[发明专利]携带修饰物的核苷酸及其制备方法和用于基因测序的方法无效
申请号: | 201010155269.9 | 申请日: | 2010-04-13 |
公开(公告)号: | CN101942000A | 公开(公告)日: | 2011-01-12 |
发明(设计)人: | 盛司潼 | 申请(专利权)人: | 深圳华因康基因科技有限公司 |
主分类号: | C07H19/20 | 分类号: | C07H19/20;C07H19/10;C07H1/00;C09K11/06;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
地址: | 518057 广东省深圳市南*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 携带 修饰 核苷酸 及其 制备 方法 用于 基因 | ||
1.一种携带修饰物的核苷酸,结构通式如下:
dNTP-R;
式中dNTP为核苷酸,其特征在于:
修饰物-R连接在核苷酸中除脱氧核糖上-OH以外的位置,其包含至少一个可切除位点、至少一个标记物。
2.根据权利要求1所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,-R的结构为:-R1-R2;
其中,-R1为第一修饰物,连接在碱基上;
-R2是第二修饰物,包含一个可切除位点、一个标记物。
3.根据权利要求2所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,所述第一修饰物-R1携带氨基末端,第二修饰物-R2携带醛基末端,两者以酯键结合成为所述修饰物-R。
4.根据权利要求3所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,所述第一修饰物-R1的结构是长度为n的碳链并结合氨基末端,即:
-CnHm-NH-,其中n、m均为正整数。
5.根据权利要求2所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,所述第二修饰物-R2的结构为:-R21-R22;
其中,-R21是可切除位点;-R22是标记物。
6.根据权利要求5所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,所述可切除位点-R21的结构由双硫键构成,即:-S-S-,可通过还原剂打开。
7.根据权利要求5所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,所述可切除位点-R21为吡喃醇结构,即:
可在其6h位置的C-O键打开。
8.根据权利要求5所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,所述标记物-R22包括荧光标记物,或生物素标记物。
9.根据权利要求1所述的携带修饰物的核苷酸,其特征在于,核苷酸dNTP包括:dATP、dGTP、dCTP、dUTP。
10.一种携带修饰物的核苷酸的制备方法,其特征在于,所述方法包括:
将脱氧核糖上-OH以外的位置连有第一修饰物-R1的核苷酸,与带有可切除位点的第二修饰物-R2进行反应,结合成为携带修饰物的核苷酸dNTP-R。
11.根据权利要求10所述的携带修饰物的核苷酸的制备方法,其特征在于,所述方法包括:
A.将第一修饰物-R1连接到核苷酸中除脱氧核糖上-OH以外的位置,生成dNTP-R1;
B.对标记物进行修饰,生成带有一可切除位点的第二修饰物-R2;
C.将连有第一修饰物的核苷酸dNTP-R1与第二修饰物-R2结合,生成所述携带修饰物的核苷酸dNTP-R;
其中,所述步骤A和B无先后顺序。
12.根据权利要求11所述的携带修饰物的核苷酸的制备方法,其特征在于,所述方法包括:
A1.将携带氨基末端的第一修饰物-R1连接到核苷酸中除脱氧核糖上-OH以外的位置;
B1.对标记物进行修饰,生成带有一可切除位点及醛基末端的第二修饰物-R2;
C1.将步骤A1中携带氨基末端的核苷酸,与携带醛基末端的第二修饰物-R2进行反应,以酯键结合,生成所述携带修饰物的核苷酸;
其中,所述步骤A1和B1无先后顺序。
13.根据权利要求12所述的携带修饰物的核苷酸的制备方法,其特征在于,所述步骤A1包括:
将结构为-CnHm-NH2的氨基修饰物结合到核苷酸中的碱基上,其中n、m均为正整数。
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