[发明专利]一种PIK3CA基因突变检测液相芯片

权利要求书

1.一种PIK3CA基因突变检测液相芯片，其特征是，主要包括有：

(A)针对PIK3CA基因的突变位点，分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物组成，所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.10中的序列；所述特异性引物是：针对Exon 9Codon542的、来源于SEQ ID NO.11或其反向互补序列中的碱基序列、和来源于SEQ ID NO.12或其反向互补序列中的碱基序列；针对于Exon 9 Codon545的、来源于SEQ ID NO.13或其反向互补序列中的碱基序列、和来源于SEQ ID NO.14～SEQ ID NO.17中一种以上的碱基序列，或来源于其反向互补序列中的一种以上的碱基序列；和/或针对Exon 20 Codon1047的、来源于SEQID NO.18或其反向互补序列中的碱基序列、和来源于SEQ ID NO.19～SEQ ID NO.20中一种以上的碱基序列，或来源于其反向互补序列中的一种以上的碱基序列；上述特异性引物的3’端的最后3位碱基中的一个碱基为突变位点，所述特异性引物的Tm值在52～58℃之间；

(B)分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球，所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.71～SEQ ID NO.80中的序列，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；

(C)用于扩增出具有Exon 9和/或Exon 20的相应突变位点的PIK3CA基因目标序列的扩增引物。

2.根据权利要求1所述的PIK3CA基因突变检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为：当特异性引物来源于SEQ ID NO.11～SEQ ID NO.17或其反向互补序列时，针对Exon 9的扩增引物为SEQ ID NO.81～SEQ ID NO.82；当特异性引物来源于SEQ ID NO.18～SEQ ID NO.20或其反向互补序列时，针对Exon 20的扩增引物为SEQ ID NO.83～SEQ ID NO.84。

3.根据权利要求1所述的PIK3CA基因突变检测液相芯片，其特征是，所述特异性引物为：针对Exon9 Codon542野生型的SEQ ID NO.21或SEQ ID NO.22，以及Codon542突变型E542K的SEQ ID NO.23或SEQ ID NO.24；和/或针对Exon9 Codon545野生型的SEQ ID NO.25或SEQ IDNO.26，以及突变型中的E545K突变位点的SEQ ID NO.27或SEQ ID NO.28、E545G突变位点的SEQ ID NO.29或SEQ ID NO.30、E545A突变位点的SEQ ID NO.31或SEQ IDNO.32、和/或E545D突变位点的SEQ ID NO.33或SEQ ID NO.34；和/或针对Exon 20 Codon1047野生型的SEQID NO.35或SEQ ID NO.36，以及突变型中的H1047R突变位点的SEQ ID NO.37或SEQ IDNO.38、和/或H1047L突变位点的SEQ ID NO.39或SEQ ID NO.40。

4.根据权利要求1所述的PIK3CA基因突变检测液相芯片，其特征是，所述特异性引物为：针对Exon 9 Codon542野生型的SEQ ID NO.51或SEQ ID NO.52，以及Codon542突变型E542K的SEQ ID NO.53或SEQ ID NO.54；和/或针对Exon 9 Codon545野生型的SEQ ID NO.55或SEQ IDNO.56，以及突变型中的E545K突变位点的SEQ ID NO.57或SEQ ID NO.58、E545G突变位点的SEQ ID NO.59或SEQ ID NO.60、E545A突变位点的SEQ ID NO.61或SEQ ID NO.62、和/或E545D突变位点的SEQ ID NO.63或SEQ ID NO.64；和/或针对Exon 20 Codon1047野生型的SEQID NO.65或SEQ ID NO.66，以及突变型中的H1047R突变位点的SEQ ID NO.67或SEQ IDNO.68、和/或H1047L突变位点的SEQ ID NO.69或SEQ ID NO.70。