[发明专利]用于核酸测序的组合物和方法

权利要求书

1.一种确定模板核酸区段内的核苷酸共有序列的方法，该方法包括：

在毗连核酸分子内提供模板核酸区段正义链和反义链；

在聚合酶介导的模板依赖的测序过程中测定正义链和反义链的序列；以及

根据正义链和反义链的序列确定靶核酸区段的共有序列。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述正义链和反义链存在于部分毗连核酸区段中。

3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，所述正义链和反义链至少在第一末端通过第一连接寡核苷酸相连。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述正义链和反义链存在于完全毗连核酸区段中。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述正义链和反义链的两个末端分别通过第一和第二连接寡核苷酸相连。

6.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述测定正义链和反义链序列的步骤包括对正义链和反义链中的至少一个进行一次以上的测序。

7.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述测序步骤包括使毗连核酸分子与引物序列接触，所述引物序列与所述第一连接寡核苷酸的至少一部分互补。

8.如权利要求3所述的方法，其特征在于，所述测定正义链和反义链序列的步骤包括对完全毗连核酸区段进行一次以上的测序。

9.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述测定正义链和反义链序列的步骤包括对完全毗连核酸区段进行两次以上的测序。

10.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述聚合酶介导的模板依赖的测序过程包括检测由聚合酶掺入的每一个核苷酸的掺入。

11.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述检测掺入的步骤包括检测由各个聚合酶掺入的每一个核苷酸的掺入。

12.一种测定核酸序列的方法，该方法包括：

提供包含具有第一和第二末端的双链核酸区段的模板核酸；

第一发卡寡核苷酸在第一末端连接模板核酸的两条链；

第二发卡寡核苷酸在第二末端连接模板核酸的两条链；以及

利用模板指导的聚合酶介导的核酸测序过程测定模板核酸至少一条链的核苷酸序列。

13.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述测序过程是对双链核酸区段的每一条链测序。

14.如权利要求13所述的方法，其特征在于，该方法包括比较双链核酸区段每一条链的序列数据以确定双链区段共有序列的步骤。

15.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述测序过程对双链核酸区段的至少一条链进行一次以上的测序。

16.如权利要求15所述的方法，其特征在于，该方法包括比较对至少一条链进行一次以上的测序所获得的序列数据以确定双链核酸区段的共有核苷酸序列。

17.如权利要求13所述的方法，其特征在于，所述测序过程对双链区段的每条链进行一次以上的测序。

18.如权利要求17所述的方法，其特征在于，该方法包括比较对双链区段的每条链进行一次以上的测序所获得的序列数据以确定双链核酸区段的共有核苷酸序列。

19.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述第一发卡寡核苷酸和第二发卡寡核苷酸中的至少一个包含引物识别序列。

20.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述第一发卡寡核苷酸和第二发卡寡核苷酸中的至少一个包含注册序列。

21.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述测序过程在允许模板指导的聚合酶介导的核酸合成通过模板核酸的双链核酸区段的条件下进行。

22.如权利要求21所述的方法，其特征在于，所述聚合酶介导的核酸合成包括使用链置换聚合酶。

23.一种测定核酸序列的方法，该方法包括：

提供包含具有第一和第二末端的双链区段的模板核酸；

第一发卡寡核苷酸在第一末端连接模板核酸的两条链；以及

利用模板指导的聚合酶介导的核酸测序过程测定模板核酸的核苷酸序列。