[发明专利]盖塔病毒全基因组序列、扩增方法及引物无效

专利信息
申请号: 201010179096.4 申请日: 2010-05-17
公开(公告)号: CN102250924A 公开(公告)日: 2011-11-23
发明(设计)人: 梁国栋;王力华;付士红 申请(专利权)人: 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
主分类号: C12N15/40 分类号: C12N15/40;C12N15/10;C12N15/11
代理公司: 北京北新智诚知识产权代理有限公司 11100 代理人: 郭佩兰
地址: 100052 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 病毒 基因组 序列 扩增 方法 引物
【权利要求书】:

1.盖塔病毒全基因组序列,其特征在于:基因组全长包括11690个核苷酸,不包括5’端帽子结构、3’端的多聚核苷酸尾,整个基因组编码一个多聚蛋白,5’端2/3编码非结构蛋白,3’端1/3编码结构蛋白,序列如下:

ATGGCGGACGTGTGACATCACCGTTCGCTCTTTCTAGGATCCTTTGCTACTCCACATAGT

GAGAGACAAACAACCCAAATGAAGGTAACCGTGGACGTTGAGGCTGATAGCCCATTCC

TTAAGGCCCTTCAGAAGGCGTTTCCCGCCTTTGAGGTTGAATCACAGCAGGTCACACCG

AATGACCATGCTAACGCTAGAGCATTTTCGCATCTGGCTACTAAACTGATTGAGCAAGAG

GTTCCAACAGGCGTCACCATCCTGGACGTGGGTAGTGCACCCGCAAGGAGGTTGATGTC

TGACCACACCTACCACTGCATCTGCCCCATGAAAAGTGCGGAAGACCCAGAGAGACTG

GCGAATTACGCTCGAAAGCTGGCGAAAGCATCGGGGACTGTGCTAGACAAGAATGTGT

CCGGAAAGATAACGGACCTACAAGACGTCATGGCCACTCCAGACTTGGAATCCCCGACT

TTTTGCCTGCATACTGACGAGACGTGCCGCACTAGGGCTGAGGTCGCCGTGTACCAGGA

CGTATACGCTGTGCACGCACCGACGTCACTGTACCACCAGGCCATCAAAGGCGTCAGGA

CGGCGTATTGGATTGGATTCGACACCACTCCATTCATGTTCGAGGCACTAGCGGGCGCGT

ACCCTGCGTACTCGACCAACTGGGCAGATGAGCAAGTGCTGCAAGCTCGTAACATCGGC

CTGTGCGCGACAGGCCTCTCCGAGGGGCGTCGCGGCAAACTCTCCATTATGAGAAAAA

AGTGCTTGCGACCGAGCGACAGAGTAATGTTTTCGGTCGGGTCCACCTTGTACACCGAG

AGCCGAAAGCTGCTGCGCAGCTGGCATTTACCTTTCGTGTTTCACCTGAAGGGTAAGAA

CAGTTTTACCTGCAGGTGCGACACGGTGGTGTCATGCGAAGGTTATGTGGTAAAGAAGA

TCACCATAAGCCCGGGCATATATGGAAAAACAGTCGATTACGCAGTTACCCATCACGCAG

AGGGTTTCCTGATGTGTAAGATCACTGATACAGTCAGAGGAGAAAGAGTCTCTTTCCCG

GTCTGTACCTATGTGCCTGCAACCATATGCGACCAGATGACGGGTATACTTGCCACTGAT

GTGACACCAGAGGATGCCCAGAAGCTCCTGGTTGGATTGAACCAACGCATAGTGGTGA

ACGGTAGGACGCAAAGAAACACAAACACAATGAAAAACTACCTACTGCCAGTGGTAGC

GCAAGCATTCAGTAAATGGGCACGAGAGGCACGCGCAGACATGGAGGACGAAAAACCC

CTAGGCACCAGAGAACGCACGTTGACGTGTTGTTGCCTGTGGGCGTTCAAAAGCCACA

AAACCCACACCATGTATAAGCGGCCTGAAACACAAACTATCGTCAAAGTGCCTTCCACT

TTTGACTCCTTTGTGATACCGAGCCTGTGGTCATTCAGTCTTTCCATGGGTATCAGACAG

AGGATCAAATTGCTACTCAGCGCAAGAATGGCCCAAGGCCTACCATACTCAGGAGATCG

CACTGAAGCTCGCGCGGCAGAAGAAGAAGAGAAGGAGGTGCAGGAGGCTGAACTTAC

GAGGGCAGCGCTGCCACCGCTAGTGAGCGGCTCTTGTGCTGACGATATCGCCCAGGTGG

ATGTAGAGGAACTAACCTTCAGAGCCGGAGCCGGGGTTGTGGAAACACCCAGGAATGC

CCTGAAGGTTACACCGCAAGCACACGACCATCTCATAGGCTCCTACTTGATCCTTTCCCC

CCAAACGGTGTTGAAAAGCGAGAAGCTGGCACCCATCCACCCTCTTGCTGAGCAAGTC

ACGGTCATGACCCACTCTGGAAGATCCGGCAGATACCCAGTCGACAAGTACGACGGAC

GGGTATTGATCCCAACAGGAGCAGCCATCCCAGTGAGTGAGTTCCAGGCACTCAGCGA

GAGCGCAACCATGGTGTACAATGAGAGGGAATTTATAAATCGCAAGCTACACCACATAG

CGCTATACGGGCCAGCCTTGAATACCGACGAGGAAAGCTACGAAAAAGTGAGAGCCGA

AAGGGCAGAGACAGAGTATGTGTTCGACGTGGACAAGAAGGCATGTATCAAGAAGGAG

GAGGCATCAGGCCTTGTGTTAACAGGGGACCTAATCAATCCACCTTTCCACGAATTCGCA

TACGAAGGACTCAAGATCCGCCCAGCAGCCCCGTACCACACGACGATCATTGGTGTGTT

TGGCGTTCCGGGTTCGGGCAAGTCGGCTATCATTAAGAATATGGTGACGACTCGCGATCT

GGTGGCCAGTGGAAAGAAGGAGAACTGCCAAGAGATCATGAATGATGTAAAGAGGCAA 

CGCGGGTTGGACGTAACCGCTAGGACCGTCGACTCAATCTTATTGAATGGGTGCAAGAA

AGGCGTAGAAAACCTTTACGTCGATGAGGCGTTCGCGTGTCACTCGGGTACTTTGCTAG

CGCTCATCGCGCTGGTGAGACCGTCAGGTAAGGTAGTACTGTGCGGCGACCCTAAGCAG

TGTGGTTTCTTCAATTTGATGCAACTGAAGGTGCACTATAACCACAACATATGTACAAGG

GTGCTCCATAAGAGCATCTCCAGAAGATGCACTCTACCTGTTACGGCGATCGTGTCCACC

CTGCACTACCAAGGGAAGATGAGAACGACGAACCGATGCAACACCCCCATTCAGATTG

ACACCACCGGTTCCTCCAAACCAGCCTCAGGAGATATCGTGTTAACGTGCTTCCGCGGC

TGGGTGAAGCAACTGCAAATCGACTATCGTGGACACGAGGTGATGACCGCAGCCGCTTC

CCAGGGTCTGACAAGGAAAGGCGTGTACGCCGTGAGACAGAAAGTGAACGAAAACCC

ACTGTACTCACCTCTGTCGGAGCACGTCAACGTGCTGTTGACCCGAACTGAAAACCGAC

TGGTGTGGAAGACACTGTCGGGTGACCCGTGGATAAAGGTGTTAACCAATGTTCCACGT

GGGGATTTCAGTGCAACTCTGGAGGAATGGCAAGAAGAACATGACGGTATCATGAGAG

TGTTGAACGAGCGACCGGCGGAGGTCGATCCATTCCAAAACAAGGCTAAGGTGTGCTG

GGCAAAATGTCTGGTGCAAGTTCTTGAGACGGCCGGAATACGTATGACGGCAGATGAAT

GGAACACCATCTTGGCTTTCAGAGAGGACAGAGCGTACTCACCAGAAGTCGCTCTCAA

CGAGATTTGCACTCGTTACTACGGCGTTGACCTAGACAGCGGCCTATTCTCAGCGCAGTC

GGTTTCCCTCTTTTATGAGAACAACCATTGGGACAACAGGCCTGGAGGACGCATGTACG

GGTTCAACCATGAAGTAGCCAGGAAATACGCAGCCAGGTTTCCATTTCTACGTGGCAAC

ATGAACTCGGGGCTACAACTAAATGTCCCTGAGAGGAAGCTCCAGCCCTTTAGCGCTGA

ATGCAACATAGTCCCATCCAATCGTCGGTTACCGCATGCTCTGGTCACAAGTTATCAGCA

GTGCCGTGGGGAGAGGGTAGAGTGGTTGCTGAAAAAGATTCCAGGTCACCAAATGTTA

CTCGTAAGTGAGTACAACCTGGTGATACCTCACAAAAGAGTCTTCTGGATTGCACCTCC

GCGGGTGTCAGGCGCGGACCGCACGTACGACTTGGACCTAGGGTTACCTATGGATGCAG

GCCGTTACGACCTGGTATTCGTCAACATCCATACTGAGTACCGGCAACACCACTACCAAC

AATGCGTCGACCATTCAATGCGCCTGCAGATGCTGGGAGGGGATTCACTACACCTGCTC

AGACCAGGAGGCTCGCTGCTGATGAGAGCATATGGTTACGCAGACAGAGTCAGCGAGA

TGGTGGTGACAGCCCTGGCTAGGAAATTCTCGGCGTTCCGTGTCCTGAGACCGGCGTGT

GTGACGAGCAACACAGAAGTGTTCCTGCTGTTTTCTAACTTTGATAACGGCAGAAGAGC

GGTAACCTTGCACCAAGCTAACCAAAAACTTAGCTCAATGTATGCCTGCAACGGATTGC

ACACTGCTGGTTGTGCACCGTCATACAGGGTCCGCCGCGCAGATAATTCAGGACACAGT

GAGGAAGCGGTCGTAAATGCTGCCAATGCCAAAGGTACCGTGAGCGACGGAGTGTGCA

GGGCGGTTGCTAAGAAGTGGCCATCATCTTTCAAAGGGGCTGCAACTCCAGTCGGCACA

GCCAAAATGATCCGCGCAGATGGCATGACCGTAATCCACGCAGTGGGACCAAACTTCTC

CACCGTAACAGAAGCCGAAGGGGACAGAGAGCTAGCGGCCGCGTATCGAGCTGTGGCT

AGCATAATTAGTACCAATAACATAAAGAGCGTCGCTGTACCGCTGCTGTCCACAGGCACC

TTCTCCGGCGGTAAGGACAGAGTGATGCAGTCCTTGAACCACTTATTCACGGCACTGGA

CGCAACCGACGCAGACGTGGTTATCTACTGCAGAGATAAAAACTGGGAAAAGAAGATT

CAGGAAGCCATCGACAGGCGGACGGCAATCGAGCTCGTATCTGAAGACGTGACCTTGG

AAACCGATCTGGTTAGGGTACACCCGGACAGTTGCTTAGTCGGCAGAAATGGTTACAGT

GCAACTGACGGTAAACTGTACTCTTACCTTGAGGGCACGAGGTTCCACCAGACGGCGGT

CGACATGGCTGAAATATCAACTTTATGGCCAAGACTCCAAGATGCTAACGAGCAGATCT

GCCTGTACGCCCTAGGGGAGACGATGGACAGCATACGCACTAAATGCCCAGTAGAGGAC

GCCGATTCGTCTACGCCGCCGAAAACGGTACCGTGTCTATGTCGGTATGCGATGACCGCG

GAGCGGGTTGCCAGACTTAGGATGAATAACACCAAAAACATCATCGTGTGCTCCTCCTT

TCCATTACCGAAGTACAGGATAGAAGGCGTGCAGAAGGTGAAGTGTGACCGAGTGCTA

ATTTTTGACCAGACCGTCCCGTCACTAGTAAGTCCCAGAAAGTACATACAGCAGCCGCC

GGAACAGCTGGATAATGTGAGCCTGACTTCTACGACGTCGACGGGATCCGCATGGTCAT 

TTCCATCGGAAACGACCTACGAAACCATGGAAGTCGTAGCCGAGGTACACACCGAACCT

CCAATCCCTCCGCCTCGCCGACGTAGAGCAGCCGTCGCCCAACTTAGACAGGATCTGGA

AGTCACCGAGGAGATCGAGCCGTACGTGACACAGCAAGCAGAGGTCGTGGTCATGGAG

AGGGTCGCGACGACAGACATACGCGCTATCCCAGTCCCGGCACGGCGGGCCATTACAAT

GCCAGTCCCAGCCCCCAGGGTTCGTAAGGTCGCTACTGAACCTCCATTAGAACCGGAAG

CTCCTATCCCGGCACCAAGAAAGAGAAGAACCACTAGCACCGCACCTCCGCATAACCCC

GAGGATTTCGTTCCCAGGGTACCTGTTGAGTTACCGTGGGAGCCGGAAGACCTAGACAT

CCAATTCGGTGACTTGGAGCCACGCCGCCGGAACACCAGGGACCGAGATGTCAGCACA

GGAATACAGTTCGGTGACATCGACTTTAACCAGTCCTGACTAGGCAGGGCTGGCGCGTA

TATCTTTTCGTCTGACACTGGCCCGGGTCACCTACAACAGAAGTCCGTAAGGCAACATG

AATTGCCATGCGAGACTCTGTACGCCCATGAAGACGAACGCATATACCCGCCGGCATTTG

ACGGAGAGAAAGAAAAAGTACTCCAGGCAAAGATGCAGATGGCCCCGACAGAAGCGA

ATAAGAGCAGGTACCAGTCGAGGAAAGTAGAGAACATGAAGGCATTAATTGTAGAAAG

ATTACGCGAAGGAGCAAAGTTGTACCTCCATGAGCAAACCGACAAAGTACCCACGTAC

ACCAGCAAGTACCCTAGACCTGTGTACTCACCATCGGTGGATGACAGCCTGAGCGATCC

GGAAGTGGCTGTGGCCGCCTGTAACTCTTTCTTAGAGGAGAATTATCCAACCGTGGCGA

ACTACCAGATAACCGATGAGTATGACGCTTATCTGGACTTGGTCGACGGCTCTGAAAGCT

GCCTCGACAGAGCTACGTTCTGCCCGGCCAAACTAAGATGTTACCCTAAGCACCACGCA

TACCACCAACCACAAATCAGGAGCGCAGTACCTTCCCCTTTTCAAAACACGCTACAAAA

CGTGCTAGCCGCGGCCACTAAAAGAAATTGCAACGTCACCCAAATGAGAGAATTACCAA

CCATGGACTCTGCGGTGTTCAACGTAGAAAGCTTCAAAAAATACGCATGTACCGGCGAA

TATTGGCAAGAATTTAAAGACAATCCTATACGGATCACCACCGAAAACATAACGACGTAC

GTGGCTAAACTCAAGGGTCCAAAGGCTGCTGCCCTTTTTGCCAAGACGCATAACCTGGT

GCCGCTTCAGGAGGTGCCAATGGACCGCTTCGTGATGGATATGAAGAGAGATGTGAAAG

TTACACCAGGCACCAAGCATACCGAAGAAAGGCCAAAAGTGCAAGTTATTCAAGCGGC

GGAACCATTGGCCACGGCATATTTATGCGGAATCCACAGAGAGTTAGTCAGGCGGCTAA

AAGCCGTTCTGACCCCGAACATCCATACTCTGTTTGACATGTCGGCGGAGGACTTTGATG

CCATCATAGCGGCACATTTCCAACCGGGAGATGCTGTACTGGAGACAGATATCGCATCCT

TCGACAAGAGCCAAGACGACTCCTTAGCGCTAACAGCGCTGATGCTTCTGGAAGACCTC

GGGGTCGACCAAGAACTGCTGGACCTTATCGAAGCTGCGTTTGGTGAGATCACGAGTGT

GCATCTACCTACCGGTACAAGATTTAAATTCGGTGCTATGATGAAGTCAGGAATGTTTCTT

ACACTCTTCATCAACACGCTGCTGAACATTGTCATAGCGTGCCGCGTCTTACGCGACAAA

TTATCGTCCTCGGCGTGCGCCGCCTTCATAGGTGATGACAACATAGTGCACGGCGTGAG

GTCAGACCCGCTAATGGCAGAAAGGTGTGCGAGTTGGGTCAACATGGAAGTAAAGATC

ATCGATGCCACAATGTGTGAGAAACCACCGTACTTTTGTGGAGGATTCATCCTGTACGAC

AGTGTCGCCGGTACAGCGTGTAGGGTTGCAGACCCGTTAAAGAGGCTGTTCAAACTCG

GGAAACCGCTCCCGGCGGACGACAACCAGGATGAAGACAGAAGAAGGGCACTAAAAG

ATGAAACAGTTAAGTGGTCCCGCATAGGATTGAGAGAAGAATTAGACGTGGCATTGAGC

TCAAGATACCAAGTCAGTGGCGTCGGAAACATCACTAGAGCGATGTCCACGCTGTCTAA

GAGTTTGAAGTCTTTTAGGAAAATAAGAGGTCCCATCATACATCTGTACGGCGGTCCTAA

ATAGATGCAGGATTACACTACATCTAAAGACCACGTATTACAGACACCATGAATTACATT

CCAACTCAAACCTTTTACGGACGCCGTTGGCGACCACGCCCGGCGTACCGTCCATGGCG

GGTGCCGATGCAGCCGGCCCCACCCATGGTGATTCCTGAGCTGCAAACTCCGATCGTCC

AGGCCCAACAGATGCAGCAGCTAATCAGTGCAGTTTCTGCCCTGACGACCAAGCAAAAT

GGCAAAGCACCGAAGAAGCCGAAGAAAAAGCCGCAAAAAGCGAAGGCTAAGAAAAA

CGAACAGCAAAAGAAGAACGAGAACAAGAAACCACCACCTAAGCAGAAGAATCCGGC

TAAGAAGAAGAAACCAGGAAAAAGGGAACGCATGTGCATGAAGATAGAGAATGATTGC 

ATCTTCGAGGTCAAGCTTGACGGTAAGGTCACGGGATACGCCTGCCTAGTCGGGGATAA

AGTGATGAAGCCGGCACACGTCAAAGGTGTGATCGACAACCCCGATCTAGCGAAGCTT

ACCTACAAGAAATCGAGTAAGTATGACCTGGAGTGCGCCCAGATACCAGTGCACATGAA

GTCAGATGCTTCAAAGTACACCCATGAAAAACCGGAAGGGCACTACAATTGGCATCACG

GTGCAGTGCAGTACAGCGGTGGCAGGTTCACAATCCCGACAGGCGCAGGTAAACCAGG

AGACAGCGGCCGGCCGATCTTCGACAACAAAGGACGCGTGGTGGCCATTGTCCTGGGA

GGGGCCAACGAAGGAGCCAGGACTGCCCTATCCGTCGTGACCTGGACCAAAGACATGG

TCACACGGTACACCCCAGAAGGAACAGAAGAATGGTCTGCCGCCTTGATGATGTGCGTC

CTAGCCAACGTTACATTCCCATGCTCAGAGCCCGCGTGTGCACCCTGTTGCTATGAAAAA

CAACCAGAACAGACACTGAGGATGTTAGAGGACAACGTGGACCGCCCGGGCTACTACG

ACCTGCTCGAGGCCACGATGACGTGTAACAACAGTGCACGCCACCGTCGCAGTGTGAC

GGAACACTTCAATGTCTACAAGGCCACGAAACCGTATCTAGCGTATTGCGCGGACTGCG

GAGACGGGCAGTTCTGTTACAGCCCGGTGGCTATAGAAAAAATTAGAGATGAGGCTTCC

GATGGCATGATAAAAATCCAGGTCGCAGCGCAAATTGGCATCAACAAAGGAGGAACAC

ACGAACACAACAAAATCAGGTACATCGCCGGGCATGACATGAAAGAGGCAAACCGGGA

TTCTTTACAAGTGCATACTTCCGGTGTGTGCGCTATTCGAGGCACGATGGGCCACTTCAT

CGTGGCCTACTGCCCTCCAGGGGACGAACTAAAGGTCCAATTCCAAGATGCAGAATCGC

ACACCCAGGCCTGCAAAGTGCAGTACAAACACGCACCGGCCCCAGTAGGCAGAGAAA

AATTCACCGTCAGGCCCCACTTCGGTATCGAAGTGCCATGCACAACGTACCAGCTGACT

ACCGCACCGACGGAGGAAGAGATCGACATGCATACCCCGCCGGATATCCCAGACATAAC

GTTGCTGTCGCAGCAGTCAGGCAATGTAAAGATCACAGCAGGAGGAAAAACCATCAGA

TACAACTGCACGTGTGGTAGTGGCAACGTGGGCACCACCAGTAGCGACAAGACTATCAA

TTCGTGCAAAATAGCACAGTGCCACGCTGCGGTGACTAACCACGATAAGTGGCAGTACA

CCTCCTCGTTTGTCCCTAGAGCCGACCAGTTGTCTCGCAAAGGTAAAGTGCACGTACCT

TTCCCTCTGACCAACTCCACTTGCAGGGTGCCTGTCGCACGTGCACCAGGTGTCACATA

CGGAAAGAGAGAACTGACAGTGAAACTGCACCCAGATCATCCCACGCTGTTGACGTAC

CGGAGTCTAGGAGCGGATCCGCGTCCGTATGAGGAGTGGATAGACCGATACGTCGAACG

GACCATACCGGTGACCGAAGATGGGATCGAGTACAGATGGGGAAACAACCCACCCGTG

CGCTTGTGGGCCCAGCTGACAACTGAAGGCAAACCCCATGGGTGGCCGCACGAGATCA

TACTCTATTACTATGGACTATACCCAGCAGCCACCATCGCCGCCGTCTCAGCCGCGGGTC

TCGCAGTCGTACTATCGCTGCTGGCGTCATGTTACATGTTCGCCACTGCACGCCGCAAGT

GCCTGACCCCATACGCCCTGACCCCCGGAGCTGTCGTCCCGGTAACACTAGGAGTACTA

TGCTGCGCACCACGAGCGCATGCCGCGTCATTTGCGGAATCTATGGCGTATCTATGGGAT

GAGAATCAAACCCTGTTTTGGCTGGAGCTTGCAACGCCGCTCGCTGCCATAATCATACTT

GTATGTTGCCTGAAGAACCTGCTTTGCTGCTGCAAACCGCTTTCTTTTTTAGTGCTGGTG

AGCCTGGGAACTCCCGTCGTAAAATCTTACGAACACACCGCAACGATCCCGAATGTGGT

GGGATTCCCGTATAAGGCTCACATTGAGAGGAACGGCTTCTCCCCGATGACCCTACAGC

TTGAAGTACTAGGAACCAGCTTGGAACCCACGCTAAACTTAGAGTACATAACCTGTGAA

TACAAGACAGTCGTGCCATCACCTTATATCAAGTGCTGCGGGACATCAGAATGCAGATCC

ATGGAGCGCCCCGACTATCAATGTCAGGTCTACACAGGAGTGTACCCATTTATGTGGGGC

GGCGCATACTGCTTCTGCGACACTGAGAACACCCAGCTGAGTGAAGCATACGTTGATAG

ATCGGACGTATGCAAGCACGACCATGCCGCCGCCTACAAGGCGCACACTGCGGCAATGA

AAGCCACCATCCGAATAAGCTACGGGAACCTCAATCAGACAACAACGGCGTTCGTCAA

CGGGGAGCACACAGTGACCGTCGGAGGCAGCAGGTTTACTTTTGGTCCAATCTCCACTG

CCTGGACGCCTTTCGACAACAAGATCGTCGTCTACAAGAACGACGTCTACAACCAGGA

CTTCCCACCCTACGGGTCAGGACAACCAGGGAGGTTTGGAGACATCCAGAGCAGGACG

GTAGAGAGCAAGGACCTGTATGCCAACACCGCCCTCAAGTTGTCAAGACCTTCGTCCGG 

TACTGTTCACGTGCCTTACACACAGACCCCTTCTGGCTTTAAGTACTGGATAAAAGAGA

GAGGCACGTCGCTGAATGACAAGGCTCCCTTTGGATGCGTAATCAAGACCAACCCAGTC

AGAGCGGAAAATTGCGCCGTTGGCAACATCCCAGTCTCCATGGACATCCCGGACACCGC

GTTTACGCGCGTGATTGATGCACCTGCCGTCACAAACCTGGAGTGCCAAGTGGCGGTCT

GCACGCACTCATCGGACTTCGGCGGGATCGCGACTCTGACATTCAAAACTGACAAACCC

GGAAAATGTGCTGTCCATTCTCATTCGAATGTAGCCACCATACAGGAGGCAGCTGTGGA

CATCAAAACAGATGGCAAGATAACCCTGCATTTCTCTACAGCATCAGCATCCCCGGCATT

CAAGGTATCTGTGTGCAGTGCCAAAACGACATGCATGGCAGCGTGTGAGCCGCCGAAG

GATCACATCGTCCCTTATGGGGCGAGCCATAACAACCAAGTTTTTCCTGACATGTCTGGC

ACGGCAATGACATGGGTGCAGCGGGTAGCCGGTGGACTCGGCGGGCTAACACTCGCCG

CAGTGGCAGTACTTATATTGGTGACGTGTGTGACCATGCGCCGCTAACCGGGAGGCTTG

ACATAATGTATATATATAAGCATCATATTTTTAATAAAGCATATAAATAATCAAGTAGATCAA

AGGGCTACCTAACCCCTGAATAGTAACAAAACGCAAAAATACAAAAACATTAGTTCAAA

GGGCCAGTAACCCCTGAATAGTAACAAAATATAAAAACCAAAAACAGTAGTTCAAAGG

GCTATACAACCCCTGAATAGTAACAAAATGCAGAAAAACCATAAAAATTATAAAATTAAC

TAATCAGATCATCTAAATTTGACTAATTGGAAATAGCCGAACTCTACGGAGATGTAGGCG

TCCGAACTCCACGGAGACGTAGGACAAAATTCTGCCGAACCCCAGACCATCGGGGACG

TAGGCGTCTAATTTGTTTTTTTAATATTTTAC。

2.权利要求1所述的盖塔病毒全基因组序列扩增用引物,其特征在于:引物覆盖整个病毒基因组,扩增片段长度为900-1000个碱基,相邻片段之间有70-120个碱基的重叠区,所有引物不包含简并碱基,100%与盖塔病毒序列相同,引物的3’端为C,G或T保证稳定地与cDNA序列结合,所有引物的退火温度,GC含量基本相同,从而保证所有引物能够在相同的PCR条件下进行扩增反应,所述引物序列如下:

GETA_F1:    5’_ATG GCG GAC GTG TGA CAT CAC_3’

GETA_R1:    5’_GTA ACC TTC GCA TGA CAC CAC C_3’

GETA_F2:    5’_GGC ATT TAC CTT CCG TGT TTC_3’

GETA_R2:    5’_TGT GCT TGC GGT GTA ACC TTC_3’

GETA_F3:    5’_TAG TGA GCG GCT CTT GTG CTG_3’

GETA_R3:    5’_CCG CAC AGT ACT ACC TTA CCT GAC_3’

GETA_F4:    5’_GAT GAG GCG TTC GCG TGT CAC T_3’

GETA_R4:    5’_GGT AAC CGA CGA TTG GAT GGG ACT_3’

GETA_F5:    5’_TCT ACG TGG CAA CAT GAA CTC G_3’

GETA_R5:    5’_CGT GAA TAA GTG GTT CAA GGA CTG C_3’

GETA_F6:    5’_GCT GTG GCT AGC ATA ATT AGT ACC_3’

GETA_R6:    5’_TGG GAT AGC GCG TAT GTC TGT_3’

GETA_F7:    5’_GTC GCC CAA CTT AGA CAG G_3’

GETA_R7:    5’_TGG TTG GTG GTA TGC GTG G_3’

GETA_F8:    5’_CCG ATG AGT ATG ACG CTT ATC TGG_3’

GETA_R8:    5’_ACT TCC ATG TTG ACC CAA CTC_3’ 

GETA_F9:     5’_CGC TGC TGA ACA TTG TCA TAG_3’

GETA_R9:     5’_GGT TGT CGA TCA CAC CTT TG_3’

GETA_F10:    5’_GAT TGC ATC TTC GAG GTC AAG C_3’

GETA_R10:    5’_GTG CGT GTT TGT ACT GCA CTT TG_3’

GETA_F11:    5’_TGC GCT ATT CGA GGC ACG AT_3’

GETA_R11:    5’_ATG ATT ATG GCA GCG AGC GG_3’

GETA_F12:    5’_CCG GTA ACA CTA GGA GTA CTA TGC_3’

GETA_R12:    5’_TTG TCA TTC AGC GAC GTG CCT_3’

GETA_F13:    5’_CCT CAA GTT GTC AAG ACC TTC GTC_3’

GETA_R13:    5’_GTA AAA TAT TAA AAA AAC AAA TTA GAC GCC_3’ 。

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