[发明专利]肠炎沙门氏菌的PCR检测方法、核酸及引物对有效
申请号: | 201010113922.5 | 申请日: | 2010-02-25 |
公开(公告)号: | CN101857896A | 公开(公告)日: | 2010-10-13 |
发明(设计)人: | 史贤明;刘斌;施春雷;何晓华;陈婧 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/10;C12N15/11 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肠炎 沙门氏菌 pcr 检测 方法 核酸 引物 | ||
技术领域
本发明涉及的是一种食品安全检测技术领域的PCR检测方法、核酸及引物对,具体是一种肠炎沙门氏菌的PCR检测方法、核酸及引物对。
背景技术
肠炎沙门氏菌(Salmonella Enteritid)是最常见的沙门氏菌感染类型之一,无宿主特异性而且侵害性非常强,可引起畜禽的胃肠炎及人类肠炎和食物中毒。肠炎沙门氏菌对外界环境的抵抗力较强,在水、牛乳及肉类制品中能生存几个月。肠炎沙门氏菌在自然界分布较广,在许多禽畜和野生动物的肠道中都会储有,其中禽蛋和禽肉是人类感染该菌最主要的传染源。在临床,肠炎沙门氏菌感染的主要病症为发热、恶心、呕吐和腹泻。肠炎沙门氏菌对食品的污染事例日益增多,给我国造成了巨大的经济损失,如1996年向欧洲出口的兔肉中检测到肠炎沙门氏菌,导致全部销毁,直接经济损失达3000万元。目前,肠炎沙门氏菌的检测主要是依靠传统的培养的方法,通过生化反应及血清学测试来鉴定,操作复杂,费时费力,通常要3~5天才能得出检测结果。PCR技术以其操作简便、快速、灵敏度高、特异性强等特点,逐步应用于肠炎沙门氏菌的检疫工作中。但是,用于肠炎沙门氏菌的PCR检测的靶基因主要是依赖于国外学者的研究,而且许多靶点的特异性不强,如蒋颖,刘轶,郦晓琼等在《扬州大学学报》(农业与生命科学版)2007年第28卷第3期6~8页发表的“肠炎沙门氏菌特异性诊断方法的建立”。文中所用的靶点为sefA基因,该基因存在于许多的D型沙门氏菌中,如伤寒沙门氏菌,以此基因为靶点检测肠炎沙门氏菌易产生假阳性结果。
经对现有技术的文献检索发现,尚未发明与本发明的肠炎沙门氏菌的PCR检测方法、核酸及引物对有关的报道。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术的不足,提供一种肠炎沙门氏菌的PCR检测方法、核酸及引物对。采用本发明的检测方法检测肠炎沙门氏菌,检测时间短,成本低,检测结果特异性好,结果判定简单。
本发明是通过以下的技术方案实现的:
第一方面,本发明涉及一种肠炎沙门氏菌PCR检测方法,包括如下步骤:
步骤一,根据肠炎沙门氏菌的基因组DNA中碱基序列如SEQ ID NO:1所示的保守序列设计特异性扩增引物对;
步骤二,提取样品DNA,利用步骤一所得特异性扩增引物对采用PCR法进行扩增;
步骤三,凝胶电泳检测扩增产物,判断样品是否含有肠炎沙门氏菌;所述判断具体为:检测扩增产物在656bp位置是否存在单一扩增条带,如果存在,则说明样品中含有肠炎沙门氏菌;如果没有,则样品中不含有肠炎沙门氏菌。
步骤一中,所述引物对具体为:正向引物的碱基序列如SEQ ID N0:2所示,反向引物的碱基序列如SEQ ID NO:3所示。
步骤二中,所述PCR法中,PCR检测体系具体为:25μL反应体系具体为,10×PCR反应缓冲液2.5μL,25mmol/L的Mg2+2.0μL,2.5mmol/L的dNTP 1.0μL,5μM引物对1μL,Taq酶1U,样品DNA模板溶液2~5μL,最后补水至25μL。
步骤二中,所述PCR法中,PCR检测体系扩增参数具体为:94℃预变性5min,之后开始扩增循环,每个循环的程序为:94℃变性30s,65℃退火30s,72℃延伸30s;循环共35个;循环结束后,72℃延伸10min,降温至12℃,结束。
第二方面,本发明还涉及一种核酸,该核酸的碱基序列如SEQ ID NO:1所示。
第三方面,本发明还涉及一种引物对,该引物对具体为:正向引物的碱基序列如SEQ ID NO:2所示,反向引物的碱基序列如SEQ ID NO:3所示。
与现有技术相比,本发明具有如下的有益效果:采用本发明的检测方法检测肠炎沙门氏菌,检测时间短,无需使用抗血清,降低了检测成本;本发明的检测方法可以用于检测某些抗血清不能检测出的菌株,如抗原不表达的菌株,弥补免疫检测的缺陷,更加具有实用性;本发明的检测靶点是自行通过比较基因组学、生物信息学筛选并经过生物学验证而得到的,具有单一特异性,检测结果可靠,结果判定简单。
附图说明
图1为实施例1中PCR检测方法特异性评价实验凝胶电泳结果图;
图2为实施列1中PCR检测方法灵敏度评价实验凝胶电泳结果图。
具体实施方式
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