[发明专利]区分酵母菌株和/或测定酵母菌株的遗传稳定性的新颖方法及其使用

权利要求书

1.测定样本中的酵母菌株的方法，包括

-从样本中的酵母获得核酸；

-将所述核酸进行两个或更多靶序列的筛查，其中所述核酸中的靶序列至少其中之一包括酵母线粒体DNA中的某基因的整体或部分，或与酵母线粒体DNA中的某基因相关的侧翼区；

-从筛查结果断定样本中的酵母菌株。

2.测定样本中的酵母菌株的遗传稳定性的方法，包括：

-从样本中的酵母获得核酸；

-将所述核酸进行两个或更多的靶序列的筛查，其中所述核酸中的靶序列至少其中之一包括酵母线粒体DNA中的某基因的整体或部分，或与酵母线粒体DNA中的某基因相关的侧翼区，或者位于染色体的次端粒区的某基因的整体或部分或与位于染色体的次端粒区的某基因相关的侧翼区；

-从筛查结果断定所述酵母菌株在遗传方面是否稳定。

3.如权利要求1或2所述的方法，其中使用PCR来扩增所述两个或更多的靶序列来实施本发明的筛查步骤。

4.如权利要求3所述的方法，其中通过探测有否存在着来自PCR反应的扩增产物来断定核酸样本中有否存在着靶序列。

5.如任一前述权利要求所述的方法，其中能在少于24小时之内实施所述方法。

6.如任一前述权利要求所述的方法，其中在发酵过程之前、期间或之后取得所述样本。

7.如任一前述权利要求所述的方法，其中在从酿造过程获得的样本上实施所述方法。

8.如任一前述权利要求所述的方法，其中所述样本是液体、浆体或固体。

9.如任一前述权利要求所述的方法，其中线粒体DNA的靶序列包括选自以下组别的基因COB、COX1、COX2、COX3、ATP8、ATP6、ATP9、VAR1和RPM1的至少部分和/或任何位于这些基因的两侧或分隔这些基因的非编码序列，或者其相互之间的任何组合。

10.如任一前述权利要求所述的方法，其中所述靶序列至少其中之一包括至少一个非线粒体基因的整体或部分，或与至少一个非线粒体基因相关的侧翼区。

11.如权利要求10所述的方法，其中所述非线粒体基因和/或其侧翼序列是编码酵母细胞壁相关的蛋白和/或与糖类代谢相关的蛋白的基因。

12.如权利要求10所述的方法，其中所述DNA靶序列可包括一个或更多酵母基因的整体或至少部分和/或酵母基因的侧翼区，所述酵母基因选自下列组别TIR基因、DAN基因、FLO基因、ECM基因、BUD基因、KEL基因、MNT基因、SED基因、MEL基因、SUC基因、ATF基因、GST基因、GAL基因、MAL1-4、CYC1、CYC2、CYC3、CBP1、CBP2、CBP3、CBP4和CBT1。

13.如任一前述权利要求所述的方法，如依据权利要求2，其中一个或更多的靶序列包括选自下列组别包括COB、COX1、COX2、COX3、ATP8、ATP6、ATP9、VAR1、RPM1、ECM34、SUC1、SUC3、SUC4、SUC5、SUC7、MAL1、MAL2、MAL3、MAL4、MEL2、MEL3、MEL4、MEL5、MEL6、MEL7、MEL8、MEL9和MEL10的基因的至少部分和/或这些基因的任何侧翼区，或者其相互之间的任何组合。

14.如任一前述权利要求所述的方法，其中使用一个或更多的与所述靶序列互补或反向互补的寡核苷酸引物或探针来探测所述靶序列。

15.如权利要求14所述的方法，其中一个或更多的所述引物或探针包括选自SEQ ID NOS：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、38、39、41、42和43的序列，或其相互之间的任何组合，或者与SEQ ID NOS：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、34、35、36、38、39、41、42和43的序列的序列一致性为至少80％、85％、90％、95％、98％或更高的序列。