[发明专利]生物标志

说明书

本申请涉及生物标志，具体而言，涉及膀胱癌和肺癌的生物标志。

膀胱癌是男性中的第四位最常见癌症和女性中的第十位最常见癌症；每年在英国有10,000例新病例，而在美国有63,000例。目前，通过检查尿液中已经自膀胱壁解附的细胞(细胞学)，或者通过自膀胱取出组织进行活组织检查来做出诊断。细胞学是非常特异性的但是具有低灵敏度，而且这两种技术是昂贵且费时的。针对膀胱癌的可靠的生物化学标志物对于患者会具有极大的益处。

关于膀胱癌的类型，病例的90％是移行细胞癌(TCC)，其源自膀胱的内部衬里，即尿路上皮。膀胱癌剩余的10％是鳞状细胞癌、腺癌、肉瘤或小细胞癌。

肺癌是全世界最常见的癌症，每年有135万新病例，其中38,000例在英国。没有可靠的用于诊断肺癌的生物化学方法可用；目前通过X射线，接着为支气管镜检查法和/或计算机化断层摄影术(CT)扫描进行诊断。基于血清或痰中的单一标志物的可靠的生物化学测试对于患者会有极大的益处，因为它会加速诊断。另外，此类测试有可能远比现有方法便宜。

肺癌有多种类型。将非小细胞肺癌(NSCLC)分组在一起，因为其预后和管理相似。它们由鳞状细胞肺癌、腺癌和大细胞肺癌组成。NSCLC是肺癌的最普遍形式，构成病例的80.4％。小细胞肺癌(SCLC)构成病例的16.8％。SCLC经常具有作为该疾病的重要组成的内分泌功能。类癌和肉瘤癌症分别构成病例的0.8％和0.1％，其中病例的1.9％是未规定的类型。

发明概述

依照本发明的一方面，提供了膀胱癌特异性生物标志或肺癌特异性生物标志，所述生物标志包含：

(i)包含SEQ ID NO：1或其片段或变体的核酸序列，或包含所述核酸序列的核酸分子；或

(ii)包含SEQ ID NO：2或其片段或变体的氨基酸序列，或包含所述氨基酸序列的氨基酸分子。

在此方面，SEQ ID NO：1对应于Engrailed-2(EN2)基因的核酸序列(GenBank参考号NM_001427)，而SEQ ID NO：2对应于由其编码的EN2蛋白(NCBI登录号P19622，gi21903415)。

令人惊讶地，已经发现了EN2基因在膀胱癌和肺癌中显著上调。

EN2基因编码含有同源域的转录因子，其在早期发育中具有许多重要功能，包括轴突导向和边界形成(综述见Morgan R，(2006).Engrailed：Complexity and economy of a multi-functional transcription factor.FEBS letters580，2531-2533，通过提及而将其完整收入本文)。其NCBI/GenBank参考号是NM 001427。先前报告了其在乳腺癌中起癌基因的作用，尽管尚未将诊断意义归于它(Martin，N.L.，Saba-El-Leil，M.K.，Sadekova，S.，Meloche，S.及Sauvageau，G.(2005)EN-2is a candidate oncogene in human breast cancer.Oncogene 24，6890-6901，通过提及而将其完整收入本文)。EN2基因产物是33kDa蛋白(EN2)。

优选地，所述其片段或变体包含：

(i)与SEQ ID NO：1具有至少约50％、或至少约60％、或至少约70％、或至少约75％、或至少约80％、或至少约85％、或至少约90％、或至少约95％、或至少约96％、或至少约97％、或至少约98％、或至少约99％核酸序列同一性的核酸序列，在严格条件下与其可杂交的核酸序列，和/或与其互补的核酸序列；

(ii)与SEQ ID NO：2具有至少约50％、或至少约60％、或至少约70％、或至少约75％、或至少约80％、或至少约85％、或至少约90％、或至少约95％、或至少约96％、或至少约97％、或至少约98％、或至少约99％氨基酸序列同一性的氨基酸序列；或

(iii)由(i)的核酸序列编码的氨基酸序列。

换言之，依照上文的部分(iii)，优选的是，所述其片段或变体包含：

(A)由核酸序列编码的氨基酸序列，其中所述核酸序列与SEQ ID NO：1具有至少约50％、或至少约60％、或至少约70％、或至少约75％、或至少约80％、或至少约85％、或至少约90％、或至少约95％、或至少约96％、或至少约97％、或至少约98％、或至少约99％核酸序列同一性；