[发明专利]一种基于基因表达谱的用来标示高风险多发性骨髓瘤的基因组指纹的方法和用途

权利要求书

1.一种用以标示与某种疾病患者的生存率相关的基因组指纹的方法，包括：

从某人群中的某种疾病患者身上和不患该疾病的个体身上分离浆细胞；

从上述浆细胞中提取核酸；

将上述核酸杂交至一种比较基因组DNA列阵上和一种基因表达DNA微排阵上以检测上述浆细胞中的基因拷贝数异常和基因表达水平，以及

进行包括生物信息学和计算机方法在内的数据分析，以识别可能与疾病相关的候选基因的拷贝数反常性和表达水平的改变，其中所述的表达水平的改变显示这些特定的基因组指纹与该疾病患者的生存率相关。

2.权利要求1中所用的方法，进一步包括进行包括生物信息学和计算机方法在内的数据分析，以识别所述的候选基因在染色体中的区域位置。

3.权利要求2中所用的方法，其中染色体的区域包括染色体1，2，3，5，7，8，9，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22或上述的组合。

4.权利要求1中所用的方法，进一步包括识别基因组指纹中有表达水平的改变的候选基因，以作为靶点来治疗患者的疾病。

5.权利要求1中所用的方法，进一步包括识别基因组指纹，其包括以下其一或多种：染色体1p内DNA的丢失，1p基因表达的减少，1p蛋白质表达的减少，染色体1q内DNA的增加，1q基因表达的增加，1q蛋白质表达的增加，染色体8q内DNA的增加，8q基因表达的增加，8q蛋白质表达的增加，以作为一个或多个针对患者的疾病的诊断，预测，或治疗评价的生物标志物。

6.权利要求1中所用的方法，其所述疾病包括多发性骨髓瘤以及相关的疾病亚型。

7.权利要求6中所用的方法，其所述的多发性骨髓瘤的亚型包括：未定性的单克隆免疫球蛋白病，无症状的多发性骨髓瘤，有症状的多发性骨髓瘤，以及复发性多发性骨髓瘤。

8.权利要求6中所用的方法，其所述的识别的基因组指纹包括：ARGONAUTE 2(EIF2C2/AGO2)候选基因的表达增高，以及基因拷贝数的异常(包括染色体8q24处的拷贝数增加)，这些基因组指纹均指示患者的生存率有可能降低。

9.权利要求6中所用的方法，其所述的识别的基因组指纹包括以下之一或多种：染色体1p处的DNA的减少，1p处的基因表达的减少，1p处的蛋白表达的减少，这些基因组指纹均指示多发性骨髓瘤的恶化的高风险。

10.权利要求6中所用的方法，其所述的识别的基因组指纹包括以下一种或多种：染色体1q处的DNA的增加，1q处的基因表达的增加，1q处的蛋白表达的增加，这些基因组指纹均指示多发性骨髓瘤的恶化的高风险。

11.权利要求1中所用的方法，其所述的疾病候选基因的表达的改变包括表达的增加，表达的减少，或者表达的增加和减少。

12.权利要求1中所用的方法，其所述的拷贝数的异常和基因表达的改变由以下一种或多种方法检测：分裂第二期间荧光原位杂交，分裂中期荧光原位杂交，基于聚合酶链式反应(PCR)的化验，基于蛋白质的化验。