[发明专利]环介导等温扩增检测人巨细胞病毒的方法、检测用试剂盒和引物组无效
申请号: | 201010183784.8 | 申请日: | 2010-05-26 |
公开(公告)号: | CN102260748A | 公开(公告)日: | 2011-11-30 |
发明(设计)人: | 杨劲;吕杭军;孟忠华 | 申请(专利权)人: | 浙江省血液中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 梁寅春 |
地址: | 310006 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环介导 等温 扩增 检测 巨细 病毒 方法 试剂盒 引物 | ||
1.检测人巨细胞病毒的LAMP扩增用特异核酸引物组,其特征在于包含扩增人巨细胞病毒基因UL122特异碱基序列的正向内引物FIP、正向外引物F3、反向内引物BIP、反向外引物B3,以及第一环引物LF和/或第二环引物LB:
UL122-F3:CCGATCCTCTGAGAGTCTGC
UL122-B3:AGTGTCCTCCCGCTCCTC
UL122-FIP:GGGTGACACCAGAGAATCAGACCTAGTGTGGATGACCTACGG
UL122-BIP:CCGCGACTATCCCTCTGTCCT CCTCTTCCTCATCACTCTGC
UL122-LF:AGGCTACAATAGCCTCTTCCTC
UL122-LB:CTGAGAACAGTGATCAGGAAGAAA
所述引物与基因UL122的172077-172342bP位的核酸序列的一部分或其互补链互补。
2.检测人巨细胞病毒的LAMP扩增用特异核酸引物组,其特征在于包含扩增人巨细胞病毒基因US14特异碱基序列的正向内引物FIP、正向外引物F3、反向内引物BIP、反向外引物B3,以及第一环引物LF和/或第二环引物LB:
US14-F3:TGTGATAGATTAGTGTTTCG
US14-B3:ACCTCCACACTTTTGAC
US14-FIP:GCTACATCGCCACCAAAAT-GTGGCGTAAAGTATCAGC
US14-BIP:GCACGTCTTGGAAAAGGAC-CTTCTACTTACACCTGGTTAC
US14-LF:ACGTCATCCGCAGCT
US14-LB:AGAGACACAGCAAAGTCT
所述引物与基因US14的172077-172342bP位的核酸序列的一部分或其互补链互补。
3.一种人巨细胞病毒的检测方法,其特征在于,以人巨细胞病毒的UL122基因库登陆号:BK000394基因序列的172077-172342bP位的核酸序列的一部分或其互补链为靶,通过LAMP法用权利要求1所述的引物选择性扩增所述靶区域,确认是否存在扩增产物。
4.一种人巨细胞病毒的检测方法,其特征在于,以人巨细胞病毒的US14基因库登陆号:BK000394基因序列的203423-203633bP位的核酸序列的一部分或其互补链为靶,通过LAMP法用权利要求2所述的引物选择性扩增所述靶区域,确认是否存在扩增产物。
5.根据权利3所述的人巨细胞病毒的检测方法,其特征在于,所述选择性扩增所述靶区域,确认是否存在扩增产物,是指:
1)提取DNA作模板;
2)环介导等温扩增
①配制扩增反应液:10×Thermopol反应缓冲液、400-1600uM dNTP、2-6mM硫酸镁、1-3uM权利要求1所述正向内引物、1-3uM权利要求1所述反向内引物、0.2-0.3uM权利要求1所述正向外引物、0.2-0.3uM权利要求1所述反向外引物、1-2uM权利要求1所述第一环引物、1-2uM权利要求1所述第二环引物和1-1.5M甜菜碱; 其中10×ThermoPol反应缓冲液含有200mM pH8.8的三羟基甲基氨基甲烷-盐酸、100mM氯化钾、100mM硫酸铵、20mM硫酸镁和1%曲拉通X-100;
②配制酶液:每微升含8-16个活性单位的Bst DNA酶;
③取所述扩增反应液,先加所述待检模板,再加所述酶液,最后加双蒸水,形成总体积为20~50ul的反应体系,混匀后在约63℃条件下恒温保温约60分钟,然后置于80℃的环境下2分钟灭活酶;
3)LAMP反应产物的检测:
A)肉眼检测:与阴性对照管比较显示,检测管出现明显浑浊为阳性,未见浑浊为阴性;或,
B)加染料后检测:每25ul体系的反应管加1000×SYBR Green-I 1-2ul,1-5分钟观察结果,反应液变绿为阳性,保持无色或棕色为阴性;或,
C)电泳检测:2-3%琼脂糖凝胶,70V电泳约60-100分钟,电泳图片显示LAMP特征性梯状条带,则结果为阳性;如无任何条带则结果为阴性。
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