[发明专利]一种香菇病毒检测试剂盒及检测方法无效

专利信息
申请号: 201010145856.X 申请日: 2010-04-07
公开(公告)号: CN101812541A 公开(公告)日: 2010-08-25
发明(设计)人: 张忠信;应国华;吕明亮;陈春乐;孙修炼;薛振文;李伶俐;姚立 申请(专利权)人: 中国科学院武汉病毒研究所;丽水市大山菇业研究开发有限公司;丽水市林业科学研究院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94
代理公司: 武汉宇晨专利事务所 42001 代理人: 王敏锋
地址: 430071*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 香菇 病毒 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种香菇菌病毒检测试剂盒,其特征在于:该试剂盒它包括①、食用真菌病毒 RNA提取试剂,包括液氮、十六烷基三甲基溴化铵提取液、2-硫醇基苯并噻唑、氯仿、 异戊醇、0.1%w/v焦碳酸二乙酯、无水乙醇、70%v/v乙醇、三羟甲基氨基甲烷-乙二 胺四乙酸缓冲液pH 8.0;

其中,十六烷基三甲基溴化铵提取液的配方为:2%w/v十六烷基三甲基溴化铵,2%w/v 聚乙烯吡咯烷酮,100mM三羟甲基氨基甲烷-盐酸缓冲液pH 8.0,25mM乙二胺四乙酸, 0.5g/L亚精胺,2.0M氯化钠,2%v/v巯基乙醇;

所述的三羟甲基氨基甲烷-盐酸缓冲液pH 8.0由焦碳酸二乙酯处理的水配制;

②、RT-PCR检测试剂为:100μmol/L四种三磷酸核苷混合液、三羟甲基氨基甲烷- 盐酸缓冲液pH 8.8、从香菇样品中提取的RNA模板、无RNA酶去离子水、酶混合试剂和 三对RT-PCR特异性引物;

其中,酶混合试剂包含莫洛尼鼠类白血病毒反转录酶和DNA聚合酶Taq酶或高保真 DNA聚合酶Pfu,两种酶混合的酶单位比例为U∶U=1∶0.5-2;

三对RT-PCR的特异性引物分别为:

第一对引物为:LEV F1:5′-ACAAAAAGCAAAAGCCGAGAGC-3′,

LEV R1:5′-ATTGCGAAGAAGCCCGTAAGAT-3′;

第二对引物为:LEV F2:5’-TCTTACGGGCTTCTTCGC-3’

LEV R2:5’-TGATTCGGGAGAGGGACT-3’;

第三对引物为:LEV F3:5′-CTAAGGCAAAGTCCAGGCACA-3′,

LEV R3:5′-TGCGTTGGGAGCTCTTCCGATAAC-3′;

③对照样品包括阳性对照样品和阴性对照样品,阳性对照样品是武香异常株WL 香菇菌丝体,试验确定含有香菇病毒颗粒和病毒核酸,阴性对照为浙江正常株JL-0香 菇菌丝,试验确定不含病毒颗粒和病毒核酸序列,试剂盒在-20℃以下的冰箱中保存。

2.权利要求1所述的一种香菇菌病毒检测试剂盒的检测方法,其步骤是:

第一步,从待测样品香菇菌丝体或子实体中提取总RNA,提取方法是:

(1)、待测样品0.1-0.2克,放置于1.5mL离心管中,液氮冰冻;

(2)通过振荡器剧烈震荡,用玻璃棒将菌丝体或子实体样品研碎,细度达50-80 目;

(3)、加入0.4-0.6mL十六烷基三甲基溴化铵提取液匀浆,再加入2-硫醇基苯并 噻唑至终浓度为2%w/v,振荡混匀;

(4)、45-65℃温育30-60min,再加入0.4-0.8mL氯仿,混匀5-10min;

(5)、8000-15000g离心5-10min,上层水相移到一个新离心管中;

(6)、加入0.5-1.5倍体积的异丙醇,混匀,-20℃放置30-60min;

(7)、8000-15000g离心10-20min,弃去上清;

(8)、70%v/v乙醇洗涤沉淀,8000-15000g离心2-5min,再用无水乙醇洗涤;

(9)、弃去上清,真空干燥5-15min;

(10)、沉淀溶于30-100μL三羟甲基氨基甲烷-乙二胺四乙酸缓冲液pH8.0中,-20 ℃保存备用;

第二步,以提取的总RNA为模板,用设计的第一对和第二对引物分别对RNA进行 RT-PCR扩增;

RT-PCR反应体系包括:

进行RT-PCR的反应条件是,首先42-50℃反转录30-60min,然后94℃变性3min; 以94℃ 30sec,50-58℃ 1min,72℃ 1min为一个循环,共进行30-35个循环;最后 72℃延伸5-10min;

反应中使用的反转录酶为莫洛尼鼠类白血病毒反转录酶,DNA聚合酶使用Taq酶或 高保真DNA聚合酶Pfu,酶混合试剂中两种酶混合的酶单位比例为U∶U=1∶0.5-2;

第三步,取PCR反应液进行琼脂糖凝胶电泳,判断样品:

两条扩增条带的分子大小为400bp和600bp,则待测样品为阳性;两对引物都没有 扩增产物,则待测样品为无病毒样品;两对引物PCR检测结果只有一对引物的结果呈 阳性,则将这对引物换为第三对引物,与第一次检测时呈阴性的引物分别对待测样品进 行第二次RT-PCR,反应条件与第一次RT-PCR的条件相同;第二次PCR结果只要任何 一对引物的结果呈阳性,都判断待测样品有病毒污染。

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