[发明专利]一种用于棉花品种真实性鉴定的DNA指纹检测方法有效
申请号: | 201010199362.X | 申请日: | 2010-06-09 |
公开(公告)号: | CN101824484A | 公开(公告)日: | 2010-09-08 |
发明(设计)人: | 匡猛;杨伟华;许红霞;王延琴;周大云;冯新爱 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院棉花研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;张庆敏 |
地址: | 455000 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 棉花 品种 真实性 鉴定 dna 指纹 检测 方法 | ||
1.一种用于棉花品种真实性鉴定的DNA指纹检测方法,其特征在于,使用分布于棉花全基因组26条染色体上的一套核心引物对待测品种进行检测,所述核心引物的核苷酸序列如下所示:
。
2.根据权利要求1所述的DNA指纹检测方法,其特征在于,包括提取待测品种的DNA、使用权利要求1所述26对核心引物进行SSR-PCR扩增、电泳和银染检测步骤。
3.根据权利要求2所述的DNA指纹检测方法,其特征在于,所述DNA提取包括以下步骤:将去壳棉种粉碎后,加入SDS提取液,漩涡充分后,65℃水浴;加入体积比依次为25∶24∶1的酚、氯仿和异戊醇的混合液,混匀,离心;取上清,加入浓度为10mg/mlRNase,水浴;抽提后离心取上清,加入异丙醇,待DNA成团析出后,用乙醇洗涤DNA沉淀,加入TE或ddH2O充分溶解DNA,备用。
4.根据权利要求2或3所述的DNA指纹检测方法,其特征在于,所述DNA提取包括以下步骤:将去壳棉种充分粉碎后,加入800μl SDS提取液,漩涡充分后,65℃水浴30min,间隔10min轻摇一次;加入等体积800μl体积比依次为25∶24∶1的酚、氯仿和异戊醇的混合液,混匀至不分层,10000rpm离心10min;取上清,加入浓度为10mg/ml的1μlRNase,37℃水浴30min;重复抽提一次后离心取上清,加入0.7倍体积异丙醇,待DNA成团析出后,70%乙醇洗涤DNA沉淀2次,加入 200μlTE或ddH2O充分溶解DNA,备用。
5.根据权利要求2所述的DNA指纹检测方法,其特征在于,所述SSR-PCR扩增反应体系,其中20μl反应液中包括:1.5mmol/L MgCl2,0.1mmol/L dNTP,1×Buffer,0.3μmol/L SSR引物,1U Taq DNA聚合酶,2μl DNA模板;反应程序为:95℃预变性2min,一个循环;94℃变性45s,55℃退火45s,72℃延伸2min,共30个循环;72℃延伸7min,一个循环;4℃保存待用。
6.根据权利要求2所述的DNA指纹检测方法,其特征在于,所述电泳步骤中,PCR扩增产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,恒功率80W电泳1h。
7.根据权利要求2所述的DNA指纹检测方法,其特征在于,所述银染检测包括以下步骤:用10%乙醇和0.5%冰醋酸组成的固定液固定10min;用双蒸水快速漂洗1次;用0.2%AgNO3溶液染色5min;用双蒸水快速漂洗1次;用3%NaOH和0.5%甲醛组成的显影液显影;用10%无水乙醇和0.5%冰醋酸组成的固定液定影。
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