[发明专利]海水养殖池塘底泥微生物基因组DNA的提取方法无效
申请号: | 201010109576.3 | 申请日: | 2010-02-20 |
公开(公告)号: | CN102161987A | 公开(公告)日: | 2011-08-24 |
发明(设计)人: | 常亚青;王轶南;丁君;宋坚;朱世伟;刘艳萍 | 申请(专利权)人: | 大连水产学院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 大连非凡专利事务所 21220 | 代理人: | 闪红霞 |
地址: | 116023 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 海水 养殖 池塘 微生物 基因组 dna 提取 方法 | ||
1.一种海水养殖池塘底泥微生物基因组DNA的提取方法,依次按照如下步骤进行:
a.取0.3~0.5g底泥样品于离心管中,加入800~1000μl预处理缓冲液,涡旋混匀;所述预处理缓冲液为100μl pH 5.5的1M Tris-HCl buffer、700μl超纯水以及200μl 0.2M Al2(SO4)3的混合溶液;
b.用4M NaOH调a步骤所得溶液的pH至8,3500g×2min离心弃上清,取沉淀;
c.向所得沉淀中加入300~400μl浓度为5mg/ml的溶菌酶涡旋混匀,再加入100~120μl浓度为10%的SDS、15~25ul 25mg/ml蛋白酶K,涡旋混匀;
d.加入200~400μl 5M NaCl涡旋混匀,加入180~280μl 65℃预热的CTAB-NaCl,涡旋混匀,65℃作用20min后11,000g×1min离心取上清;
e.在上清液中加入等体积的酚/氯仿/异戊醇,涡旋混匀,11,000g×15min离心取上清,酚/氯仿/异戊醇的体积比为25∶24∶1;
f.加入等体积的氯仿/异戊醇涡旋混匀,氯仿/异戊醇的体积比为24∶1,11,000g×15min离心取上清;
g.重复步骤f一次;
h.将上清移至1.5ml离心管,加入0.7倍体积异丙醇、0.1倍体积5M NaCl,室温过夜,18,000g×30min离心弃上清,向沉淀中加入1ml预冷70%乙醇重悬、洗涤;
i.18,000g×30min离心后弃除上清,干燥沉淀,加入30~50μl1×TE,4℃溶解至少4h。
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