[发明专利]环介导等温扩增检测人巨细胞病毒的方法、检测用试剂盒和引物组无效
申请号: | 201010183784.8 | 申请日: | 2010-05-26 |
公开(公告)号: | CN102260748A | 公开(公告)日: | 2011-11-30 |
发明(设计)人: | 杨劲;吕杭军;孟忠华 | 申请(专利权)人: | 浙江省血液中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 梁寅春 |
地址: | 310006 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环介导 等温 扩增 检测 巨细 病毒 方法 试剂盒 引物 | ||
技术领域
本发明涉及基于环介导等温扩增(LAMP)技术检测人巨细胞病毒(HumanCytomegalovirus,HCMV)的快速检测技术。具体涉及有效用于HCMV特定基因片段的核酸扩增的引物与引物组,涉及LAMP方法所用的生物试剂。
背景技术
人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)的感染极其普遍,40%的普通人群中可以检出HCMV抗体。6岁以上人群58.9%感染HCMV,80岁以上人群90.8%感染HCMV。尽管HCMV多呈隐性感染,但在免疫功能受限或低下人群中可致病,比如在新生儿、HIV感染者、器官移植患者、恶性肿瘤患者等特定人群中。HCMV在孕妇中发生垂直传播,是新生儿缺陷的首要病因。HCMV对胎儿/新生儿可引起先天性或围产期感染。HCMV在免疫正常人群中引起单核细胞增多症。输血后获得性CMV感染的表现类同单核细胞增多症。HCMV在免疫受损人群中引起CMV肺炎、胃肠道疾病与视网膜炎。
既往检测HCMV的方法中,传统技术包括细胞培养、载玻片培养法、以及较酶联免疫吸附法(ELISA法)更为特异的PP65抗原血症试验。
分子诊断技术包括聚合酶链式反应法(PCR法)、杂交捕获技术、NASBA以及分枝DNA方法等。
分子诊断技术较传统细胞学与血清学方法灵敏、特异,但需要昂贵的热循环仪或化学发光检测系统。目前尚未见等温扩增方法检测HCMV以及检测用试剂盒、引物组的报道。
发明内容
本发明要解决目前检测人巨细胞病毒周转时间长,需要使用特殊设备、费用高等问题,为此提供本发明的环介导等温扩增检测人巨细胞病毒的方法、检测用试剂盒和引物组。
本发明的技术方案包括检测人巨细胞病毒的LAMP扩增用特异核酸引物组、一种人巨细胞病毒的检测方法和HCMV基因检测用试剂盒。
本发明检测人巨细胞病毒的LAMP扩增用特异核酸引物组,其特殊之处在于包含扩增人巨细胞病毒基因UL122特异碱基序列的正向内引物FIP、正向外引物F3、反向内引物BIP、反向外引物B3,以及第一环引物LF和/或第二环引物LB:
UL122-F3:CCGATCCTCTGAGAGTCTGC
UL122-B3:AGTGTCCTCCCGCTCCTC
UL122-FIP:GGGTGACACCAGAGAATCAGACCTAGTGTGGATGACCTACGG
UL122-BIP:CCGCGACTATCCCTCTGTCCT CCTCTTCCTCATCACTCTGC
UL122-LF:AGGCTACAATAGCCTCTTCCTC
UL122-LB:CTGAGAACAGTGATCAGGAAGAAA
所述引物与基因UL122的172077-172342bP位的核酸序列的一部分或其互补链互补。
本发明检测人巨细胞病毒的LAMP扩增用特异核酸引物组,其特殊之处还在于包含扩增人巨细胞病毒基因US14特异碱基序列的正向内引物FIP、正向外引物F3、反向内引物BIP、反向外引物B3,以及第一环引物LF和/或第二环引物LB:
US14-F3:TGTGATAGATTAGTGTTTCG
US14-B3:ACCTCCACACTTTTGAC
US14-FIP:GCTACATCGCCACCAAAAT-GTGGCGTAAAGTATCAGC
US14-BIP:GCACGTCTTGGAAAAGGAC-CTTCTACTTACACCTGGTTAC
US14-LF:ACGTCATCCGCAGCT
US14-LB:AGAGACACAGCAAAGTCT
所述引物与基因US14的172077-172342bP位的核酸序列的一部分或其互补链互补。
本发明一种人巨细胞病毒的检测方法,其特殊之处在于:
(Ⅰ)以人巨细胞病毒的UL122基因库登陆号:BK000394基因序列的172077-172342bP位的核酸序列的一部分或其互补链为靶,通过LAMP法用权利要求1所述的引物选择性扩增所述靶区域,确认是否存在扩增产物。
(Ⅱ)以人巨细胞病毒的US14基因库登陆号:BK000394基因序列的203423-203633 bP位的核酸序列的一部分或其互补链为靶,通过LAMP法用权利要求2所述的引物选择性扩增所述靶区域,确认是否存在扩增产物。
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