[发明专利]BRAF基因突变的快速检测无效
申请号: | 201010134213.5 | 申请日: | 2010-03-29 |
公开(公告)号: | CN101875971A | 公开(公告)日: | 2010-11-03 |
发明(设计)人: | 陈菲;王弢;秦勇;王秀娟 | 申请(专利权)人: | 苏州工业园区为真生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 范晴 |
地址: | 215123 江苏省苏州市工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | braf 基因突变 快速 检测 | ||
1.一种检测BRAF基因突变的PCR反应试剂盒,其特征在于所述试剂盒包括用于特异性扩增BRAF基因靶向序列的若干个引物对,所述引物对含有BRAF基因的第11外显子BRAF11或第15外显子BRAF15中至少15个连续的核苷酸构成的连续核苷酸序列,所述BRAF11具有SEQ ID No:1的连续核苷酸序列;所述BRAF15具有SEQ ID No:2的连续核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的检测BRAF基因突变的PCR反应试剂盒,其特征在于所述连续核苷酸序列为SEQ ID No:3~20序列之一的正向或反向核苷酸序列。
3.根据权利要求1所述的检测BRAF基因突变的PCR反应试剂盒,其特征在于所述引物为SEQ ID No:3~20序列之一的正向引物或反向引物。
4.根据权利要求1所述的检测BRAF基因突变的PCR反应试剂盒,其特征在于所述试剂盒还包括PCR缓冲液、dNTPs、荧光染料、MgCl2、TaqDNA聚合酶、模板DNA的PCR反应体系,所述PCR反应体系终浓度组成为:
PCR缓冲液 终浓度1~10×;
dNTPs 0.1~0.5mM;
引物序列 终浓度为0.1~0.5μM;
模板DNA 0.1~1.5ng/μL;
TaqDNA聚合酶 0.01~0.10U/μL;
MgCl2 终浓度为1~3mM;
荧光染料 1~3×。
5.根据权利要求4所述的检测BRAF基因突变的PCR反应试剂盒,其特征在于所述PCR反应体系终浓度组成为:
PCR缓冲液 终浓度1~5×;
dNTPs 0.2~0.3mM;
引物序列 终浓度为0.2~0.3M;
模板DNA 0.5~1.0ng/μL;
TaqDNA聚合酶 0.03~0.06U/μL;
MgCl2 终浓度为2~3mM;
荧光染料 1~2×。
6.根据权利要求1所述的检测BRAF基因突变的PCR反应试剂盒,其特征在于所述荧光染料可选自DNA饱和性染料包括EvaGreen染料、LCPLUS染料、ResoLight染料、SYTO 9染料;所述dNTP混合液包括10mM dATP、10mM dCTP、10mM dTTP、10mM dGTP的混合液;所述PCR缓冲液包括Tris·cl,氯化钾,硫酸铵,氯化镁;-20℃下pH值在8.0-9.0间。
7.一种检测BRAF基因外显子位点突变的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:
(1)设计并选取包括含有BRAF基因的第十一外显子BRAF11或第十五外显子BRAF15中至少15个连续的核苷酸构成连续核苷酸序列构成的若干个引物对;
(2)提取模板DNA,利用步骤(1)得到的引物对对模板DNA中BRAF基因进行PCR扩增;
(3)根据高分辨率溶解曲线法对扩增后的BRAF基因进行突变位点(BRAF11和BRAF15)检测。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于所述步骤(2)中模板DNA从选自外周血细胞、外周血血清或血浆、体液、腔道的脱落物、病变新鲜组织、冰冻病变切片、石蜡病变切片中提取,进行PCR反应的条件为92~97℃预变性4~15min;92~97℃变性10~30s,56~60℃退火10~30s,70~75℃延伸10~30s,40~50个循环。
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