[发明专利]造成急性呼吸道感染的炎性病原体的鉴别方法

权利要求书

1.一种方法，其中，

所述方法为造成急性呼吸道感染的炎性病原体的鉴别方法，

作为鉴别对象的病原体是呼吸道定植病原体；

并且，该方法具备：相对于含有对象呼吸道分泌物的样本中的对象细胞量，测定所述样本中病原体量的相对值的工序；和基于所述相对值，鉴别所述病原体是否是炎性病原体的工序。

2.一种方法，其中，

所述方法是确定用于鉴别造成急性呼吸道感染的炎性病原体的鉴别基准值的方法，

作为鉴别对象的病原体是呼吸道定植病原体；

并且，该方法具备：

a)测定由含有对象呼吸道分泌物的样本调制而成的DNA中来源于对象细胞的基因拷贝数的工序；

b)测定所述DNA中来源于病原体的基因拷贝数的工序；

c)计算来源于所述病原体的基因拷贝数相对于来源于所述对象细胞的基因拷贝数的相对数的工序；

d)对多个对象进行所述工序a)～c)，得到各个对象的相对数的工序；

e)通过比较各个对象的相对数和各个对象的临床诊断结果，将i)在临床诊断中成为炎性病原体阳性的相对数的下限值、和/或ii)在临床诊断中成为炎性病原体阴性的相对数的上限值确定为鉴别基准值的工序。

3.一种方法，其中，

所述方法为鉴别造成急性呼吸道感染的炎性病原体的方法，

作为鉴别对象的病原体是呼吸道定植病原体；

并且，该方法具备：

a)测定由含有对象呼吸道分泌物的样本调制而成的DNA中来源于对象细胞的基因拷贝数的工序；

b)测定所述DNA中来源于病原体的基因拷贝数的工序；

c)计算来源于所述病原体的基因拷贝数相对于来源于所述对象细胞的基因拷贝数的相对数的工序；

d)基于权利要求2所述的鉴别基准值和所述相对值，鉴别所述病原体是否是炎性病原体的工序。

4.如权利要求2或3所述的方法，其中，

呼吸道定植病原体为选自链球属菌、嗜血杆菌属菌、莫拉菌属菌、假单胞菌属菌、克雷伯菌属菌、寡养单胞菌属菌、不动杆菌属菌和葡萄球菌属菌中的1种以上的病原体。

5.如权利要求3或4所述的方法，其中，

作为进一步的鉴别对象的病原体是呼吸道中通常不存在的病原体；

并且该方法进一步具备：

a)测定由含有对象呼吸道分泌物的样本调制而成的DNA中来源于所述病原体的基因拷贝数的工序；

b)i)在没有检测出来源于所述病原体的基因的情况下，鉴别所述病原体与感染无关；和ii)在检测出来源于所述病原体的基因的情况下，鉴别所述病原体为炎性病原体的工序。

6.如权利要求5所述的方法，其中，

所述在呼吸道中通常不存在的病原体为选自支原体属菌、军团菌属菌、嗜衣原体属菌、分支杆菌属菌、立克次体属菌、诺卡氏菌属菌、肺孢子菌属菌和曲霉菌属菌中的1种以上病原体。

7.如权利要求2～6中任意一项所述的方法，其中，

来源于所述病原体的基因为选自肺炎球菌的肺炎球菌溶血素基因、肺炎球菌的lytA基因、流感嗜血杆菌的16S rRNA基因、卡他莫拉菌的copB基因、假单胞菌属菌的16S rRNA基因、肺炎杆菌的gapA基因、嗜麦芽寡养单胞菌的23S rRNA基因、金黄色葡萄球菌的femB基因的1种以上的来源于呼吸道定植病原体的基因。

8.如权利要求5～7中任意一项所述的方法，其中，

来源于所述病原体的基因为选自肺炎支原体的16S rRNA基因、嗜肺军团菌的mip基因、军团菌属菌的16S rRNA基因、肺炎衣原体的53kD-抗原基因、鹦鹉热衣原体的ompA基因、结核分枝杆菌的MPB64基因、胞内分枝杆菌的ITS 16-23S rRNA基因、鸟型分枝杆菌的16SrRNA基因、鸟型分枝杆菌的ITS 16-23S rRNA基因、堪萨斯分枝杆菌的dnaJ基因、诺卡氏菌属菌的16S rRNA基因和耶氏肺孢子菌的5SrRNA基因中的1种以上的来源于呼吸道中通常不存在的病原体的基因。

9.如权利要求2～8中任意一项所述的方法，其中，

来源于所述病原体的基因进一步包含耐药性基因。