

依据美国能源部与巴特尔能源联盟(Battelle Energy Alliance，LLC)之间的合同编号DE-AC07-99ID13727和合同编号DE-AC07-05ID14517，美国政府拥有本发明中的某些权利。

技术领域

本发明总体上涉及生物技术。更具体地说，本发明涉及来自酸热脂环酸杆菌(Alicyclobacillus acidocaldarius)的分离的和/或纯化的多肽和编码多肽的核酸序列以及它们的使用方法。

背景

直到最近为止人们认为细菌通常不糖基化它们的蛋白。虽然已经有一些已报道的例子，但是这些作为罕见的异常现象而不予考虑(Borman2006)。现在正变得更为接受的是细菌确实糖基化它们的蛋白，可能是以比真核生物更多的方式，尽管这种观点还没有广泛传播(等人2001)。在最近的一篇综述文章中，叙述了糖基化已显示出协助蛋白稳定性、调节例如可溶性的物理性质、防止蛋白水解、改变活性特征、以及靶向分泌(Upreti等人2003)。1994年，一小组从酸热脂环酸杆菌纯化出一种淀粉酶并且显示所述淀粉酶在活性生长过程中是细胞结合的、非糖基化的和不可溶的(Schwerman等人1994)。当培养物进入稳定期时，所述细胞释放多种可溶的糖基化形式的淀粉酶进入培养基(Schwerman等人1994)。没有进行比较不同形式淀粉酶活性的尝试。

发明公开内容

本发明的实施方案涉及酸热脂环酸杆菌基因组的纯化的和/或分离的核苷酸序列、或者其同源物或片段。在本发明的一个实施方案中，所述核苷酸序列选自SEQ ID NO.2、19、36、53、70、87、104、121、138、155、172、189、206、223、240、257、274、291和310或者其同源物或片段中的至少一个。在本发明的另一个实施方案中，所述同源物选自由对SEQ IDNO.2、19、36、53、70、87、104、121、138、155、172、189、206、223、240、257、274、291和310中的至少一个具有至少80％的序列同一性的核苷酸序列所组成的组。

本发明的实施方案可以进一步涉及一种分离的和/或纯化的核酸序列，所述核酸序列包括编码一种多肽的核酸序列，所述多肽选自由对SEQ IDNO.1、18、35、52、69、86、103、120、137、154、171、188、205、222、239、256、273、290、和309中的至少一个具有至少90％的序列同一性的多肽所组成的组。

本发明的实施方案还涉及由包括酸热脂环酸杆菌基因组的核苷酸序列的核苷酸序列或者其同源物或片段所编码的分离的和/或纯化的多肽。在一个实施方案中，所述核苷酸序列包括选自由以下组成的组的核苷酸序列：对SEQ ID No.2、19、36、53、70、87、104、121、138、155、172、189、206、223、240、257、274、291和310中的至少一个具有至少80％的序列同一性的核苷酸序列。

在本发明的另一个实施方案中，所述核苷酸序列包含选自SEQ ID NO.2、19、36、53、70、87、104、121、138、155、172、189、206、223、240、257、274、291和310或者其同源物或片段中的至少一个的核苷酸序列。在又一实施方案中，所述多肽包含SEQ ID NO.1、18、35、52、69、86、103、120、137、154、171、188、205、222、239、256、273、290、和309的氨基酸序列。还在一实施方案中，所述多肽包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：对SEQ ID No：1、18、35、52、69、86、103、120、137、154、171、188、205、222、239、256、273、290和309中的至少一个具有至少90％的序列同一性的多肽。

在本发明的实施方案中，所述多肽可以是嗜酸的和/或嗜热的。在其他的实施方案中，所述多肽可以是糖基化的、聚乙二醇化的、或其他方式的翻译后修饰的。