[发明专利]一种小RNA的定量检测方法及试剂盒有效
申请号: | 201010183196.4 | 申请日: | 2010-05-19 |
公开(公告)号: | CN101831500A | 公开(公告)日: | 2010-09-15 |
发明(设计)人: | 张必良;冯世鹏 | 申请(专利权)人: | 广州市锐博生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香 |
地址: | 510663 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rna 定量 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种小RNA的定量检测方法,其特征是,包括以下步骤:
(1)bulge loop RT引物将小RNA反转录为cDNA,所述bulge loop RT引物具有40-60个核苷酸,从5’端至3‘端有分别为茎1部分,bulge部分,茎2部分,环部分,茎3部分及延伸部分;茎3部分与茎1和茎2部分互补配对,延伸部分能与小RNA互补配对;
(2)加入PCR正向引物和PCR通用反向引物进行定量PCR扩增,正向PCR引物为具有20-40个核苷酸序列,从5’端至3‘端分别为延伸部分和小RNA相似部分;小RNA相似部分为小RNA的cDNA的互补序列的一部分,其长度与bulge loop RT引物延伸部分的长度之和要大于或等于小RNA的全长;PCR反向通用引物长度为具有20-40个核苷酸的序列。
2.根据权利要求1所述的小RNA的定量检测方法,其特征是,所述PCR反向引物和/或所述bulge loop RT引物的延伸部分具有LNA或甲基化修饰。
3.根据权利要求1或2所述的小RNA的定量检测方法,其特征是,所述茎3部分与茎1和茎2部分互补配对长度为6-12碱基对;所述延伸部分的长度为3-12个碱基;所述正向PCR引物为28-32个碱基。
4.一种小RNA定量检测试剂盒,其特征是,主要包括有:
(A)具有40-60个核苷酸的bulge loop RT引物,从5’端至3‘端分别为茎1部分,bulge部分,茎2部分,环部分,茎3部分及延伸部分;茎3部分与茎1和茎2部分互补配对,延伸部分能与小RNA互补配对;
(B)具有20-40个核苷酸的正向PCR引物,从5’端至3‘端分别为延伸部分,小RNA相似部分,小RNA相似部分的长度与bulge loop RT引物延伸部分的长度之和大于或等于小RNA的全长;小RNA相似部分为小RNA的cDNA的互补序列的一部分。
5.根据权利要求4所述的小RNA定量检测试剂盒,还包括有具有20-40个核苷酸的PCR反向通用引物。
6.根据权利要求4所述的小RNA的定量检测试剂盒,其特征是,所述bulge loop RT引物是碱基组成为SEQ.NO:1、正向PCR引物的碱基组成为SEQ.NO:3;或所述bulge loop RT引物是碱基组成为SEQ.NO:2的序列、正向PCR引物的碱基组成为SEQ.NO:4;或所述bulge loopRT引物是碱基组成为SEQ.NO:6的序列、正向PCR引物的碱基组成为SEQ.NO:7。
7.根据权利要求6所述的小RNA的定量检测试剂盒,其特征是,所述PCR反向通用引物为SEQ.NO:5。
8.根据权利要求4所述的小RNA的定量检测试剂盒,其特征是,所述bulge loop RT引物的延伸部分3’端进行LNA或甲基化修饰。
9.根据权利要求4所述的小RNA的定量检测试剂盒,其特征是,所述PCR反向引物5’或3’端进行LNA修饰或甲基化修饰。
10.根据权利要求4-9任一项所述的小RNA的定量检测试剂盒,其特征是,所述茎3部分与茎1和茎2部分互补配对长度为6-12碱基对;所述延伸部分的长度为3-12个碱基。
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