[发明专利]用于预测无复发存活的生物学标记物

权利要求书

1.包括基因座DNA的甲基化分类列表，对于所述基因座，DNA甲基化状态是癌症复发的可能性的指征，其中所述甲基化分类列表包含至少一种序列，所述序列是包含SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：252的组中的序列。

2.权利要求1的甲基化分类列表，其包括序列SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：252。

3.权利要求1的甲基化分类列表，其包括序列SEQ ID NO：135、78、230、82、120、60、75、63和173。

4.用于获得权利要求1-3任一项的甲基化分类列表(12)的方法(10)，所述甲基化分类列表(12)包括与临床病理学信息相关的统计学处理的甲基化数据，所述方法包括：

提供(110)来自已知临床病理学历史的患者的肿瘤DNA(11)；

分析(120)肿瘤DNA(11)的甲基化状态，得到甲基化分类列表(12)，所述甲基化分类列表(12)包括对统计学处理的甲基化数据的选择，其中所述选择适于预测对象的无复发存活概率。

5.权利要求4的方法(10)，其中所述分析(120)包括寻找具有0.05或更低的P-值的基因座。

6.一种用于预测被诊断患有癌症的对象的无复发存活概率的方法(20)，所述方法包括：

建立(230)标记物组(23)，其包括来自权利要求1-3任一项的甲基化分类列表的至少一项；

提供(240)来自对象的DNA(24)；

分析(250)来自对象的DNA(24)中相应于标记物组(23)的部分的甲基化状态，得到包括统计学处理的甲基化数据的局部甲基化分类列表(25)；

统计学分析(260)局部甲基化列表(25)，由此获得对象无复发存活的预测的概率(26)。

7.用于预测已被诊断患有癌症的对象的无复发存活概率的设备(30)，所述设备被设置为执行权利要求6的方法，所述设备包括：

第一单元(330)，其建立包括来自权利要求1-3任一项的甲基化分类列表的至少一项的标记物组(23)；

第二单元(340)，其提供来自对象的DNA(24)；

第三单元(350)，其分析来自对象的DNA(24)中相应于标记物组(23)的部分的甲基化状态，得到包括统计学处理的甲基化数据的局部甲基化分类列表(25)；

第四单元(360)，其对局部甲基化列表(25)进行统计学分析(260)，由此获得对象无复发存活的预测的概率(26)。

8.权利要求1-3任一项的甲基化分类列表的用途，其用于预测被诊断为患有癌症的对象的无复发存活概率。