[发明专利]PRE-rRNA比率测量分析

权利要求书

1.一种检测样品中的活微生物的方法，所述方法包含：

收集样品；

对样品的第一份等份试样进行营养刺激；

将样品的第二份等份试样维持在未营养刺激的对照条件下；

对第一份等份试样和第二份等份试样进行温育；

将来自第一份等份试样的至少一种靶微生物的至少一种靶pre-rRNA的水平与来自第二份等份试样中至少一种靶微生物的所述至少一种靶pre-rRNA的水平进行比较；

其中第一份等份试样中的所述至少一种靶pre-rRNA的水平与第二份等份试样中的所述至少一种靶pre-rRNA的水平的比，指示样品中的活微生物。

2.权利要求1的方法，其还包含从第一份等份试样提取RNA和从第二份等份试样提取RNA；以及

对第一份等份试样中的所述至少一种靶pre-rRNA水平进行定量，并且对第二份等份试样中的所述至少一种靶pre-rRNA水平进行定量。

3.权利要求1的方法，其中所述至少一种靶微生物在样品中活的百分率是约0.01％、0.02％、0.03％、0.04％、0.05％、0.1％、0.5％、1.0％、2.0％、3.0％、4.0％、5.0％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％和95％中的至少一个。

4.权利要求2的方法，其中从第一份等份试样和第二份等份试样提取RNA以及对来自第一份等份试样和第二份等份试样的所述至少一种pre-rRNA进行定量包括使用微流体装置。

5.权利要求1的方法，其还包含免疫分离方法，其中对样品筛查样品中所述至少一种靶微生物的特定分离物的存在。

6.权利要求5的方法，其中免疫分离方法包含筛查样品中大肠埃希氏杆菌(E.coli)0157的存在。

7.权利要求1的方法，其中所述至少一种靶微生物是选自下列的微生物属的成员：不动杆菌属(Acinetobacter)、放线杆菌属(Actinobacillus)、气单胞菌属(Aeromonas)、弓形杆菌属(Arcobacter)、拟杆菌属(Bacteroides)、包特氏菌属(Bordetella)、疏螺旋体属(Borrelia)、布鲁氏杆菌属(Brucella)、伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia)、弯曲杆菌属(Campylobacter)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、阪崎肠杆菌属(Cronobacter)、爱德华氏菌属(Edwardsiella)、肠杆菌属(Enterobacter)、埃希氏杆菌属(Escherichia)、真杆菌属(Eubacterium)、弗朗西丝氏菌属(Francisella)、梭形杆菌属(Fusobacterium)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、螺杆菌属(Helicobacter)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、军团菌属(Legionella)、钩端螺旋体属(Leptospira)、摩拉克氏菌属(Moraxella)、摩根氏菌属(Morganella)、奈瑟球菌属(Neisseria)、巴斯德菌属(Pasteurella)、邻单胞菌属(Plesiomonas)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、普氏菌属(Prevotella)、变形杆菌属(Proteus)、普罗威登斯菌属(Providencia)、假单胞菌属(Pseudomonas)、沙门氏菌属(Salmonella)、沙雷氏菌属(Serratia)、志贺氏菌属(Shigella)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、密螺旋体属(Treponema)、韦荣球菌属(Veillonella)、弧菌属(Vibrio)、耶尔森氏菌属(Yersinia)、放线菌属(Actinomyces)、芽孢杆菌属(Bacillus)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、梭状芽胞杆菌属(Clostridium)、棒状杆菌属(Corynebacterium)、肠球菌属(Enterococcus)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、李斯特菌属(Listeria)、微球菌属(Micrococcus)、动弯杆菌属(Mobiluncus)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、诺卡氏菌属(Nocardia)、消化链球菌属(Peptostreptococcus)、丙酸杆菌属(Propionibacterium)、红球菌属(Rhodococcus)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、链球菌属(Streptococcus)和链霉菌属(Streptomyces)。