[发明专利]Tivozanib应答预测无效
申请号: | 200980160316.4 | 申请日: | 2009-10-19 |
公开(公告)号: | CN102471799A | 公开(公告)日: | 2012-05-23 |
发明(设计)人: | 林杰;M·鲁滨逊;冯斌;W·K·孙 | 申请(专利权)人: | AVEO制药公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C07H21/04;C12P19/34 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 袁泉 |
地址: | 美国马*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | tivozanib 应答 预测 | ||
1.鉴定人类肿瘤可能对用tivozanib的治疗是应答性的或非应答性的方法,包括:
(a)在来自人类肿瘤的样品中,确定预测性基因组(PGS)中各个基因的相对表达水平,其中PGS包括以下基因:
AIF1,APBB1IP,ARHGAP30,C3AR1,CCR1,CD37,CD53,CD86,CLEC7A,CSF1R,CSF2RB,CTSS,CYBB,DOCK2,EVI2A,EVI2B,FPR3,GMFG,GPR65,HCK,HCLS1,HLA-DMA,IL10RA,ITGB2,LAIR1,LCP1,LCP2,LILRB1,LILRB2,LST1,LY86,MNDA,MS4A6A,MYO1F,NCF4,SLA,SLAMF8,TLR1,TYROBP,PLEK,CYTH4和PTPRC;以及
(b)根据以下公式计算PGS分数
其中E1,E2,...E42为PGS中42个基因的表达值,并且
其中低于限定阈值的PGS分数指示此肿瘤可能对tivozanib是应答性的,而高于限定阈值的PGS分数指示此肿瘤可能对tivozanib是抵抗性的。
2.权利要求1的方法,其中PGS由以下基因构成:AIF1,APBB1IP,ARHGAP30,C3AR1,CCR1,CD37,CD53,CD86,CLEC7A,CSF1R,CSF2RB,CTSS,CYBB,DOCK2,EVI2A,EVI2B,FPR3,GMFG,GPR65,HCK,HCLS1,HLA-DMA,IL10RA,ITGB2,LAIR1,LCP1,LCP2,LILRB1,LILRB2,LST1,LY86,MNDA,MS4A6A,MYO1F,NCF4,SLA,SLAMF8,TLR1,TYROBP,PLEK,CYTH4及PTPRC。
3.权利要求1或2的方法,进一步包括进行阈值确定分析的步骤,由此产生确定的阈值,其中阈值确定分析包括受试者工作特征曲线分析。
4.权利要求1、2或3的方法,其中PGS中各个基因的相对表达水平通过DNA微阵列分析确定。
5.权利要求1、2或3的方法,其中PGS中各个基因的相对表达水平通过qRT-PCR分析确定。
6.PCR引物组,其包含用于确定权利要求1或2的PGS中基因表达水平的引物对。
7.PCR引物组,其包含用于确定权利要求1或2的PGS中基因相对表达并由此鉴定人类肿瘤可能对用tivozanib的治疗是应答性的或非应答性的引物对。
8.诊断测试试剂盒,其包含权利要求7的PCR引物组。
9.DNA微阵列芯片,其包含用于确定权利要求1或2的PGS中基因表达水平的探针组。
10.DNA微阵列芯片,其包含固体表面和探针组,所述探针组包含特异于权利要求1或权利要求2的PGS中各个基因而由此鉴定人类肿瘤可能对用tivozanib的治疗是应答性的或非应答性的探针。
11.诊断测试试剂盒,其包含权利要求10的DNA微阵列芯片。
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