[发明专利]一种产油微生物RNA的提取方法无效
申请号: | 201010176579.9 | 申请日: | 2010-05-19 |
公开(公告)号: | CN102250875A | 公开(公告)日: | 2011-11-23 |
发明(设计)人: | 唐伟;张素芳;谭海东 | 申请(专利权)人: | 中国科学院大连化学物理研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 马驰 |
地址: | 116023 *** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 产油 微生物 rna 提取 方法 | ||
1.一种从产油微生物中提取高质量RNA的方法,其特征在于:
产油菌体首先采用液氮研磨成粉末、然后于RNA提取缓冲液中采用玻璃珠振荡进行细胞破碎,得细胞破碎液;在细胞破碎液中加入有机溶剂去除油脂,离心后取水相,加入醋酸钠、酸性苯酚、氯仿和异戊醇除去胞内蛋白,离心后取水相加入异丙醇沉淀RNA,洗涤沉淀,真空干燥后加入DEPC处理水溶解。
2.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:所述的产油微生物为产油真菌、产油细菌和/或产油微藻。
3.按照权利要求2所述的方法,其特征在于:所述产油真菌为Rhodosporidium toruloides、Cryptococcus curvatus、Yarrowia lipolyica、Rhodotorula glutinis、Rhizopus arrhizus、Lipomyces starkeyi、Mortierellaisabellina、Mucor circinelloides、Cunninghamella中的一种或多种,产油细菌为Croynebacterium、Nocardia和Mycobacterium中的一种或多种;产油微藻为Botryococcus braunii、Crypthecodinium cohnii、Chlorellaprotothecoides、Nannochloropsis sp.和Schizochytrium limacinum中的一种或多种。
4.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:具体操作过程为,
1)取细胞密度为1×107-1×108细胞/ml的菌体经液氮速冻的产油菌体研磨破碎0.5-30min至粉末状,刮取粉末装于离心管中,加入RNA提取缓冲液,菌体与RNA提取缓冲液体积比例为10ml∶1-2ml;
2)向离心管中加入玻璃珠间歇振荡,总的破碎时间为0.5-30min;每10ml菌体加入0.5-1.5g玻璃珠;
3)向离心管中加入有机溶剂,充分混匀后0-4℃,12000-18000×g离心5-10min;有机溶剂的量为1/4-3/4RNA提取缓冲液体积;
4)取分层后的水相转移至干净的离心管中,加入浓度为3M、pH为4.6的醋酸钠和体积比为25∶24∶1酸性苯酚/氯仿/异戊醇混合液,充分混匀0-4℃,12000-18000×g离心5-15min;按10ml菌体计,加入100μ1的醋酸钠和1ml混合液;
5)取分层后的水相转移至干净的离心管中,加入等体积异丙醇混匀,置于0--70℃放置5min-16h,然后0-4℃,12000-18000×g离心5-15min获得沉淀的RNA。
5.按照权利要求4所述的方法,其特征在于:获得的RNA沉淀用70%的乙醇洗涤干燥后加入DEPC处理水溶解保存。
6.按照权利要求1或4所述的方法,其特征在于:RNA提取缓冲液为内含4M异硫氰酸胍、0.5wt%十二烷基肌氨酸钠、25mM柠檬酸钠、pH7.0、0.5wt%巯基乙醇的水溶液。
7.按照权利要求4所述的方法,其特征还在于:所述的玻璃珠振荡破碎方法为间歇振荡,每次振荡10s-10min后置于冰上冷却0.5-10min,总的破碎时间为0.5-30min,玻璃珠直径为0.2-1mm。
8.按照权利要求1或4所述的方法,其特征还在于:所述去除油脂的有机溶剂为氯仿、二氯甲烷、石油醚或它们之间的任意比例混合。
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